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H23- Biochimie et métabolisme > rappel grandes voies métaboliques > Flashcards

rappel grandes voies métaboliques Flashcards

1
Q

Qu’est ce que le métabolisme?

A

processus global qui assure aux organisme vivants l’apport et l’utilisation de l’énergie libre pour assurer leurs différentes fonctions exergonique endergoniques couplées

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2
Q

Organismes vivants sont-ils à l’équilibre? stables?

A

jamais à l’équilibre : énergie pour maintenir un ordre stable grâce à des réactions métaboliques

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3
Q

Quels sont 2 mécanismes utilisés pour l’énergie?

A

phototropes chimiotropes (oxyde et dégrade nutriments)

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4
Q

Quel est l’intermédiaire riche en énergie synthétisé dans les chimiotrophe?

A

ATP à partir de ADP+P

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5
Q

Que sont les voies métaboliques?

A

séries de réactions enzymatiques successives qui forment des produits spécifiques

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6
Q

Que sont les métabolites?

A

substrats, intermédiaires et produits

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7
Q

Quelles sont les 2 catégories de voies dans le métabolisme?

A

catabolisme anabolisme

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8
Q

Caractéristiques du catabolisme?

A

assure dégradation exergonique des nutriments et des constituants cellulaire récupère les unités de base et produire de l’énergie

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9
Q

Caractéristiques de l’anabolisme?

A

assure synthèse de biomolécules à partir de constituants simples

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10
Q

Comment l’énergie libre libérée dans le catabolisme est capatée?

A

en synthétisant de l’ATP à partir de l’ADP et phosphate ou réduire la coenzyme NADP+ en NADPH

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11
Q

Quelles sont les principales sources d’énergie libre pour les voies anaboliques?

A

ATP NADPH

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12
Q

Quelles sont les 5 caractéristiques des voies métaboliques?

A
  1. irréversibles 2. anabolisme et catabolisme emprunte des voies différentes 3.chaque voie métabolique comprend une “réaction d’engagement” 4.toutes les voies métaboliques sont régulées 5. chez les eucaryotes, les voies métaboliques se déroulent dans des sites intracellulaires spécifiques
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13
Q

Comment sont les réaction des voies métaboliques?

A

réactions organiques enzymatiques

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14
Q

Quelles sont les 4 catégories de réactions biochimiques?

A
  1. réaction de transfert de groupes 2. oxydoréduction 3.éliminations, isomérisation réarrangement 4.réaction de formation et rupture de lien C-C
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15
Q

Différence de rupture de lien entre système biologique et biochimique?

A

biochimique: C-C biologique: C-H

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16
Q

Comment peut être la rupture C-H?

A

homolytique hétérolytique

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17
Q

Caractéristique d’une réaction homolytique?

A

instable réaction d’oxydo-réduction 1 électron sur C 1 électron sur H

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18
Q

Caractéristique d’une réaction hétérolytique?

A

forme prédominante: 2 électrons sur C sinon: 2 électrons sur H

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19
Q

Quelles sont les 2 grandes catégories de composés qui participent aux réaction avec rupture hétérolytique et formation de liaisons?

A

nucléophiles électrophiles

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20
Q

Caractéristiques des nucléophiles?

A

AIME LE NOYAU riche en électrons chargés - ont des paires d’é non partagés caractère nucléophile et basique liés

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21
Q

Caractéristiques des électrophiles?

A

AIME LE NOYAU manque d’électrons chargés + ou pas

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22
Q

Un synonyme de transfert de groupes?

A

substitution nucléophile

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23
Q

Qu’est ce qu’implique les transfert de groupes?

A

dans le système biochimique: implique le transfert d’un groupe électrophile: d’un nucléophile à l’autre

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24
Q

Quels sont les groupes les plus fréquemment transférés dans les réactions biochimiques?

A

acyles phosphoryle glycosyle

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25
Q

Caractéristiques des réactions d’oxydo-réduction?

A

perte ou gain d’électron peut impliquer la rupture de C-H + perte de 2 électrons par l’atome de carbone

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26
Q

À qui sont transférés les électrons lors d’une réaction d’oxydoréduction?

A

à un accepteur d’électrons comme le NAD+

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27
Q

Qui est l’accepteur terminal des paires d’électrons pour es organismes aérobies?

A

oxygène moléculaire

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28
Q

Combien d’électrons l’O2 peut accepter ? pourquoi?

A

un à la fois possible grâce à l’intervention de coenzyme: FAD

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29
Q

À quoi mènent les réactions d’élimination?

A

formation de doubles liaisons C-C

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30
Q

Quelles sont les substances les plus souvent éliminées lors de réactions d’élimination?

A

Eau ++ NH3, alcool (ROH) amine primaire (RNH2)

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31
Q

Que sont des isomères?

A

molécules avec mpeme formule brute mais avec propriété chimique et biologiques différentes

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32
Q

Quels sont les 2 types d’isomères?

A

structure stéréoisomères

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33
Q

Quels sont les 2 types de stéréoisomères?

A

diastéréoisomères énantiomères

34
Q

Comment peuvent être les diastéréoisomères? (2 formes)

A

cis trans

35
Q

Que sont des énantiomères?

A

molécules isomères images l’une de l’autre dans un miroir mais non superposables

36
Q

Que signifie L et D?

A

désigne conformation actuelle de la molécule en 3D

37
Q

Que signifie + et- ?

A

propriété optique des molécules

38
Q

Qu’est ce qu’implique une réaction d’isomérisation?

A

implique le déplacement intramoléculaire d’un atome pour déplacer une double liaison –> un proton est enlevé d’un atome de carbone et ajouté è un autre

39
Q

Quelle est la réaction d’isomérisation la plus importante dans le métabolisme?

A

interconversion aldose-cétose (catalyse acido-basique avec formation d’intermédiaire anion ènediolate

40
Q

Qu’est ce que la racémisation?

A

réaction d’isomérisation ou un H d’un centre chiral modifie sa localisation stéréochimique + –> -

41
Q

Qu’est ce que l’épimérisation?

A

si une molécule comporte plusieurs centre chiraux, lors d’une réaction d’isomérisation

42
Q

Que font les réactions de réarrangements?

A

ils modifient les squelettes carbonés bris et formation de liens C-C

43
Q

Exemple de réaction de réarrangement ?

A

conversion du L-méthylmalonyl-CoA en succinyl-CoA par l’enzyme méthylmalonyl-CoA mutase

44
Q

Qu’est ce qui constitue la base du métabolisme de dégradation et de biosynthèse?

A

les réactions de formation et de rupture de liaisons carbone-carbone exemple: dégradation du glucose implique la rupture de 5 liaisons C-C

45
Q

Qu’est ce qu’implique les réaction de synthèse?

A

l’addition d’un carbanion nucléophile sur un atome de carbone électrophile

46
Q

Qu’est ce qu’un carbanion?

A

carbone avec charge négative

47
Q

Comment sont rendus possible les processus endergonique qui assurent le maintien de la vie?

A

par des réactions exergoniques de l’oxydation des nutriments

48
Q

De quoi dépend le couplage des réactions ender et exergoniques?

A

de la synthèse d’intermédiaires riches en énergie.

49
Q

Quelle réaction a une grande importance pour la production d’énergie?

A

les réactions de transfert de groupement phosphoryle avec l’hydrolyse de l’ATP qui libère de l’É

50
Q

Synonyme d’énergie libre de Gibbs?

A

enthalpie libre

51
Q

Qu’est ce que l’énergie libre de Gibbs?

A

potentiel thermodynamique qui représente le maximum d’énergie utilisable pour effectuer un travail mécanique

52
Q

Que signifie ΔG?

A

la différence en énergie quand les réactifs passent d’un état à un autre force pour atteindre l’équilibre chimique

53
Q

Que veut dire un ΔG négatif?

A

la réaction chimique ou enzymatique est favorable ou spontanée

54
Q

Que veut dire un ΔG positif?

A

la réaction chimique ou enzymatique est défavorable

55
Q

Quelle est l’énergie de Gibbs pour une réaction non-standard?

A

ΔG = ΔGo + RT ln Q

56
Q

Que signifie le Q dans l’équation ΔG = ΔGo + RT ln Q?

A

Le quotient réactionnel ou quotient de réaction Q = [C]c [D]d [A]a [B]b

57
Q

Pourquoi l’anabolisme et le catabolisme prennent des voies différentes?

A

pour empêcher que les réactions aient lieux en même temps (éviter gaspillage d’énergie)

58
Q

Quelle réaction fait que chaque voie métabolique est irréversibles?

A

réaction d’engagement

59
Q

Est ce que les électrons peuvent attaquer R ou R’ dans une attaque nuclépphile?

A

non juste le centre électro positif ( C )

60
Q

Qu’est ce que la force motrice pour les réactions chimiques?

A

ΔG

61
Q

Que sont les conditions standard?

A

les concentration des produits et réactifs sont tous de 1mol/L et Q = 1

62
Q

Que vaut ΔG à l’équilibre?

A

0

63
Q

Que vaut ΔGo lorsque Keq > 1 ?

A

ΔGo est négatif, réaction veut aller vers la droite pour favoriser les produits

64
Q

Que vaut ΔGo lorsque Keq

A

ΔGo est positif, réaction poussée vers la gauche pour favoriser les réactifs

65
Q

Qu’est ce que ΔGo ?

A

ΔG en condition standard

66
Q

Quelles sont les différences entre ΔG ΔGo ΔG’ ΔGo’

A

ΔG = énergie de gibbs en conditions physiologiques. concentrations variables ΔGo = énergie de gibbs en conditions standard, concentration : 1M ΔG’= énergie de gibbs en conditions physiologique et pH 7 ΔGo’ = énergie de gibbs en condition standard et pH 7

67
Q

Comment est ΔG lorsque Q>keq?

A

ΔG positif

68
Q

Comment est ΔG lorsque Q

A

ΔG est négatif

69
Q

Comment est ΔG lorsque Q = Keq?

A

ΔG =0

70
Q

Comment appelle-t-on les liaisons dont l’hydrolyse s’accompagne d’un ΔGo’ très négatif?

A

liaisons à haut potentiel énergétique ou liaison riches en énergie ( ~ )

71
Q

Pourquoi l’ATP peut dégager autant d’énergie?

A

provient de sa structure

72
Q

Exemples d’utilisation de l’ATP ?

A
  1. amorçage de la dégradation de substrats dans la glycolyse 2. activation des acides aminés lors de la synthèse protéique 3. processus biologiques (contracter ou relacher des muscles, transport membranaire, réplication de l’ADN mouvement flagelles spermatozoïdes)
73
Q

Que se passe-t-il dans une réaction d’oxydo-réduction?

A

transferts d’électrons

74
Q

Qui fournit la plus grande partie de l’énergie libre des organismes?

A

réactions d’oxydo-réduction exemple: glucose oxydé en CO2 et O2 réduit en H2O

75
Q

Dans quel sens vont les électrons dans une réaction d’oxydo-réduction?

A

d’un donneur d’électrons (agent réducteur) vers accepteur d’électrons (agent oxydant)

76
Q

Comment appelle-t-on la molécule qui fournit les électrons?

A

agent réducteur

77
Q

De quelle molécule dépendent les demi-réactions?

A

cytochrome c oxydase

78
Q

Comment peut-on décrire le potentiel d’oxydo-réduction?

A

pression en électrons exercée par une pile électrochimique ΔE° = E°(accepteur) - E°(donneur)

79
Q

Comment est ΔG si E° est positif

A

ΔG est négatif, la réaction est spontanée, elle peut accomplir un travail

80
Q

Que signifie E°’ positif?

A

plus c’est élevé + c’est un agent oxydant, lui qui veut accepter le plus d’électrons

81
Q

Que signifie E°’ négatif?

A

moins c’est élevé + c’est un réducteur, moins grande capacité à accepter des électrons

H23- Biochimie et métabolisme (7 decks)

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