Technique PCR Flashcards

1
Q

C’est quoi une reaction en chaîne polymérases (PCR)

A

Beaucoup de copie de gene

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Q

C’est quoi la polymérase chain reaction

A

Amplifier rapidement une séquence spécifique ADN
Rapide et efficace
Génère nombreuse copies identiques ADN

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3
Q

C’est quoi les 3 étapes

A

Dénaturation
Hybridation
Élongation

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Q

C’est quoi la dénaturation

A

Haute température
95°C
Rompe liason H
Taq polymérase thermostable

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Q

A quelle température est fait l’hybridation

A

Basse température

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6
Q

A quelle température est fait l’élongation

A

Haute température

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7
Q

Vrai ou faux
Dénaturation de l’ADN, l’hybridation des amorces, élongation des amorces avec une polymérase ADN thermostable

A

Vrai

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8
Q

C’est quoi les 3 méthode de PCR

A

RT-PCR
QPCR
RT-qPCR

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9
Q

C’est quoi la rt-PCR

A

Reverse transcriptase
ARN convertie en ADN
Peut pas amplifier - converti ADN - PCR normal

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10
Q

C’est quoi la qPCR

A

Quantification acides nucléiques
Très sensible et spécifique
Basé sur fluorescence- pic sur graphique

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11
Q

C’est quoi la RT-qPCR

A

Temps reel
Transcriptase inverse
Quantification ADN en temps reel
2 techniques combined

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12
Q

C’est quoi les matériel nécessaire pour la PCR

A

Termocycler

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13
Q

C’est quoi un thermocycler

A

Bloc thermique

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14
Q

C’est quoi les méthodes de PCR qualitatif

A

Roche COBRA 4800 ou 6800)

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15
Q

Pourquoi utilise ton une lumière UV pour la PCR

A

Détruit amplification ADN si non peut avoir réplication à température piece qui peut contaminer autre échantillon et donner faux positifs

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16
Q

Vrai ou faux
La RT-PCR demande une incubation suplémentaire au début

17
Q

C’est quoi les amorces

A

Courte séquence ARN et ARN

18
Q

C’est quoi les caractéristiques des amorces

A

Connaître séquence qu’on veut amplifier
Amorces doivent être complémentaire des brins ADN existants
Amorces orientées dans le bon sens (5’ - 3’)
Longueur entre 20 et 30 pd

19
Q

Vrai ou faux

Amorce coutre prends moins de temps = augmente vitesse

20
Q

C’est quoi le mastermix

A

ADN polymérase taq
Tampon
Nucléotide libre
Amorces spécifique
Sondes

21
Q

C’est quoi l’ADN polymérase

A

Responsable pour réaction polymérase
Thermostable

22
Q

Quelle substance a besoins la polymérase

A

Magnésium

23
Q

Vrai ou faux
Les sondes sont fluorophore

24
Q

Vrai ou faux
On peut garder les contrôles a température de la piece

A

Faux

Garder au froid pour prévenir hybridation entre elle et l’activation non spécifique

25
C’est quoi la stringence
Ensemble de conditions expérimentales de température Ph Force ionique Permet l’hybridation moléculaire
26
Vrai ou faux Condition forte stringence = hybridation plus difficile = hybridation spécifique
Vrai
27
Comment est ce que la température affecte la stringence
Aspect le plus contrôlable
28
Si la température est plus haut que Tm qu’arrive t’il
Pas hybridation
29
Si la température est égale au Tm qu’arrive t’il
Hybridation spécifique
30
Si la température est plus bas que Tm qu’arrive t’il
Hybridation sur séquence complémentaire Non spécifique
31
C’est quoi les caractéristiques de la sonde
Tm est plus bas le plus court la sonde Réaction plus vite avec sonde courte
32
Comment est ce que la concentration de sel et pH affecte l’hybridation
Force ionique Ph alcalin favorise dissociation Ph acide peut dépuriner (brise ADN)
33
C’est quoi le role des contrôles interne
Confirme reaction arrive Utilise virus inoffensif pour l’humain
34
C’est quoi le contrôle négative
Spécimen négatif Tester en parallèle Prouve absence de contamination
35
C’est quoi le contrôle positif
Spécimen positif Assuré bon fonctionnement