régulation de la synthèse protéique Flashcards
la régulation de la traduction d’un ARNm se fait de quelles façon?
- Contrôle de la localisation des ARNm
- Contrôle de l’accès aux facteurs de traduction
- Contrôle de la stabilité des ARNm
Nommes les possibles utilisation du 3’UTR comme controle de traduction d’ARNm.
impliqués dans le contrôle de la traduction par différents mécanismes : localisation, déstabilisation et l’inhibition directe.
ex: la protéine ZBP1 se lie au 3’UTR. Cette liaison empêche l’interaction des sous-unités ribosomales et inhibe la traduction.
Vrai ou faux: la traduction d’un ARNm peut être influencée par la structure secondaire de l’ARN et par l’entrave stérique.
vrai
Connaître le mécanisme par lequel l’aconitase (IRE-BP) contrôle la traduction des ARNm de ferritine
et le récepteur de transferrine. Comprendre le rôle des ARE dans la stabilité des ARNm.
en quantité abondante de fer, IRE-Bp est lier et est inactive.
En quantité faible de fer, l’IRE-BP est libre et se fixe sur l’ARNm avant la région codante. cette liaison empêche la traduction donc pas de férine donc pas de stockahe du fer.
les ARE sont proche des IRE. S’ils ne sont pas lier au IRE-BP, les ARE sont libre et dégrade le reste de l’ARNm. Si les IRE-BP sont lier, on bloque les ARE donc stabilisation et traduction des ARNm
quelle est l’importance de la queue Poly-A dans la traduction et la stabilité des ARNm.
Les processus d’initiation, élongation, terminaison et réinitiation se produisent
tous en même temps sur les polyribosomes.
La protéine PABP (poly A binding proteins) protège les ARNm contre la
dégradation.
Comprendre comment le profilage des polyribosomes ainsi que le Ribo-Seq peuvent être utilisés pour
étudier la traduction.
- on prend les ribosomes sur les ARNm et on enlève les ribosomes.
- on séquence les ARNm
-on détermine la position de ce reads dans le génome, ce qui permet de savoir qu’elle partie du génome est lier a un ribosome, si un ARNm est activement traduit et identifier des new ORF.
Connaître les séries d’événements nécessaires à l’initiation de la traduction comme discuté en classe.
- Formation du complexe ternaire (eIF2●GTP plus Met-tRNAi)
- Association de la sous-unité 40S avec eIF3 et eIF1/eIF1A, suivi par le recrutement d’un complexe ternaire donne un complexe de préinitiation 43S
- Activation d’un ARNm par association avec le complexe de liaison à la coiffe, eIF4F
(eIF4G – échafaud; eIF4A – hélicase; eIF4B – interagit avec l’ARNr 18S et coopère avec 4A; eIF4E – interagit avec la coiffe) et des PABP - Association du complexe de préinitiation 43S avec un complexe ARNm-eIF4
- Glissement et reconnaissance de l’AUG
- Lors de la fixation du Met-tRNAi au codon AUG le complexe doit être démonté. Ceci se
fait en activant l’activité GTPase de eIF2 par son GAP, eIF5 (eIF5 = eIF2-GAP), ce qui change la conformation du complexe qui est maintenant connu comme le complexe d’initiation 48S - Association de la sous-unité 60S plus eIF5B et dissociation de la plupart des autres eIFs.
- Formation du ribosome complet active l’activité GTPase de eIF5B → dissociation de eIF5B et eIF1A → le complexe d’initiation 80S est prêt à traduire.
Connaître le rôle d’eIF2 dans l’initiation de la traduction, et les interactions de cette GTPase avec son
GAP et son GEF.
nécessaire à l’initiation de la traduction. Ce facteur lie
le Met-tRNAi (complexe ternaire) et lui permet de s’intégrer dans le complexe
de préinitiation 43S.
Lors de la fixation du Met-tRNAi au codon AUG le complexe doit être démonté. Ceci se fait en activant l’activité GTPase de eIF2 par son GAP,
eIF5 (eIF5 = eIF2-GAP).
Pour être recyclée, eIF2 a besoin d’un
GEF : eIF2B (eIF2B = eIF2-GEF).
Savoir comment eIF2 est régulée par PKR et PERK, et la signification biologique de cette régulation.
- Une accumulation de protéines dépliées
amène à une séquestration de BiP. - En l’absence d’interaction avec BiP, PERK dimérise et devient une kinase active.
- PERK phosphoryle le facteur eIF2.
- La traduction est globalement inhibée.
- La protéine ATF4 (normalement réprimée au
niveau de la traduction) est traduite. - Activation de gènes codant des protéines
impliquées dans le ERAF, la réponse au stress
comment mTOR affecte la traduction et comment mTOR est régulée.
-mTOR est régulée par la GTPase monomérique Rheb.
-TSC1/TSC2 est contrôlé par des voies de signalisation. Exemple, les facteurs de croissance causent la phosphorylation des sites inhibiteurs, ce qui entrave son activité GAP. Moins d’activité GAP : → plus de RhebGTP→ plus de mTORC active → plus de traduction.
la dégradation de l’ARNm peut débuter par quelles évènements?
le decapping, le raccourcissement de la
queue Poly-A (désadénylation) ou par le clivage endonucléolytique.
Savoir ce que sont les PB et les Stress Granules et leur importance dans la répression et/ou
dégradation des ARN.
Les ARNm inhibés ne sont pas nécessairement dégradés. Ils peuvent être gardés dans les Processing Bodies (P-bodies ou PB)
ou dans les granules de stress, et libérés plus tard, sous des conditions plus propices.
Ce phénomène peut permettre aux cellules de récupérer plus rapidement.
Savoir la différence entre les siRNAs et les miRNAs, leurs provenances et fonctions.
(miRNAs) : petits ARNs qui proviennent d’une molécule précurseur endogène. L’homologie entre miRNA et la cible est imparfaite (chez les animaux) – mène à l’inhibition de la traduction des ARNm cibles.
(siRNAs) : petits ARNs qui proviennent normalement
de deux molécules d’ARN complémentaires. L’homologie entre siRNA et la cible est parfaite – mène au clivage des ARN cibles.
Connaître le lien entre les miRNAs et les P-bodies. Facteurs clés : Dicer, Argonaute, GW182, XRNs,
DCPs.
Comprendre les mécanismes de traduction coiffe-dépendant et coiffe-indépendant, comme discuté
en classe (i.e. IRES).
