Replikation Flashcards

1
Q

Wie ist die Syntheserichtung?

A

5’ nach 3’

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2
Q

Wie wird ein Primer gesetzt?

A

RNA-Polymerase

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3
Q

Wie werden die Okazakifragmente verknüpft?

A

durch eine Ligase

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4
Q

Welche Enzyme sind an der Replikation beteiligt?

A
DNA-Polymerasen
Clamp
Clamp-loader
Helicasen
Prinasen 
ssBindingProteins
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Q

Welche Typen von Topoisomerasen gibt es?

A

TPI: Einzelstrangbruch durch Tyrosin ohne ATP

TPII:Doppelstrangbruch, 2 ATP

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6
Q

Wie viele Replikationsstartpunkte gibt es?

A

Pro: 1 mit 1000 bp/s
Eu: 50000 mit 50 bp/s

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7
Q

Wie sind die Chromsomenenden geschützt?

A

T-Loops der repetitiven DNA und durch Shelterin

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8
Q

Wie funktioniert die Telomerase?

A
  1. RNA der Telomerase dient als Vorlage
  2. DNA-Polymerase

nicht aktiv in somatischen Zellen

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9
Q

Wie viele Fehler gibt es?

A

Polymerisierung: 1/10^5
Proofreading: 1/10^2
mismatch repair: 1/10^3
Gesamt: 1/10^10

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10
Q

Wie liest die Exonuklease Korrektur?

A

falsche bp werden 3’ nach 5’ korrigiert

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11
Q

Wie funktioniert der Strand directed mismatch repair?

A

MutS bindet an den mismatch
MutL sucht den nick im lagging strand
Strang wird entfernt und repariert
In E. coli zusätzlich mthyliertes Adenin

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12
Q

Welche Positionen sind für Mutationen anfällig?

A

Hydrolyse:Phosphor, Bindungen zu NH2, N-Glycosidische Bindung

Oxidation:3’ zu 4’ Ribose, Doppelbindung ganz rechts, CH rechts

Methylierung:freier Stickstoff, Thymin NH

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13
Q

Welchen Effekt haben Desaminierungen?

A

A->Hypoxanthin
G->Xanthin
C->Uracil
MethylC->T

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14
Q

Welches Enzym erkennt falsche Basen?

A

DNA-Glycosylase

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15
Q

Welche Effekte haben Strahlung?

A

Rad.: Doppelstrangbruch

UV-S.: Pyrmidin-Dimere

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16
Q

Welche Reperaturmechanismen gibt es?

A
  1. Base excision repair: Glycosylase, Endonuclese, PDE, Ligase
  2. Nucleotide excision repair: Excision nuclease, Helicase, DNAP, Ligase
  3. nonhomolougs end joining
  4. homologous recombination