Proteini (1.lekcija)

Question 1

Što su proteini?

Answer 1

Proteini su linearni polimeri aminokiselina povezanih peptidnom vezom

Question 2

Kako nastaje peptidna veza?

Answer 2

Nastaje povezivanjem alfa-COO jedne AK s NH3+ skupinom druge AK uz izlazak vode

Question 3

Koja je reakcija termodinamički povoljnija : stvaranje peptidne veze ili njezina razgradnja (hidroliza)?

Answer 3

Hidroliza

Question 4

Zašto su onda peptidne veze stabilne, kad je njihova razgradnja povoljna?

Answer 4

Zato jer su kinetički stabilne ( reakcija je spora, 1000 godina je protein stabilan u vodi )

Question 5

Kakva je peptidna veza u prostoru?

Answer 5

Kruta, 6 atoma leži u istoj ravnini : alfaC i CO skupina iz prve AK te NH skupina i alfaC iz druge AK dakle oni koji su ušli u peptidnu vezu su svi u istoj ravnini

Question 6

Kakva svojstva ima peptidna veza?

Answer 6

Djelomice je dvostruka veza jer nema slobodne rotacije oko veze između karbonilnog C i amidnog N

Question 7

Kolika je udaljenost između C i N u peptidnoj vezi?

Answer 7

1.32 A

Question 8

Koje su konfiguracije peptidne veze?

Answer 8

Trans : dva alfa C su na suprotnim stranama veze

Cis : dva alfa C su na istoj strani veze

Question 9

Koja je konfiguracija češća u proteinima?

Answer 9

Trans : H iz amino skupine je u trans prema kisiku iz karbonilne

Question 10

Oko kojih je veza moguća rotacija?

Answer 10

Oko veze između alfaC i N te alfaC i C

Question 11

Primarna struktura proteina obilježena je?

Answer 11

Slijed aminokiselina

Question 12

Sekundarna struktura?

Answer 12

Međusobni položaj ogranaka bliskih AK

Question 13

Tercijarni položaj?

Answer 13

Međusobni položaj ogranaka udaljenih AK

Question 14

Što je nativna konformacija?

Answer 14

Najpovoljniji oblik proteina karakteriziran minimalnim sadržajem slobodne energije

Question 15

Kako se raspoznaje početak lanca?

Answer 15

Uzima se ona AK sa slobodnim amino krajem

Question 16

Od čega se sastoji polipeptidni lanac?

Answer 16

Od okosnice koja se pravilno ponavlja i promjenjivog dijela s ograncima R

Question 17

Što su cistinski mostovi?

Answer 17

Mostovi nastali povezivanjem dvaju S- ova iz bočnih ogranaka

Question 18

Periodična ponavljanja u okosnici polipeptidnog lanaca mogu biti :

Answer 18

alfa uzvojnica, Beta nabrana ploča, kolagenska uzvojnica, beta okret i beta omče