Prvi klk 4. predavanje Flashcards
šta čini rnk hromatin
iRNK i proteini koji čine iRNP
eukariotski operoni RNK predstvaljaju
Set funkcionalno povezanih iRNK
čija se ekspresija kontroliše
zajedničkim regulatornim
elementima - USER elementi
šta omogućavaju operoni RNK
da ćelija brzo odgovori na uslove sredine
kako se formiraju operoni, pomoću čega
pomoću USER elemenata- isti element na više RNK= zajednička regulacija svih tih RNK
da li je veća fleksibilnost eukariotskih RNK operona ili prokariotskih dnk operona
veća je fleksibilnost RNK operona
ko reguliše ekspresiju opreona RNK
u skladu sa potrebama ćelije
Signalni molekuli i metaboliti
kako Signalni molekuli i metaboliti regulišu ekspresiju opreona RNK
Modulišu aktivnost RBP
(kovalentne modifikacije- fosforilacija,
promena nivoa ekspresije)
kada dolazi do presvlačena iRNP
pri prelasku iz jedra u citoplazmu
kada se regrutuju faktori SR, EJC, hnRNP
još u jedru
šta je vezano za 5 i 3prim kraj translaciono aktivne iRNP pri ulasku u citoplazmu
za 5’-kape iRNP je, uglavnom, vezan kompleks CBC20/80, dok su za poli(A) rep vezani i PABPN1 i PABPC1.
za šta služi CBC20/80
vezan je za 5prim kapu, služi kao inicijacioni faktor translacije, pri čemu uspostavlja interakciju sa eIF4G
kako počinje pionirska runda translacije
cbc20/80 kao inicijacioni faktor translacije interaguje sa eif4g, formira se kružna struktura i bezuje se mala subj ribozoma koja nosi ternarni kompleks. dolaskom na start kodon pridružuje se i velika subj i počinje pionirska runda translacije
šta čini ternarni kompleks
eIF2, GTP i inicijatorksa tRNK(sa metioninom)
kada se dešava drugo presvlačenje iRNP
tokom pionirske runde translacije
šta se dešava sa cbc20/80 i sa PABPN1 tokom translacije
cbc se zamenjuje sa eIF4E, a pabpn sa PABPC1
šta se dešava sa iRNK koje ne podležu odmah trnslaciji pri prelasku u citoplazmu
lokalizuju se i translaciono utišavaju sve dok ne dođe neki signal za početak njihove translacije
ko sve ima kružnu strukturu
translaciono aktivne, ali i translaciono neaktivne iRNK
za šta služi kružna struktura iRNK
1) olakšava kontrolu translacije zbog regulatornih elemenata u 3prim UTR
2) povećava afinitet eIF4E za 5prim kapu
3) promoviše efikasnu reinicijaciju translacije
4) štiti oba kraja transkripta od mašinerija za degradaciju iRNK
uloge eIF4E
prepoznavanje i vezivanje 5prim kape
uloge eIF4A
ATP zavisna RNK helikaza
uloge eIF4G
stupa u interakciju sa eIF4E, PABP, eIF3
uloga PABP
cirkularizacija RNK
uloga eIF3
regrutovanje male
subjedinice ribozoma sa ternarnim
kompleksom (eIF2-GTP-tRNK)