Structure des protéines Flashcards
Fonctions des protéines
Enzymes Récepteurs Hormones (insuline) Cascade de signalisation Transport (hémoglobine)
Conformation des polymères d’acides aminés
Tridimensionnels, flexibles et mobiles dans l’espace
Changements de conformation des protéines
Mouvement brownien
Molécules énergétiques
Étapes de la marche de la kinésine
Conformation initiale
Liaison ATP
Hydrolyse
Relâchement de l’ADP et retour à la conformation initiale
Structure d’un acide aminé
Carbone alpha Chaine R H Amine Acide carboxylique
Types de chaînes latérales
Polaires chargées (hydrophiles) + (base) - (acide)
Polaires non chargés (hydrophiles) qui peuent former des ponts hydrogène
Apolaire (hydrophobe)
Représentation des acides aminés
Amine à gauche et carboxyle à droite.
Ainsi on ajoute toujours l’amine au carboxyle
Structure d’une protéine qui ne fait pas de rotation
Lien peptidique
Point de rotation d’une protéine
Autour du carbone alpha
Définition de résidu
Chaîne latérale de l’acide aminé
Facteurs déterminant la structure des protéines
Chaines latérales et leur séquence
Des liens chimiques faibles entre les résidus déterminent le repliement de la protéine et maintiennent la structure de la protéine
Liaisons chimiques faibles
Forces de Van der Waals
Ponts hydrogène
Liens ioniques
Interactions hydrophobes
Définition de force de Van der Waals
Équilibre entre attraction et répulsion entre deux atomes situés à très courte distance l’un de l’autre
Définition de ponts hydrogène
Liaison entre H et deux atomes électronégatifs souvent O et N)
Définition d’un pont salin
Interaction entre les charges positives et négatives de deux résidus d’acides aminés porteurs de charges opposées