Structure moléculaire des récepteurs Flashcards
Nommer 6 acides aminés hydrophobes.
- Alanine
- Valine
- Leucine
- Isoleucine
- Méthionine
- Proline
(PLAVIM)
Nommer 4 acides aminés polaires.
- Sérine
- Thréonine
- Asparagine
- Glutamine
Que veut-on dire par : la liaison peptidique est planaire?
Hybridation Sp2, pas de rotation possible.
Qu’est-ce qu’est un angle dièdre?
Angle de rotation nécessaire pour amener un vecteur à être colinéaire avec un autre vecteur.
Quelles sont les 2 façons que des liaisons peptidiques peuvent se réorienter autour des carbones alpha?
- Perpendiculaire à la propagation du squelette (feuillets bêta)
- Colinéaire (hélice alpha)
Pour obtenir une hélice alpha, l’angle ψ (psi) et l’angle ϕ (phi) doivent-ils être positifs ou négatifs?
Les 2 négatifs.
Pour obtenir un feuillet bêta, l’angle ψ (psi) et l’angle ϕ (phi) doivent-ils être positifs ou négatifs?
ψ positif
ϕ négatif
Combien de résidus a-t-il dans un tour d’hélice alpha? Et quelle est la mesure d’un résidu en Ångström?
- 3.6 résidus par tous
- 1.5 Å par résidu
Dans une hélice alpha, le NH se lie avec quel atome? À quelle distance?
Au CO qui est 4 résidus plus loin.
Quelle particularité permet aux hélices alpha de passer à travers la membrane cellulaire?
Résidus hydrophiles protégés à l’intérieur de l’hélice.
Le plan peptidique d’une hélice alpha est-il parallèle ou perpendiculaire à la propagation?
Parallèle
Le plan peptidique d’un feuillet bêta est-il parallèle ou perpendiculaire à la propagation?
Perpendiculaire
Qu’est-ce qui permet d’avoir des feuillets bêta anti-parallèles?
Proline en bout qui permet de faire des demi-tours dans la protéine.
De quoi est fait la partie transmembranaire des récepteurs à tyrosine-kinase?
Hélices alpha.
Les domaines SH3 sont spécialisés dans la reconnaissance de quel acide aminé?
Les prolines
Quel est le rôle de la protéine Ras?
GTPase qui hydrolyse le GTP en GDP.
La forme active d’une GTPase comme Ras possède-t-elle un GTP ou un GDP?
Un GTP.
Quelle protéine permet d’accélérer l’inactivation de Ras? Comment?
La protéine GAP en accélérant l’hydrolyse du GTP en GDP.
Quel est le rôle de GEF pour les protéines Ras? Comment?
Accélérer l’échange du GDP en GTP. Maintien la protéine RAS ouverte, laisse diffuser le GDP hors du site de liaison. Puisqu’il y a 10x plus de GTP que de GDP, 10x plus de chances que le GTP remplace : molécule devient active.
Comment se nomme la GEF de Ras?
SOS (Son Of the Sevenless)
Décrire les étapes menant à l’activation d’une adénylate cyclase par une protéine Gs. (4)
- Hormone se lie à une protéine Gs
- Changement conformationnel
- Notion de GEF : GDP se dissocie, GTP s’associe
- Dissociation de la sous-unité alpha Cette sous-unité active l’adénylate cyclase pour faire de l’AMPc.
