Kortfrågor och flervalsfrågor Flashcards
Vilken del av den dubbelsträngade DNA-helixen binder vanligtvis transkriptionsfaktorer till?
Major Groove
Var i en gen hittar man oftast TATA-boxen?
25-30 nukleotider uppströms om transkriptionsstartplatsen
Ange ett strukturellt motiv som man kan hitta i DNA-domänen hos aktivatorer av transkription? [x3]
Helix-turn-helix.
Vad heter den DNA-sekvens till vilken en repressor binder?
Operator
Vad är mediatorns huvudsakliga uppgift?
Länkar de generella transkriptionsfaktorerna till de genspecifika transkriptionsfaktorerna som reglerar genuttryck.
Vad är och gör en insulator?
Det är DNA-sekvenser som delar in kromosomerna i oberoende domäner och motverkar enhancers från att verka på promotorer i närliggande domäner.
Vilken typ av RNA bildas då RNA-polymeras II transkriberar DNA? [x2]
mRNA
Vilken del av RNApol II fosforyleras av TFIIH vid initiering av transkription? [x3]
CTD-svansen
Vilken är den första modifikationen som sker på pre-mRNA?
5’-capping, dvs lägga till en 7-metylguanosincap i mRNA:ts 5’-ände.
Vad är spliceosomen uppbyggd av?
snRNA och proteiner (5 snRNA i komplex med snRNP).
Vad gör SR-proteiner? [x2]
Styr spliceosomen till korrekt splicesite och rekryterar U1 och U2.
Ge två exempel/varianter på alternativ splicing, dvs händelser som leder till förändrad bortklippning av intron.
Exonskipping, alternative splicesite.
Vad kallas det RNA som ligger före och efter open reading frame i ett mRNA?
5’-UTR före och 3’-UTR efter.
Hur kan proteinet IRE-BP (aconitas) påverka mRNA-stabilitet?
IRE-BP är vid låga järnkoncentrationer ett aktivt RNA-bindande protein, som stabiliserar mRNA och därigenom tillåter järnupptag. Vid höga järnkoncentrationer destabiliserar aktivt aconitas mRNA.
Vad gör P-bodies? [x3]
Decapping och degradering av mRNA.
Vilken aminosyra kodar startkodonet AUG för? [x2]
Metionin
Vilken initieringsfaktor för med sig initierings-tRNA till ribosomer?
eIF2.
→ Initieringsfaktorn eIF-2 byter ut sitt GDP mot ett GTP m.h.a. en kofaktor (guanine nucleotide exchange factor) som heter eIF-2B. När eIF-2 har GTP bundet kan det fånga upp Met-tRNA. Först därefter binder tertiärkomplexet bestående av eIF-2 + GTP + Met-tRNA till den lilla subenhheten. Även eIF-3 binder nu till den lilla subenheten, vilken därmed är därmed redo att binda till mRNA’t. (43S pre-initiation complex)
Vad kallas den mekanism som gör att ribosomen kan binda till mRNA-molekyler utan hjälp av initieringsfaktorer? [x2]
Internal recognition. [[Cap-independent initiation, t ex IRES.]]
Vilket enzym kopplar rätt aminosyra till rätt tRNA-molekyl?
Aminoacyl-tRNA-syntetaser
Vad utför aminoacyl-tRNA-syntetaser för funktion?
Kopplar rätt aminosyra till rätt tRNA.
Vad binder till stoppkodon i translationen?
eRF1 tillsammans med eRF3.
Vad har S6-kinaset för funktion? [x2]
Kontrollera translation genom att fosforylera det ribosomala proteinet S6.
Vad kännetecknar signalpeptiden för intransport i det endoplasmatiska rektiklet? [x2]
Det är en sekvens bestående av 5-10 hydrofoba aminosyror på N-terminalen.
Hur styrs syntesen av sekretoriska proteiner till det endoplasmatiska retiklets yta?
SRP binder till proteinets signalpeptid och guidar det till ER.