Prvi klk

Question 1

Šta podrazumeva „presvlačenje“ iRNP

Answer 1

posttranslacione modifikacije, vezivanje kofaktora, protein-protein interakcije RBP i post-
transkripcione modifikacije baza RNK

Question 2

Šta je USER kod

Answer 2

kombinacija USER elemenata na nekoj RNK - netranslatirajući elementi za regulaciju

Question 3

šta spada u faktore iRNP

Answer 3

RBP i male nekodirajuć RNK

Question 4

na kom nivou u ekspresiji gena RBP deluju

Answer 4

na posttranskripcionom nivou regulacije ekspresije gena

Question 5

koje domene imaju RBP

Answer 5

RNK vezujući koji prepoznaje specifičnu sekvencu ili strkturu RNK i pomoćni koji služi za vezivanje sa drugim proteinima ili imati katalitičku funkciju

Question 6

Šta je modularna organizacija RBM i šta ona obezbeđuje

Answer 6

Modularna
organizacija RBD podrazumeva specifičnu kombinaciju i raspored većeg broja identičnih, ili ređe,
različitih RBD koji pojedinačno uspostavljaju slabe interakcije sa RNK i deluju kooperativno. obezbeđuje specifičnost RBP za interakciju sa ciljnom RNK. Takođe, ona omogućava da jedan RBP
asemblira i deasmblira veći broj svojih vezivnih površina, što je esencijalno za obezbeđivanje
fleksibilnosti tokom dinamičnih interkacija RBP i ciljnih RNK.

Question 7

na šta utiču dužina i rigidnost linkera RBPa

Answer 7

na afinitet RBP za RNK i njihovu sposobnost da vežu jednu ili nekoliko ciljnih RNK.

Question 8

kako ADARB1 i PKR kontrolišu svoju f-ju

Answer 8

njihovi katalitički domeni vezani su za RBD i onda tek kada stupe u kontakt sa supstratom, tj RNK, preko RBD oslobađa se katalitički domen i vrši svoju funkciju

Question 9

Šta su IDD

Answer 9

inherentno neuređeni domeni, koji poseduju neki RBP i preko njih se vezuju za RNK
predstavljaju plastične, potencijalno multifunkcionalne motive

Question 10

sa kojim sekvencama stupaju u interakciju RBP

Answer 10

sa netranslatirajućim, nekodirajućim i kodirajućim regionima

Question 11

kakve su interakcije RBP sa 5 kapom i 3 krajem

Answer 11

Interkacije RBP
sa 5’-kapom i poli(A) repom su specifične za same strukture RNK, ali ne vrše diskriminaciju
pojedinačnih ciljnih RNK.
NESELEKTIVNO vezivanje za sve iRNK.

Question 12

koji se RBP vezuju za 5 kapu i 3 kraj

Answer 12

CBC20/80, eIF4E, PABPN1 i PABPC1.

Question 13

koji faktori uspostavljaju interakcije sa iRNK celom njenom dužinom

Answer 13

proteini Y boksa
vezuju se za promotorski element Y-boks
glavne komponente citoplazmatičnih iRNP
modulišu translacionu aktivnost na dozno-zavisan način

Question 14

koji faktori se vezuju za specifične pozicije u iRNK nezavisno od sekvence

Answer 14

kompleks EJC
pomaže splajsozomu da prepozna egzone,
stimuliše transport iRNP iz nukleusa u citoplazmu.
pokreću brzu razgradnju iRNK mehanizmom degradacije iRNK posredovane
prevremenim stop kodonom

Question 15

RNK helikaze učestvuju u

Answer 15

svim koracima metabolizma iRNK.

Question 16

šta rade rnk helikaze

Answer 16

hidrolizuju ATP i oslobođenu
energiju koriste za narušavanje sekundarne strukture RNK i/ili otklanjanje proteina vezanih za
RNK

Question 17

za šta se vezuje mikro rnk

Answer 17

mikroRNK se uglavnom
neperfektno bazno sparuju sa specifičnim ciljnim sekvncama smestenim uglavnom u 3’-UTR-u.