Protein trafficking

Question 1

vad bestämmer vart proteinerna ska?

Answer 1

signalsekvensen på aasekvensen, olika sekvenser indikerar olika ställen i cellen

Question 2

vad indikerar speciellt om proteinerna ska till ER?

Answer 2

att signalsekvensen finns på N- terminalen, proteiner som ska till cytosol saknar den sekvensen

Question 3

vad händer om man ändrar signalsekvensen?

Answer 3

då ändrar man proteinets placering, ex. swyer syndrome

Question 4

vad händer med proteiner som felplaceras?

Answer 4

När proteiner felplaceras kan sjukdomar/mutationer uppkomma t.ex. Swyer syndrome. Felplaceras proteinerna kan de inte utföra deras funktion som i sig påverkar andra proteiner vilket påverkar hela systemet. Swyer syndrome beror på att sry genen har muterats och Sry proteinet inte finns i kärnan längre utan finns i utanför.

Question 5

hur fungerar en polyribosom?

Answer 5

Under translation kan många ribosomer binda till varandra och bilda en polyribosom. Polyribosomen läser då av mRNA tillsammans, när processen är klar kommer ribosomerna lossna från varandra och bli fria ribosomer i cytoplasman.

Question 6

det finns två typer av importer, vilka?

Answer 6

cotranslational och postranslational

Question 7

posttranslational import, delas in i tre mekanismer vilka?

Answer 7

nukleär transport, protein translocators och vesiklar

Question 8

vad är mekanism 1?

Answer 8

mekanism 1= nukleär transport.

Proteinerna kan transporteras genom nukleära porer som tillåter specifik transport. I kärnhöljet finns porer där ämnen kan transporteras in/ut. Poren är stor och består av ungefär 30 olika proteiner.

Question 9

vad händer under nukleär transport?

Answer 9

Transporten genom den nukleära poren sker genom att proteinet (som har en nuclear localization signal) som ska transporteras binder till en nuclear import receptor. Komplexet kommer sedan interagera med cytosoliska fibriller och proteinet släpps sedan ut till kärnan och receptor kan återanvändas.
I kärnan kommer proteinet stöta på ett GTPase, Ran, som bär på en GTP. Ran- GTP binder till receptorn vilket får den att släppa proteinet. Receptorn som fortfarande är bunden till GTP transporteras tillbaka till cytosolen. I cytosolen kommer Ran hydrolysera GTP, och Ran- GDP kan binda till ett nytt protein.

Question 10

vad är mekanism 2?

Answer 10

Mekanism 2= protein translocators

Proteiner från cytosol transporteras genom organellers membran med hjälp av protein translocators.

Question 11

vad händer under protein translocators?

Answer 11

Vid denna typ av transport kommer receptorn känna igen signalpeptiden hos det protein som ska transporteras. Proteinet, receptorn och translocator komplexet kommer sedan gå igenom det yttremembranet tills de stöter på en second transslocator i det inre membranet. Genom två translocator kommer proteinet som inte är vikt, inte antagit sin konformation, att transporteras igenom. Att proteinet inte har antagit sin konformation beror på chaperoner men väl inne kommer proteinet anta sin konformation.

Question 12

vad är mekanism 3?

Answer 12

mekanism 3= vesiklar

Proteiner som transporteras mellan ER och det endomembrane system transporteras genom vesiklar.

Question 13

vad händer under transporten med vesiklar?

Answer 13

Vesiklarna kommer från membranet hos organellen och sammanfogas med ett annat, i vesikeln kan olika typer av last finnas.

Question 14

vad är exocytos?

Answer 14

Exocytos= utsöndring av ämnena. Börjar med proteinsyntes i ER där proteinerna sedan får transporteras genom golig till plasmamembranet innan det utsöndras (iform av vesikel).

Question 15

vad är endocytos?

Answer 15

Endocytos= insöndring. Insöndring (material från plasmamembranet kommer in) sker när ämnen ska brytas ner i t.ex. lysosomer.

Question 16

förklara hur en vesikel når sin slutdestination

Answer 16

En vesikel måste känna igen sin slutdestination och det gör den genom komplementära receptorer på det membran den ska sammanfogas med. Rab proteiner (som är GTPase) finns på vesikelns yta där varje typ av vesikel har specifika Rab proteiner. För varje Rab finns ett komplementärt protein på membranet. När vesikeln är framme kommer Rab att interagera med ett protein vilket ”dockar” vesikeln närmare membranet vilket möjliggör det för v- snare och t- snare att tvinnas kring varandra så att endocytos kan ske. För att vesikeln ska kunna ”docka” måste avståndet vara runt 1,5 nm för då undantrycks molekyler.

Question 17

vad händer samtidigt som cotranslational import?

Answer 17

cotranslational import sker samtidigt som translationen och denna typ av transport bildar proteiner i ER sedan går de igenom golgi och sedan ut i vesiklar

Question 18

Hur överförs protein till ER lumen?

Answer 18

SRP finns i cytosol och kommer binda till ER signalsekvens vilket gör att proteinsyntesen saktas ner. En SRP receptor i ER membranet kommer sedan känna igen SRP och binda. När bindningen uppstår kommer SRP att frigöras (kan återanvändas) och receptorn kommer överföra ribosomen till en translocation kanal där proteinsyntesen kan påbörjas.
Signalsekvensen finns oftast (hos lösliga proteiner) vid N- terminalen och inne i ER avlägnas signal peptiden.