DNA till protein

Question 1

berätta om människors genom

Answer 1

Människors genom är till 99,9 % identiskt. Mellan två gener finns en icke- kodande region. Den 0,1 % används till forensik och sker oss våra skillnader. 0,1 % ger ungefär 3 miljoner genetiska skillnader; 0,1 % kodar således för många proteiner.

Question 2

vad är SNP?

Answer 2

är ett nukleotidsubstitut som ger variation till genomet. SNPs uppkommer efter ungefär 1000 baspar och bidrar till polymorfism; gör individer unika samt kan ge sjukdomar.

Question 3

vad är STR?

Answer 3

är upprepande sekvenser (2–7 baspar) som ligger efter varandra i en följd. Hur många som uppkommer i rad beror på regionen och kan variera.

Question 4

hur går PCR till?

Answer 4

Vid PCR ökar man först temperaturen till 95° C för vid denna temp. kommer vätebindningarna mellan kvävebaserna i helixen att brytas så att kedjorna separeras. Temp. sänks sedan till 60° C och primer:na binder in till kedjan. DNA polymeras kan vid
72° C fästa/använda som startpunkt vid dessa primer och börja syntetisera DNA 5’ till 3’. Vill man ytterligare duplicera mängden DNA upprepas cykeln.

Question 5

Hur går DNA replikationen till?

Answer 5

Inför DNA- replikation måste dubbelkedjan separeras i cellen. Separationen sker med DNA helikas då vi inte kan ha 95 grader i cellen som i PCR. DNA- helikas lindar upp helixen genom att bryta vätebindningarna. När bindningarna bryts kommer en öppning, replication fork, fås. Helixen strävar efter att återgå till sin stängda position, detta hindra då single strand protein binder in.
Efter separationen av kedjorna kommer DNA primase att binda in och utgör en startpunkt dit DNA polymers kan binda och börja syntetisera en ny kedja då DNA polymeras inte kan börja på måfå. DNA polymeras behöver även sliding clamp då DNA polymeras har en tendens att lossna från mallen, sliding clamp håller således fast DNA polymeras.
Vid leading strand sker syntesen kontinuerligt men vid lagging strand sker syntesen diskontinuerligt i okazaki fragment då syntesen alltid sker i 5’ till 3’, okazaki fragmenten sammanfogas sedan av DNA ligas. På ena kedjan blir en sådan kontinuerlig syntes inte möjlig vilket ger upphov till okazaki fragment. Vid lagging strand kommer RNA primer att binda in och RNA byts sedan ut mot DNA av RNase H, DNA polymeras kan sedan binda dit DNA.

Question 6

vad gör DNA helikas?

Answer 6

separerar helixen

Question 7

vad är replication fork?

Answer 7

den öppning DNA helikas öppnar

Question 8

varför stängs inte replication fork?

Answer 8

på grund av single strand protein

Question 9

vad gör DNA primase?

Answer 9

utgör en startpunkt för DNA polymeras att syntetisera ifrån

Question 10

vad gör en sliding clamp?

Answer 10

DNA polymeras har en tendens att lossna ifrån DNA mallen, sliding clamp hålles således fas DNA polymeras till mallen

Question 11

vad är okazaki fragment?

Answer 11

segment (150- 200 bp) som syntetiseras diskontinuerligt

Question 12

vad sammanfogar okazaki fragment?

Answer 12

DNA ligas

Question 13

vad gör RNase H?

Answer 13

bryter ner RNA som finns hos lagging strand

Question 14

varför är eukaryoters replikationshastighet lägre än prokaryoternas?

Answer 14

maskineriet hos eukaryoters ”säkerhetssytem”, som kontrollerar att DNA blev korrekt, är mer komplext än vad det är hos prokaryoter.

Question 15

vad gör topoisomeras?

Answer 15

Topoisomeras klipper en kedja samt återsluter den igen för att undvika att spänningar uppkommer. Topoisomeras fortsätter klippa/återsluta tills replikationen är klar.

Question 16

vad består en gen av?

Answer 16

promotor- exon- intron- exon- intron osv.

Question 17

vad följer inte med under transkriptionen?

Answer 17

intronerna och promotorn (endast exonerna)

Question 18

vad händer i transkriptionen?

Answer 18

Vid transkriptionen kommer RNA polymeras binda till genens promotor och mRNA syntesen påbörjas i riktningen 5’ till 3’ och upphör när RNA polymeras påträffar en terminator som finns på 3’ änden av genen. Av syntesen fås mRNA.

Question 19

mRNA genomgår tre modifikationer, vilka?

Answer 19

capping, polyadenylering och splicing

Question 20

vad är capping?

Answer 20

behövs bl.a. för att transportera mRNA från kärnan till cytoplasman. RNA trifosfat katalyserar fästningen av 5’ locket till mRNA som håller på att syntetiseras.

Question 21

vad gör polyadenylering?

Answer 21

skyddar mot enzymatisk nedbrytning.

Question 22

vad är splicing?

Answer 22

den process där intronerna och promotorn klipps bort så att endast exonerna består. Splicing kan även steget efter, klippa bort exoner och göra olika varianter av mRNA.

Question 23

translationen delas in i tre steg vilka?

Answer 23

initiation, elongation och termination

Question 24

vad händer i initiation?

Answer 24

mRNA, tRNA och ribosomen binder till varandra. mRNA börjar avläsas i ribosomen och tRNA med start kodon binder in.

Question 25

vad händer i elongation?

Answer 25

aminosyrorna som bärs av tRNA adderas till varandra via en peptidbindning i en kedja.

Question 26

vad händer i termination?

Answer 26

ett stop- kodon binder in och peptidkedjan släpps från ribosomen.

Question 27

hur avläses mRNA?

Answer 27

Ribosomen har tre säten: A, P och E. Vid A sätet binds nya tRNA in och vid P sätet sitter en tRNA med ett växande protein, aminosyran som bärs av tRNA från säte A binder till kedjan av aminosyror från tRNA från säte P och plockar således med alla aminosyror. mRNA går framåt och tRNA hamnar i E sätet där det lämnar ribosomen samtidigt som en ny tRNA med komplementär sekvens binder in i A sätet.