Structure ARN Flashcards
VRAI ou FAUX
Les ARN sont classés en fonction de leur protéine
VRAI
- codants
- non codants
La fonction de l’ARN non-codant ne dépend pas de la _______
protéine
Quel type d’ARN est le plus présent dans une cellule au niveau de la masse de celle-ci ?
a) IncRNA
b) tRNA
c)rRNA
C
[ARN ribosomal]
Quel type d’ARN est le plus présent dans une cellule ?
a) IncRNA
b) tRNA
c)rRNA
B
[ARN de transfert]
La structure de l’ARN est souvent: …
- monocaténaire
- bicaténaire
Monocaténaire
En quoi les bases azotées modifiées jouent un rôle important pour l’ARN ?
Permettent augmenter diversité structurale au dessus des 4 nucléotides classiques
VRAI ou FAUX
ARN est le messager entre l’ADN et la protéine
VRAI
- ARN messager/ transcription
Cech et Altman ont découvert que toutes les enzymes sont des _______
protéines
Définition de la transcription
processus par lequel l’information de l’ADN est communiquée ARN par l’ARN —–> prot
3 classes de molécules d’ARN
ARN
1- t : apporte acide aminés à la machinerie de traduction
2- r : occupe la plus grande partie du ribosome
3- m : séquence complémentaire à un des brins d’ADN qui est traduit au niveau des ribosomes en protéine
L’ARN ________ catalyse la synthèse de l’ARN
polymérase
VRAI ou FAUX
La synthèse de l’ARN est très similaire à celle de l’ADN
VRAI
–> Or, pas besoin d’amorce
Défintion de promoteur
Région de l’ADN où s’amorce la transcription
relier chaque être vivant à son promoteur
1- élément σ 1- bactéries
2- Opéron 2- Eucaryote
3- Facteurs généraux de transcription
bactérie :élément σ, opéron
Eucaryote : facteurs généraux de transcription (chaque gene possède son promoteur)
Chez les bactéries il y a un unique ________ pour toutes, il donne un long ARN messager qui contient séquences pour chacune des _______
promoteur
enzymes
Chez les eucaryotes, chaque gène porte un ______ , et vont tous donner un ARN ________ individuel (pour produire prot de synthèse tryptophane)
Promoteur
messager
Chez les procaryotes il y a 3 régions consensus du promoteur
-35
-10
- début transcription (+1)
Région plus connue des régions de consensus chez eucaryotes
TATA box
[équivalent région -10 chez procaryotes]
à quoi servent les régions consensus des promoteurs
Comme sites de reconnaissances pour les facteurs qui recrutent l’ARN polymérase
Chex les bactéries, c’est le__________ qui reconnaît les régions -35 et -10 du promoteur
facteur sigma
[définit site de l’initiation de la transcription + spécificité de la liaison à l’ADN par l’ARN polymérase]
2 types de rôle de l’ADN
- comment faire protéines via ARN messager
- comment synthétiser ARN messager + réguler son expression
L’ADN eucaryote est replié dans la ______
chromatine
Processus de transcription des eucaryotes
1- remodelage de la chromatine
2- Recrutement du médiateur
3- Recrutement de facteurs généraux de la transcription de l’ARN polymérase
Le remodelage de la chromatine sert à rendre des……
séquences d’ADN plus accessibles à la transcription
–> contient modification des histones
–> ouvre chromatine et expose région du promoteur (contient ATPS)
Que détermine le code des histones ?
la liaison de différentes facteurs à la chromatine et sa conformation ouverte ou fermée
Les ______ aident à décondenser la chromatine en ajoutant des groupements acétyles sur la chaîne latérale des Lysines
HAT
–> histones acétyltransférases
Le médiateur de la transcription recrute la _______ en réponse aux facteurs de _______
- Pol II
- Transcription
VRAI ou FAUX
TFII-I eucaryote est équivalent de facteur sigma bactérien
VRAI
La protéine TBP est la sous-unité de _____ qui lie le TATA box (ADN)
TFIID
Quelle est la protéine la + grande de TFIID
TAF1
–> activité kinase + ubiquitine ligase qui vont contribuer à la régulation de l’initiation de la transcription
Qu’est que le bromodomaine ?
lie les histones acétylés
Rôle complexe facteur TFIIH
–>contribue à la formation de la bulle de transcription par son activité hélicase
VRAI ou FAUX
Eubactéries aident l’ARN polymérase à lier le promoteur
VRAI
L’ARN est polymérisé sur le brin
a) matriciel
b) codant
a) matriciel
La “pince de crabe” piège _______ pendant ________ pour garantir processivité de l’ARN polymérase
- ADN
- Élongation
VRAI ou FAUX
La taille de la bulle de transcription et l’hybride ADN-ARN demeurent constants
VRAI
- 14 nucléotides
- 9 nucléotides
VRAI ou FAUX
L’ARN polymérase peut corriger des erreurs de transcription
VRAI
–> recule dans canal utilisé par nucléotides et retranche ceux qui sont mésappariés
Type + fréquent de terminaison chez les bactéries
-> paires de bases instables (AU) = déstabilisation hybride ARN/ADN
–> formation de structures secondaires dans ARN nouvellement transcrit
Type + fréquent de terminaison chez E.Coli
RHO dépendante
—> hélicase RHO monte jusqu’à hybride ARN-ADN et le déstabiliser pour permettre dislocation du complexe d’élongation
ARN polymérase utilise (énergie)
- ATP
- GTP
- CTP
- UTP
La cellule peut utiliser le lactose comme source d’énergie à l’aide de la β-galactosidase qui converti le lactose en…..
a) glucose et galactose
b) allolactose
c) les 2 réponses sont correctes
C
–> 50% du lactose est converti en Allolactose
VRAI ou FAUX
la β- est une enzyme juste en présence d’une grande quantité de lactose
VRAI
–> régulé au niveau de la transcription
VRAI ou FAUX
Quand du lactose est disponible comme source de carbone, il est en totalité transformé en allolactose
FAUX
–> Ce n’est qu’une partie de ce dernier (50%)
VRAI ou FAUX
L’activation du répresseur permet à l’ARN polymérase de continuer à transcrire l’opéron
FAUX
–> L’INACTIVATION le permet
VRAI ou FAUX
La fixation du répresseur LacI empêche l’ARN polymérase de s’attacher au promoteur
FAUX
–> il empêche à l’enzyme de démarrer sa transcription
LacI est un ____mère
TETRA
Quand le tétramère LacI lie deux sites operator, le séquence entre les deux sites de laison forme une boucle ______
PMID
VRAI ou FAUX
les activateurs et répresseurs agissent toujours de la même façon et l’un ou l’autre
FAUX
–> ils peuvent agir en combinaison
En présence de _____, CRP/CAP n’est pas actif mais les répresseurs non plus
a) glucose
b) lactose
c) Les deux
c
En présence de glucose mais pas de lactose :
a) CRP/CAP actif mais le répresseur est inactif
c) Le répresseur est actif mais CRP/CAP sont inactifs
A
–> donc crp et cap actifs en présence de lactose
–> répresseur inactif en présence de lactose
2 type de contrôle de la transcription des gènes
- Activateurs : peuvent accélérer transcription à partir de promoteurs peu puissants
- Répresseurs : peuvent freiner la transcription
Comment s’y prennent les répresseurs pour freiner la transcription ? (2 façons)
1-empêcher ARN polymérase d’atteindre le promoteur
2- Inhiber réactions d’initiation [isomération ou empêcher enzyme de quitter promoteur]
Comment prédire le phénotype d’une bactérie mutante de l’opérateur / lac I
- Expression des gènes en tout temps, sans prendre en compte la présence ou l’absence de lactose
Les deux DOMAINES spécifiques des facteurs de transcription
1- domaine de liaison à l’ADN
2- domaine de transcription
VRAI ou FAUX
La chromatine cache la région du promoteur de l’ADN à l’ARN polymérase
VRAI
2 types de facteurs de transcription [décident si gène est exprimé ou pas “régulateurs”]
1- constitutifs ; vont permettre l’expression des gènes desquels on a besoin tout le temps
2- régulateurs ; protéine nécessaire à l’initiation ou la régulation de la transcription des gènes
Chaque FT (facteur de transcription) lie de façon spécifique une séquence consensus qui constitue son ________
Élément de réponse
Élément de réponse, défintion
Site de fixation initial des FT qui recrutent les médiateurs, facteurs généraux et l’ARN polymérase
Les éléments de réponse sont généralement situés _______ du promoteur
a) en arrière
b) en avant
B
VRAI ou FAUX
Les éléments de réponse peuvent agir relativement à distance du promoteur
VRAI
Est que les facteurs de transcription peuvent empêcher le développement des gènes ?
OUI
VRAI ou FAUX
Un facteur de transcription peut réguler l’expression de milliers de gènes qui portent tous les éléments de réponse correspondant
VRAI
Quels FT contrôle organisation de l’embryon et de l’identité de plusieurs organes au sein de l’organisme
a) LacI
b) homéodomaine
c) GATA1
B (gène OX)
–> souvent impliquées dans la deter. de l’identité des différents segments corporels
Déf : amplificateur eucaryote
séquences d’ADN qui augmentent la transcription qui peuvent agir à distance du promoteur, soit en amont ou en aval
VRAI ou FAUX
Pour la majorité des gènes, plus d’un facteur de transcription est nécessaire pour son expression
VRAI
De quoi est constitué l’amplificateur
- environ une 100 de ntd
- plusieurs éléments de réponse
Si des différents facteurs de transcription possèdent une liaison coopérative, cela veut dire que la liaison d’un ________ augment l’_______ pour un autre
- facteur
- affinité
Lequel des 2 est responsable d’enlever l’effet répresseur des histones / les modifier :
a) Coactivateurs
b) Corépresseurs
A
-> justement ce sont des activateurs
Les corépresseurs modifient la ________ car rôle inverse aux coactivateurs
chromatine
Les séquences régulatrices sont une partie de L’ADN :
a) codant
b) non-codant
codant
Parmi ces éléments, que font les facteurs de transcription ?
a- Ils se fixent de façon spécifique à des éléments de réponse
b- Ils se fixent toujours à des éléments de réponse proche du promoteur
c- Ils induisent la formation d’une boucle de l’ADN entre les séquences régulatrices et le promoteur
- a et b
- b et c
- a et c
A et B
À l’aide de quoi un organisme pluricellulaire peut-il produire plusieurs types cellulaires ?
a- Des facteurs de transcription spécifiques à chaque type cellulaire
b- Des ARN polymérase spécifiques à chaque type cellulaire
c- D’un mécanisme qui sort les gènes selon le type cellulaire
A
Ensemble de modifications nécessaires à la maturation de l’ARN (3)
1- soustraction de nucléotides aux transcrits primaires d’ARN
2- L’addition de séquences ntd non codées par le gène correspondant
3- modification covalente de certaines bases
VRAI ou FAUX
Chez les procaryotes
transcription primaire ARN est traduite tel quel
VRAI
==> traduction commence avant fin transcription
VRAI ou FAUX
Chez les eucaryotes, la transcription et la traduction se passent dans le même compartiment cellulaire
FAUX,
- noyau
- cytoplasme
Les _______ nucléaires qui traversent la membrane du noyau sont les portes de sortie de l’ARN ______
- pores
- messager
Quand commence la formation de la coiffe chez l’ARN
dè qu’il émerge de la pol II
À quoi sert “la coiffe” chez l’ARN
- transforme précurseur d’ARN en substrat pour d’autres enzymes nucléaires
- chez ARNm définitif, à encrer ribosomes en vue de la synthèse protéique
Modification de l’extrémité __’ et __’ lors de la maturation de l’ARNm eucaryote
3 –> peut ajouter jusqu’à 250 nucléotides pour constituer queue poly-A
5
Comment se protège l’ARNm de d’une dégradation à partir de l’extrémité 3’ ?
queues poly-A d’ARN mature + queues poly-A précurseurs s’associent à une protéine PABP
La transcription se termine quand _______ fait collision avec _______ (qui arrive après clivage)
ANR pol II
Rat 1
Existe-t-il des ARNm eucaryotes sans queue poly-A
oui
Quel énoncé décrit la coiffe (cap) ? :
a) Guanine modifié attaché àl’extrémité 3’ de l’ARN transcrit.
b) Guanine modifié attaché àl’extrémité 5’ de l’ARN transcrit
c) Une série des adénines attachés àl’extrémité 3’ de l’ARN transcrit.
d)Une protéine attachée àl’ARN qui ressemble une casquette de baseball
B
Ils sont à la fois dans le transcrit primaire d’ARN et dans la molécule d’ARN mature eucaryotes :
a) Introns
b) exons
B
–> les introns sont les sections non codantes, enlevés lors de formation lariat
Définition sites d’épissage
séquences consensus qui se trouvent aux extrémités 5’ e 3’ des introns
–> enlève les introns, souvent dégradé
–> adénosine y a un rôle primordial
Par quoi est catalysé le processus d’épissage ?
Spliceosome
–> chaque petite ribonucléoprotéine se désassemble de ce dernier afin de compléter sa fonction (5 en tout)
Définition épissage altérnatif
- exons de l’ARNm ciblés en vue de leur élimination qui, suivant diverses combinaisons, mèneront à création réseau ARNm varié (subi par au moins 70%) de nos gènes
Où est situé le résidu A du site de branchement qui participe à la formation du lariat?
a) Exon
b) Intron
c) Promoteur
B
Pendant l’épissage la première réaction chimique est:
1- L’addition d’un groupement hydroxyle à la position 2’ du nucléotide dans le point de branchement
2- Le clivage de la liaison phosphodiester entre l’exon et l’intron en 5’ par une endonucléase
3- La transesterification qui produit une liaison 5’-2’ phosphodiester entre l’extrémité 5’ de l’intron et le site de branchement.
1
Quelle est l’enzyme responsable de la synthèse de l’ARN ribosomique :
ARN polymérase I
Où se passe la transcription de l’ADN ribosomique
Nucléoles
Le facteur UBF se lie
l’élément du command en amont, _______, afin de contrôler la transcription par la pol I
UCE
L’ARN polymérase III est responsable de la synthèse d’_______ et d’_________
- ARNt
- ARNr 5S
Les régions de commande de la transcription des gènes ARNt siègent au sein de la séquence transcrite :
Boites ____et_____
- A
- B
–> TFIIIC se lie à es boîtes du promoteur et TFIIIB arrive ensuite et recrute ARN pol IIII
VRAI ou FAUX
TBP fait partie des facteurs généraux de la pol I
VRAI
Quelle quantité représente les ARN codants
a) 2%
b) 68%
c) 10%
2%
–> minorité mais jouent grand rôle (ex : épissage)
Propriété ribozymes
ARN qui possèdent la capacité de catalyser une réaction chimique spécifique
“Autoépissage”
L’ARN catalyse toutes les réactions d’épissage
Interférence d’ARN : inhibition de l’expression des ARN par des petits ARN interférents comme… (4)
- RNAi
- siRNA
-miRNA
-piRNA
VRAI ou FAUX
Nous pouvons désigner un siRNA contre n’importe quel ARNm
VRAI
avec ARNm miARN ne coupe pas les cibles mais ______ leur traduction
inhibe
–> contrairement à siARN
–> capacité à réprimer complètement l’expression d’un gène est plus faible
CRISPR
séquences d’ADN répétitives, type de “mémoire” d’une cellule, “système immunitaire”, capable de garder la mémoire d’une agression par un virus ou séquence ADN étrangère
