Reazioni catalizzate da enzimi Flashcards
Aconitasi
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Alcol deidrogenasi
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RNAsi A
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NAD+ (struttura)
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NADP+ (structure)
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Prolina racemasi
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Pirrolo-2-carbossilato
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1-pirrolina-2-carbossilato
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Diisopropilfosfofluridato (DIPF)
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Meccanismo di catalisi chimotripsina
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Catalasi
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Classi di enzimi
- Ossidoreduttasi
- Liasi
- Idrolasi
- Transferasi
- Isomerasi
- Ligasi
Come interagisce l’enzima con il substrato?
Adattamento indotto
Modello chiave e serratura
Complementarietà geometrica
Complementarietà elettronica
Qual è il ruolo dell’aconitasi?
Riconoscere prochiralità del citrato
Particolarità ADH?
Specificità geometrica su etanolo e non su metanolo e isopropanolo
Cosa è la permissività?
Processo per cui un enzima è in grado di reagire con più tipi di substrato e/o catalizzare più tipi di reazione
Cosa sono i cofattori?
Molecole associate agli enzimi, senza le quali non potrebbero catalizzare determinati tipi di reazioni
Quali sono i coenzimi?
Cosubstrati e gruppi prostetici
Cos’è un apoenzima?
Enzima inattivo perchè privo del suo cofattore
Cos’è un oloenzima?
Enzima attivo perchè associato al proprio cofattore
Che tipo di catalisi opera l’RNAsi A del pancres bovino?
Catilisi acido-base generale
Quali residui sono presenti nel sito attivo dell’RNAsi A?
His 119 e his 12
Esempio di catalisi covalente
Decarbossilazione dell’acetoacetato
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Anidrasi carbonica (e ruolo di Zn2+)
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Cosa determina l’efficienza catalitica?
Vicinanza ed orientamento dei gruppi reagenti
Histidine proton shuttle
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Quali sono le serinproteasi più importanti?
Chimotripsina, tripsina ed elastasi
Tasca idrofobica della chimotripsina
è costituita da un residuo di ser 189 circondato da sue residui di gly. Reagisce con aaa con catene laterali inogmbranti voluminose come tyr, phe, trp
Tasca idrofobica della tripsina
Asp 189 centrale + 2 gly
interagisce con catene laterali carihe positivamente come lys e arg
Tasca idrofobica dell’elastasi
val e thr laterali, interagisce con amminoacidi piccoli e neutri quali ala
Buco dell’ossoanione
Inibitore della tripsina del cancreas bovino?
BPTI
Cosa sono gli zimogeni?
Precursori inattivi degli enzimi proteolitici
Qual è lo zimogeno della tripsina?
Il tripsinogeno, attivano deall’enteropeptidasi
Qual è lo zimogeno dell’elastasi?
Proelastasi
Su quale legame agisce l’enteropeptidasi?
Lys 15 - Ile 16
Attività autocatalitica