Protein og enzym Flashcards

1
Q

Glutamat

A

Negativt ladet

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Aspartat

A

Negativt ladet

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Lysin

A

Positivt ladet

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Arginin

A

Positivt ladet

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Histidin

A

Positiv / nøytral ved ulike betingelser

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Polyklonale antistoff

A

Populasjon av ulike antistoffer som binder til ulike epitoper på samme antigen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

T-state

A

Hb uten oksygen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

R-state

A

Hb med oksygen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

2,3-bifosfoglyserat

A

Allosterisk effektor for Hb som stabiliserer T-state. Forsinker O2 binding i Hb.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Hbf

A

Føtalt Hb som binder 2,3-BPG dårligere enn HbA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Bohreffekten

A

H+ og CO2 senker pH i blodet og senker affinitet for O2 -> mer O2 frigis fra Hb.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Sigdcelleanemi årsak

A

Mutasjon av protein i røde blodceller: Glu6Val (hydrofil til hydrofob aminosyre).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Proteinrensing: løselighet

A

Utfelling –> dialyse. Høy saltkonsentrasjon minker løselighet for proteiner.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

SDS-PAGE

A

Negativt anion som fester til hver 2. aminosyre. Gir alle proteinene negativ ladning med likt ladning-til-masse-forhold.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Elektroforese

A

Proteiner denatureres og vandrer fra (-) til (+) pol i gelen. Proteiner med lang aminosyrekjede vandrer kortere enn proteiner med små aminosyrekjeder.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Ionebyttekromatografi

A

Proteinblanding vandrer gjennom kolonne med kuler bundet til kation-/anionbytter.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Gelfiltrering(skomatrografi)

A

Proteinblanding vandrer gjennom kolonne med porøse kuler. Små proteiner går innom alle kulene og kommer derfor sist ut av kolonnen. De største kommer ut først.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Affinitetskromatografi

A

Proteinblanding vandrer gjennom kolonne med kuler bundet til en kjemisk gruppe målproteinet er kjent for å binde til.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Oksidoreduktaser

A

Enzymer som oksiderer/reduserer/overfører elektroner

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Transferaser

A

Enzymer som overfører grupper. x: fosfatgrupper

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Hydrolaser

A

Spalter kovalente bindinger ved hydrolyse (opptak av vann). Gir 2 produkter.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Lyaser

A

Lage / fjerne dobbeltbindinger

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Isomeraser

A

isomerisering - intramolekylær rearrangering. x: kiralitet.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Ligaser

A

Forbruker ATP for å koble grupper kovalent. x: sukker-fosfatbinding i DNA.

25
Enzym bygget opp av RNA
Ribozymer
26
K2 / Kcat
Turnover number = Vmax / [E]total
27
Michaelis-menten likningen
V0 = Vmax * ([S] / ([S] + Km)
28
MM: Hva er V0 ved lite substrat
V0 = [S]*Vmax / Km
29
MM: Hva er V0 ved mye substrat
V0 = Vmax
30
MM: Hva er V0 når [S] = Km
V0 = Vmax / 2
31
Allosteriske enzymer
Følger ikke MM-kinetikk. Viser kooperativitet. Sigmoid kurve.
32
Irreversibel hemming
Ødelegger enzymer
33
Selvmordsinhibitor
Penicillin binder kovalent i bindingssetet
34
Penicillin virker på
Enzymet Glycopeptidase transpeptidase i bakterier.
35
Reversibel hemming
Hemming som ikke binder kovalent.
36
Kompetitiv hemming
Hemmer konkurrerer med substratet. Økt [S] motvirker hemming. Øker Km
37
Unkompetitiv hemming
Binder kun til ES-kompleks. Reduserer Vmax, Km uendret. Øke substratmengde hjelper ikke.
38
Nonkompetitiv hemming
Binder både til E og ES. Forutsetter samme bindingsaffinitet til E og ES. Vmax reduseres, Km uendret.
39
Negativ feedback hemming
Sluttprodukt i syntesevei hemmer enzym tidligere i synteseveien. Selvregulerende.
40
Alfa-heliks bindinger
Binder CO og NH i hver 4. aminosyre
41
Beta-flak
H-binding mellom CO og NH mellom naboplater. Anti- eller parallelle flak.
42
Disulfidbroer. S-S.
Mellom cysteiner i ulike kjeder eller samme kjede.
43
Trypsin
kutter bak Arginin eller Lysin.
44
Prolin
Helix-breaker. Gir endringsskift.
45
Kinaser
Enzymer som overfører fosfat fra ATP til en anne forbindelse.
46
Fosfataser
Enzymer som fjerner en fosfatgruppe (defosforylering).
47
Oligomeriske proteiner
Har flere subenheter (kvartærstruktur).
48
Chymotrypsin
Spalter peptidbindinger (inne i polypeptidkjeden).
49
Hemmer som øker Km, men som ikke påvirker Vmax
Kompetitiv hemmer
50
Hemmer som reduserer Vmax, men som ikke påvirker Km
Nonkompetitiv hemmer
51
Hemmer som reduserer Vmax og Km
Unkompetitiv hemmer
52
Høy Km betyr...
At substratet binder svakt til til enzymet - lav affinitet.
53
Lav Km betyr...
At substratet binder sterkt til enzymet - høy affinitet
54
Hvordan kan man beregne katalytisk effektivitet?
Kcat / Km
55
Hvordan transporteres lipider i plasma?
Lipider er relativt lite løselige i vann og blir derfor transportert i sirkulasjon (blodplasma) pakket inn i lipoproteinpartikler.
56
VLDL
Vey low density lipoprotein: Syntetiseres i leveren
57
Leveren sin rolle i kolesterolmetabolismen
Leveren er "sentralstasjonen". Den syntetiserer VLDL som raskt omdannes til IDL (i = intermediate) videre til LDL
58
LDL
Low density lipoprotein: Transporterer kolesterol fra lever til vev. Dårlig kolesterol
59
HDL
High density lipoprotein: Transporterer kolesterol fra vev tilbake til lever. Godt kolesterol