Prvi klk 4. predavanje Flashcards

You may prefer our related Brainscape-certified flashcards:
1
Q

šta čini rnk hromatin

A

iRNK i proteini koji čine iRNP

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

eukariotski operoni RNK predstvaljaju

A

Set funkcionalno povezanih iRNK
čija se ekspresija kontroliše
zajedničkim regulatornim
elementima - USER elementi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

šta omogućavaju operoni RNK

A

da ćelija brzo odgovori na uslove sredine

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

kako se formiraju operoni, pomoću čega

A

pomoću USER elemenata- isti element na više RNK= zajednička regulacija svih tih RNK

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

da li je veća fleksibilnost eukariotskih RNK operona ili prokariotskih dnk operona

A

veća je fleksibilnost RNK operona

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

ko reguliše ekspresiju opreona RNK
u skladu sa potrebama ćelije

A

Signalni molekuli i metaboliti

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

kako Signalni molekuli i metaboliti regulišu ekspresiju opreona RNK

A

Modulišu aktivnost RBP
(kovalentne modifikacije- fosforilacija,
promena nivoa ekspresije)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

kada dolazi do presvlačena iRNP

A

pri prelasku iz jedra u citoplazmu

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

kada se regrutuju faktori SR, EJC, hnRNP

A

još u jedru

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

šta je vezano za 5 i 3prim kraj translaciono aktivne iRNP pri ulasku u citoplazmu

A

za 5’-kape iRNP je, uglavnom, vezan kompleks CBC20/80, dok su za poli(A) rep vezani i PABPN1 i PABPC1.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

za šta služi CBC20/80

A

vezan je za 5prim kapu, služi kao inicijacioni faktor translacije, pri čemu uspostavlja interakciju sa eIF4G

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

kako počinje pionirska runda translacije

A

cbc20/80 kao inicijacioni faktor translacije interaguje sa eif4g, formira se kružna struktura i bezuje se mala subj ribozoma koja nosi ternarni kompleks. dolaskom na start kodon pridružuje se i velika subj i počinje pionirska runda translacije

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

šta čini ternarni kompleks

A

eIF2, GTP i inicijatorksa tRNK(sa metioninom)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

kada se dešava drugo presvlačenje iRNP

A

tokom pionirske runde translacije

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

šta se dešava sa cbc20/80 i sa PABPN1 tokom translacije

A

cbc se zamenjuje sa eIF4E, a pabpn sa PABPC1

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

šta se dešava sa iRNK koje ne podležu odmah trnslaciji pri prelasku u citoplazmu

A

lokalizuju se i translaciono utišavaju sve dok ne dođe neki signal za početak njihove translacije

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

ko sve ima kružnu strukturu

A

translaciono aktivne, ali i translaciono neaktivne iRNK

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

za šta služi kružna struktura iRNK

A

1) olakšava kontrolu translacije zbog regulatornih elemenata u 3prim UTR
2) povećava afinitet eIF4E za 5prim kapu
3) promoviše efikasnu reinicijaciju translacije
4) štiti oba kraja transkripta od mašinerija za degradaciju iRNK

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

uloge eIF4E

A

prepoznavanje i vezivanje 5prim kape

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

uloge eIF4A

A

ATP zavisna RNK helikaza

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

uloge eIF4G

A

stupa u interakciju sa eIF4E, PABP, eIF3

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

uloga PABP

A

cirkularizacija RNK

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

uloga eIF3

A

regrutovanje male
subjedinice ribozoma sa ternarnim
kompleksom (eIF2-GTP-tRNK)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

uloga eIF2

A

GTP vezivni protein koji je deo ternarnog kompleksa i dovodi inicijatorsku tRNK na P mesto

25
Q

uloge eRF1 i eRF3

A

to su faktori oslobađanja, služe pri terminaciji translacije, eRF1 prepoznaje stop kodon, eRF3 interaguje sa PABPC1

26
Q

šta je IRES i za šta služi

A

IRES je unutrašnje mesto vezivanja ribozoma i služi kod RNK molekula koji imaju translaciju nezavisnu od 5prim kape
IRES su specifične sekundarne strukture koje direktno regrutuju malu subj ribozoma
IRES postoji kod virusnih RNK i kod ćelijskih iRNK koje imaju duge 5¢-UTR sa visokim sadržajem GC, koji su
podložni formiranju sekundarnih struktura.

27
Q

gde se nalazi IRES

A

u 5prim UTR ili u kodirajućem regionu

28
Q

kada IRES efikasno iniciraju translaciju

A

kada se kompromituje translacija zavisna od 5¢-kape,
IRES efikasno iniciraju translaciju jer ne zavise od prisustva ili integriteta nekoliko prethodno
opisanih kanonskih faktora inicijacije translacije, pre svega eIF4E i eIF2.

u normlnim fiziološkim uslovima iRES su neefikasne

29
Q

šta zahtevaju IRES za efikasnu translaciju

A

eIF4G- RNK šaperoni
eIF4A
ITAF

30
Q

kako IRES regrutuju ribozome u blizini start kodona

A

direktno
preko eIF4G- imitirajući kapu

31
Q

kakva može biti regulacija translacije

A

translaciono utišavanje specifičnih iRNK sa RBP i miRNK
globalno reprogramiranje translacije

32
Q

kako se ostvaruje TRANSLACIONO UTIŠAVANJE SPECIFIČNIH IRNK

A

vezivanjem RBP i miRNK za regulatorne elemente iRNK
Vezivanje specifičnih RBP za 5’-UTR blokira ribozom u pretraživanju start kodona
miRNK kroz kompetitivno vezivanje mogu otkloniti represiju
Vezivanje RBP za regulatorne elemente u 3’-UTR-u interferira sa funkcijom eIF4E

33
Q

RBP prepoznaje specifične
regulatorne elemente u 3¢UTR-u i
regrutuje:

A

4E-BP – proteini koji direktno
vezuju eIF4E, inhibirajći
asembliranje eIF4F

Alternativni protein koji
direktno vezuju 5¢-kapu,
sprečavajući eIF4E da se veže
za istu

34
Q

Molekulski mehanizmi kojima RPB ostvaruju reprimiranje translacije specifičnih iRNK su:

A

kompetitivna inhibicija vezivanja eIF4E za eIF4G,

kompetitivna inhibicija vezivanja eIF4E za 5¢-
kapu i

citoplazmatično skraćivanje poli(A) repa (često povezano sa kompetitivnom inhibicijom vezivanja eIF4E za eIF4G).

35
Q

kako funkcionise skracivanje polia repa

A

u 3¢-UTR-u postoje dve sekvence- poli(A) signal i jedna ili više kopija uzvodnih elemenata za citoplazmatičnu poliadenilaciju CPE

CPE prepoznaje CPEB protein

kao dodatni protein CPEB regrutuje i maskin protein koji pripada familiji 4E BP

36
Q

primeri za skraćivanje polia repa

A

maternalne iRNK oocita Xenopus
iRNK neurona- sinaptička plastičnost

37
Q

ključna kontrolna tačka za regulaciju
incijacije translacije i opštu
inhibiciju sinteze proteina u
ćelijama pod uslovima stresa

A

ternarni kompleks

38
Q

ko reguliše brzinu
sinteze proteina

A

Kinaze eIF2 fosorilacijom eIF2

39
Q

ko je senzor stresa

A

kinaze eIF2

40
Q

šta je marker stresa

A

fosforilacija eIF2α

41
Q

šta je marker reparacije stresa

A

defosforilacija eIF2α

42
Q

kako fosforilacija eIF2α remeti translaciju

A

interferira sa formiranjem ternarnog kompleksa.

alfa subjedinica eIF2 se fosfriliše i tad ovaj faktor ima veliki afinitet za eIF2B, vezuje se za njega i blokira razmenu GTPa

43
Q

šta je TOR

A

proteinska kinaza koja stmuliše prosečnu brzinu sinteze proteina

44
Q

kako se ponaša mTOR ustresnim uslovima

A

inaktiviran je

45
Q

Supstrati mTOR-a koji direktno regulišu translaciju

A

4E-BP
S6K

46
Q

Supstrati mTOR-a koji indirektno utiču na translaciju

A

transkripcioni faktori gena za komponente ribozoma, tRNK, faktore translacije

svi zajedno aktiviraju sintezu proteina i rast ćelije

47
Q

šta radi Protein Rheb

A

vezuje se za mTOR i aktivira njegovu kinaznu aktivnost

48
Q

šta radi Proteinski kompleks
TSC1/TSC2

A

reguliše rheb- vrši hidrolizu GTPa vezanog za njega

49
Q

aktiviraju TSC1/2

A

hipoksija
nepovoljno energetsko stanje

50
Q

inhibira TSC1/2

A

faktori rasta

51
Q

nezavisno od TSC1 šta inhibira mtor

A

nedostatak hranljivih materija

52
Q

šta sve radi mTOR

A

inhibira autofagiju
deluje na sintezu proteina
na metabolizam ćelije
na angiogenezu
na rast ćelije

53
Q

Kao odgovor na reprogramiranje translacije
formiraju se

A

reverzibilne granule stresa

54
Q

Glavni fiziološki okidač za formiranje granula stresa je

A

fosforilacija eIF2α

55
Q

Deasembliranje granula stresa zahteva aktivnost

A

fosfataze GADD34 i reaktivira translaciju

56
Q

šta radi Ribonukleaza angiogenin

A

seče
tRNK u antikodonskoj petlji
dajući tiRNK (male RNK nastale
od tRNK u uslovima stresa)

57
Q

5’-tiRNK

A

globalno reprimiraju
translaciju

indukuju formiranje granula stresa

formiraju tetramolekularni G kvadripleks

58
Q

uticaj angiogenina na okolne ćelije

A

štiti ih od stresa, može delovati na okolne kada ga sekretuju ćelije nekog tkiva, ili sistemski, kada se stvara u jetri

59
Q
A