proyecto del genoma humano Flashcards
primer gen secuenciado
BRCA1 (1990)
como sabían donde buscar un gen
-islas CpG
-EST
cuantos genes encontraron
142 000
criterios de calidad a la hora de ensamblaje
-sobretaparse 40pb
-diferencia - 6% entre ellas
2 bases a de datos que hicieron
-celebra genomics (fondos privados)
-HGP ( fondos públicos)
que buscaba el control de calidad
especificidad minima de 99.5%
No contaminacion con E.coli o ADNmitocondrial
aparato que analizaba los fragmentos
ABI PRISM 3700 DNA ANALIZER
analiza fragmentos de 543pb
que métodos de secuenciación se utilizó al inicio de este proyecto
sanger
las librerías pueden almacenar
100-200Kb
que son las librerías y cuales usaron para este proyecto
técnicas de aislamiento donde se pone a replicar muchas veces el mismo fragmento
-BAC ( a partir de cromosomas bacterianos artificiales)
las muestras se clonaron en
librerías
como se obtuvieron las muestras
-21 voluntarios
-donación de sangre y semen
-muestras en base a la calidad del material genético
(solo se uso 1)
etapas del proyecto (6)
1- muestras y métodos de secuenciación
2- estrategias y caracterización del ensamblaje
3- estructura de genoma
4- evolucion de genoma
5- examination de variaciones
6- predicción
describen la estructura del ADN en
1953
se describe el gen como material genético
1944
malean genes largos de la mosca
1911
descubren el entrecruzamiento
1909-1911
describen los cromosomas homólogos
1903
mendel descubre unidades discretas de herencia
1885
se descubre el cromosoma x
1880
que parte del genoma se secuencio
5%
objetivos del proyecto
-conocer, clasificar y caracterizar TODOS los genes
-determinar la secuencia
-base de datos para todos
-tecnologías de secuenciación
-analizar
-establecer leyes del comportamiento ético y legal
con que estandarizaron el proyecto
genoma de drosophila melanogangster (mosca)
países que participaron en el proyecto
usa
inglaterra
francia
alemania
japón
china
quien superviso el proyecto
NIH
U.S department of electricity
cuando se creció la PCR
1985
cuando se publico el proyecto
2001
duración del proyecto
1990-2003
a la metodología de las librerías se le conoce como
BAC-based
clone by clone
