RNA Flashcards

1
Q

Was ist kanonische Basenpaarung?

A

GC- 3 Wasserstoffbrücken

AU - 2 Wasserstoffbrücken

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2
Q

Was ist die GU-Bindung?

A

nicht kanonisch, “wobble”

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3
Q

Nenne vier Arten von RNA

A

mRNA, tRNA, rRNA, siRNA, miRNA

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4
Q

Was ist mRNA?

A

messenger RNA: einzelsträngig, Transkript eines DNA-Teilabschnittes, das Informationen von DNA zu Ribosom vermittelt

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5
Q

Was ist tRNA?

A

transfer RNA: ist für die Erkennung eines spezifischen Codons zuständig und stellt die zugehörige Aminosäure zur Verfügung

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6
Q

Wie nennt man die Tertiärstruktur von tRNA?

A

compact L shape

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7
Q

Wodurch wird die Tertiärstruktur von RNA oder Proteinen vorgegeben?

A

durch die Primärsequenz

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8
Q

Was ist lncRNA?

A

long non-coding RNA: nicht-Protein-codierende RNA, die mehr als 200 Basen lang ist (regulatorische Funktion durch Bindung an Proteine oder DNA)

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9
Q

Was ist das Hammerhead ribozyme HH9?

A

RNA-Molekül, das reversible Spaltungs- und Bindungs-Reaktionen katalaysiert (wird dabei selbst abgebaut)

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10
Q

Was ist siRNA?

A

small interfering RNA: kurze einzel- oder doppelsträngige RNA-Moleküle, 20-25 bp: verbinden sich mit komplementären RNAs, wodurch sie deren normale Funktion unterbinden

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11
Q

Was ist RNA-Interferenz bei Eukaryoten?

A

siRNAs, die die Expression von Genen und damit die Replikation von Viren stoppen

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12
Q

Was ist miRNA?

A

post-transkriptionelle Regulation der Genexpression durch Bindung an mRNA, welche daraufhin nicht mehr vom Ribosom translatiert werden kann

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13
Q

Wie ist die Struktur von miRNA?

A

exakt komplementär zu mRNA in Pflanzen, annähernd in Tieren; sehr gut konserviert (Sequenz und Struktur), höhere Diversität in Pflanzen

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14
Q

Wo hat miRNA bekannntermaßen Einflüsse?

A

Wachstumsprozesse, Stressantwort, Osteosarkom (Knochentumor), Darmkrebs, Arteriosklerose

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15
Q

Was gibt es alles für Strukturelemente bei RNA?

A

single strand, stems/stacks, Bulge-Loop/multi-Loop, Loop

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16
Q

Welche Methoden der Strukturvorhersage von RNA gibt es?

A
  • Zerschneiden und Kristallisieren (wie bei Proteinen: X-ray-Kristallographie, Raman)
  • Alignieren der Sequenz zu sich selbst
17
Q

Wie kann eine RNA-Struktur beschrieben werden?

A
  • Dot-bracket
  • Dot-plot (anders als bei Alignment)
  • planare Sekundärstrukturdarstellung
  • “Arc-representation”
18
Q

Was sind Algorithmen zur RNA-Strukturvorhersage?

A

mfold/UNAfold, RNAstructure, ViennaRNA, NUPACK