Structure des protéines Flashcards

1
Q

Fonctions des protéines

A
Enzymes
Récepteurs
Hormones (insuline)
Cascade de signalisation
Transport (hémoglobine)
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Q

Conformation des polymères d’acides aminés

A

Tridimensionnels, flexibles et mobiles dans l’espace

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3
Q

Changements de conformation des protéines

A

Mouvement brownien

Molécules énergétiques

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4
Q

Étapes de la marche de la kinésine

A

Conformation initiale
Liaison ATP
Hydrolyse
Relâchement de l’ADP et retour à la conformation initiale

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5
Q

Structure d’un acide aminé

A
Carbone alpha
Chaine R
H
Amine
Acide carboxylique
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6
Q

Types de chaînes latérales

A

Polaires chargées (hydrophiles) + (base) - (acide)

Polaires non chargés (hydrophiles) qui peuent former des ponts hydrogène

Apolaire (hydrophobe)

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7
Q

Représentation des acides aminés

A

Amine à gauche et carboxyle à droite.

Ainsi on ajoute toujours l’amine au carboxyle

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8
Q

Structure d’une protéine qui ne fait pas de rotation

A

Lien peptidique

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9
Q

Point de rotation d’une protéine

A

Autour du carbone alpha

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10
Q

Définition de résidu

A

Chaîne latérale de l’acide aminé

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11
Q

Facteurs déterminant la structure des protéines

A

Chaines latérales et leur séquence

Des liens chimiques faibles entre les résidus déterminent le repliement de la protéine et maintiennent la structure de la protéine

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12
Q

Liaisons chimiques faibles

A

Forces de Van der Waals
Ponts hydrogène
Liens ioniques
Interactions hydrophobes

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13
Q

Définition de force de Van der Waals

A

Équilibre entre attraction et répulsion entre deux atomes situés à très courte distance l’un de l’autre

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14
Q

Définition de ponts hydrogène

A

Liaison entre H et deux atomes électronégatifs souvent O et N)

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15
Q

Définition d’un pont salin

A

Interaction entre les charges positives et négatives de deux résidus d’acides aminés porteurs de charges opposées

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16
Q

Définition des interactions hydrophobes

A

Se forment par répulsion, soit pour atteindre l’énergie minimale en diminuant la surface hydrophobe exposée à l’eau

17
Q

Effet des interactions hydrophobes sur la conformation de la molécule

A

Les chaînes polaires se retrouvent en périphérie de la molécule, alors que les chaînes apolaires se retrouvent au centre de la molécule

18
Q

Rôle des ponts disulfure

A

Liaison chimique forte impliquée dans la stabilisation de la structure 3D plus stable des protéines

19
Q

Protéines particulièrement stabilisées par les ponts disulfure

A

Protéines extracellulaires

20
Q

Types de structure secondaire

A

Hélice alpha et feuillets bêta

21
Q

Cause de la formation d’hélice alpha

A

Formation de ponts hydrogène entre les CO et NH du squelette polypeptidique

21
Q

Caractéristiques de l’hélice alpha

A

Un pont H toutes les 4 liaisons peptidiques

3-6 acides aminés par tour d’hélice

21
Q

Caractéristiques des feuillets bêta

A

Boucles avec filaments antiparallèles

Boucle avec filaments parallèles

21
Q

Définition de structure primaire

A

Séquence d’acides aminés de la protéine

22
Q

Définition de structure tertiaire

A

Organisation dans l’espace des structures secondaires entre elles

23
Q

Région pouvant se replier indépendamment du reste de la protéine pour effectuer une fonction

A

Domaine protéique

24
Q

Caractéristiques de la structure quaternaire

A

Assemblage de plusieurs sous-unités protéiques

Seulement certaines protéines ont une structure quaternaire, comme hémoglobine

25
Q

Types de structures quaternaires

A

Homodimère et hétérodimères

Homotétramère et hétérotétramères

26
Q

Conformations quaternaires

A

Dimère
Filament hélicoidal
Anneau