Struktur der DNA Flashcards
Was ist ein Chromosom vom Namen her?
Farbkörper
Wie bilden sich unter den Basen der DNA Wasserstoffbrückenbindungen?
NH mit N
NH2 mit O
Welcher Farbstoff wird bei einem Karyogramm eingesetzt?
Giemsa-Färbung
Wie groß ist ein proteincodierendes Gen im Durchschnitt?
27000 bp
Wie groß ist ein Exon?
145 bp
Welchen Anteil haben Exons am Genom?
1,5%
Was ist Chromatin?
DNA + Proteine
Euk.: Histone
Prok.: keine Histone
Wie ist Chromatin aufgebaut?
2x H2A-H2B Dimere
H3-H4 Tetramere
pro 200 bp
-> 11nm
Wie sind Histone aufgebaut?
Histone Folds binden an die DNA (3 α-Helices), N-Termini ragen heraus
Wie ist die Verpackungsstufe über den Histonen?
30nm-Faser
verknüpft durch N-Termini
verknüpft mit Histon H1
Was ist die Struktur über der 30nm Faser?
Iambrush
Im Abstand von 50-200 kbp sind einzelne loops umgeben von stark kondensiertem Chromatin
Loops werden stark exprimiert
Nachweis mit 3C Methode
Welches Modell ist eine Alternative zum Iambrush-Modell?
Fractal globule Modell (5 Mbp)
Welche Organisationsstufen gibt es in Chromosmen?
- dsDNA
- Histone + dsDNA
- 30-nm Faser
- Iambrush
- Fractal globule
- mitotisches Chromosom
Welche Typen von Chromatin gibt es?
Heterochromatin & Euchromatin
- Proteine lösen Reader-Writer Komplexe aus
- Barrier stoppen Heterochromatinforumng
Welche Histonschwanzmodifikationen gibt es?
Acetylierung (weniger dicht)
Methylierung (dichter)
Phosphorylierung (weniger dicht)
Welche Histonvarianten gibt es?
H3.3 - Transkriptionsaktivierung CENP-A - Centromere H2AX - DNA-Reperatur H2AZ - Genexpression, Chromosomsegregation macroH2A - Transkriptionsrepression
Wie funktioniert die Centromerbildung?
Hefe - spezifische Sequenz, an die Kinteochore binden
Mensch - α-Sateliten DNA (171 bp), Neocontromer
Was ist Epigenetik?
Veränderungen im Genom, die bei gleichem Genotyp unterschiedlichen Phänotyp hervorrufen
Wie ist das Genom aufgebaut?
LINEs (20) SINEs (15) retrovirale Elemente (10) DNA-only Transposons (3) simple repeats (1) segementielle Duplikation (5) nicht-repetitive DNA (35) Introns (20) Exons (2)
Was ist Syntenie?
Konservierte Genreihenfolge zwischen zwei Organismen