Protéases et inhibiteurs Flashcards
Donner la définition d’une enzyme
Une enzyme est une macromolécule qui agit comme catalyseur à des doses très faibles. Elle est renouvelée à l’identique en fin de réaction.
Qu’est ce qu’une haloenzyme ? De quoi sont elles composées
Les haloenzymes nécessitent des cofacteurs pour leur fonctionnement.
Apoenzyme + cofacteur = haloenzyme
En combien de types de réactions les enzymes sont-elles divisées ?
6 types : oxydoréductases, transférases, hydrolases, lyases, isomérases, ligases
En fonction de quoi les peptidases sont-elles classées ?
En fonction du résidu portant l’activité catalytique
Où les métalloprotéases matricielles sont-elles localisées (au niveau cellulaire)
En extracellulaire et membranaire
V/F : Les métalloprotéases matricielles sont synthétisées sous forme actives
FAUX - sous forme inactive
Quel est le coenzyme des métalloprotéases matricielles ?
Un atome de Zinc
Quelle est la fonction des métalloprotéases matricielles ?
Résorption matricielle et clivage des protéines membranaires
Citer des processus physiologiques dans lesquels les métalloprotéases sont impliquées
Embryogenèse, cicatrisation, inflammation, évolution utérine
V/F : Un déséquilibre MMPs / TIMPs peut être à l’origines de processus pathologiques
VRAI - syndromes inflammatoires, cancers,…
Qu’est ce que les TIMPs et comment agissent-ils ?
TIMPs = Inhibiteurs spécifiques tissulaires
Inhibition équimolaire, non covalent et réversible des MMPs
V/F : la plupart des mutations des MMPs ne concernent pas directement les gènes
VRAI - la plupart du temps mutation des promoteurs et pas des gènes en eux-mêmes
Quels sont les substrats des MMPs ?
Ensemble des constituants de la MEC (collagènes, protéoglycanes,…), facteurs de croissance, récepteurs,….
Qu’est ce que la polyarthrite rhumatoïde et quel est le lien avec les MMPs ?
Il s’agit du rhumatisme inflammatoire chronique le plus fréquent : inflammations synoviales agressives.
De nombreuses MMPs sont exprimées dans les cellules osseuses et peuvent donc être impliquées (MMP3 marqueur ++ de l’inflammation articulaire)
V/F : les MMPs sont surexprimées dans presque tout les cancers
VRAI - elles interviennent dans la phase d’initiation, de croissance et d’angiogenèse
V/F : certaines MMPs ont un rôle protecteur dans le développement tumoral
VRAI - certains cancers épithéliaux
V/F : Les TIMPs ont pour seul rôle l’inhibition des MMPs
FAUX - ils ont des rôles multiples, d’où leurs effets antagonistes lorsqu’ils sont utilisés thérapeutiquement
A quel type de protéases appartiennent les enzymes du tube digestif ?
Protéases à Sérine
Quelle est la “forme” de la trypsine et au niveau de quels résidus coupe-t-elle ?
Asp au fond de la poche attirante les résidus +
=> Coupe côté C-ter des Lys et Arg
Quelle est la “forme” de la chymotrypsine et au niveau de quels résidus coupe-t-elle ?
Grande poche avec des résidus hydrophobes attirant les AA aromatiques
=> Coupe côté C-ter des Phe, Met, Trp, Tyr
Quelle est la “forme” de l’élastase et au niveau de quels résidus coupe-t-elle ?
Poche rétrécie par des résidus Val et Thr (donc petits AA)
=> Coupe côté C-ter des résidus neutres
Par quel ion la trypsine est-elle stabilisée ?
Ca2+
V/F : La production de trypsine est diminuée dans la mucoviscidose
VRAI - Explique es obstructions intestinales
Où la trypsine est-elle synthétisée et activée ?
Synthétisée dans le pancréas, activée dans le petit intestin
V/F : les protéases à sérine ont un rôle majeur dans la coagulation sanguine
VRAI - une cascade de signalisation de protéases à Sérine aboutit à la formation d’un caillot sanguin, une déficience en protéases de l’hémostase peut donc mener à de l’hémophilie
Combien de protéases composent le système du complément ?
35 protéases à Sérine - 13 directement impliquées et 22 régulateurs de l’activité des premières
V/F : Une déficience en protéases du complément est à l’origine de maladies rares
VRAI - infections de différents types en fonction de la voie d’activation touchée
Donner la définition des Serpines
C’est une famille de 49 protéines inhibitrices des protéases à Sérine (entre autres). Elles fonctionnent avec des cofacteurs qui potentialisent leur action
Quelles sont les similitudes des structures secondaires des serpines ?
- 3 feuillets bêta
- 8 ou 9 hélices alpha
- 1 domaine réactionnel : RCL
- Des zones de mutations
Quel est le mécanisme d’inhibition des serpines ?
Elles agissent comme pseudo-substrat et inhibent la protéase à Sérine de façon irréversible en s’y liant de façon covalente
V/F : Les serpines circulent toutes sous forme actives
FAUX - Certaines circulent sous forme R inactive : mécanisme d’auto-inactivation spontané
Quelles sont les 3 conséquences que peut avoir la mutations d’une serpine sont son fonctionnement ?
1) Modification dans le repliement 3D : polymère thermostable et non inhibant
2) Serpine sous forme latente : délocalisation d’AA
3) Mutation dans le RCL : serpine clivée, changement de la spécificité
Qu’entraîne un déficit en alpha1-antitrypsine ?
Destruction des alvéoles pulmonaires / pathologie autosomique récessive
Quelles sont les 3 étapes du mécanisme d’inhibition de l’alpha-2-macroglobuline ?
1) Coupure de l’enzyme - déséquilibre structure
2) Rupture d’une liaison thioester et fixation de la protéase
3) Changement de conformation de l’alpha-2-macro : protéase piégée et séquence de reconnaissance du récepteur exposée
V/F : Le polymorphisme d’alpha-2-Macroglobuline est associé à la maladie d’Alzheimer
VRAI
V/F : L’alpha-2-Macroglobuline inhibe uniquement la fibrinolyse
FAUX - A la fois la fibrinolyse et la coagulation
V/F : Les protéases à Aspartate contiennent 1 Asp dans leur site actif
FAUX - 2 Asp
A quel pH (acide/neutre/basique) les protéases à Aspartate sont-elles actives ?
A pH acide et parfois neutre
Quel est le rôle du/des Asp du site catalytique des protéases à Aspartate ?
2 Asp : un accepteur de proton d’H2O et un donneur de substrat
Donner 4 exemples de protéases à Asp
1) Pepsine
2) Chymosine
3) Cathepsine D
4) Protéase du VIH
Comment les protéases à Cystéine sont-elles également appelées ?
CASPASES
Combien de caspases ont été identifiées ?
12 divisées en 2 groupes : apoptotiques et inflammatoires
V/F : L’activation des caspases peut se faire par 2 voies
VRAI - Intrinsèque ou extrinsèque
Quels sont les 2 types de régulateurs de l’activation des caspases ?
FLIP (voie extrinsèque) et IAP (voie intrinsèque)
Citer des inhibiteurs naturels de caspases
p35, p49, CrmA
Où les protéases à Thréonine sont-elles exprimées ?
Protéasome - elles forment les SU catalytiques
Qu’est ce que le protéasome ?
Un complexe multiprotéique ayant pour fonction l’élimination des protéines dégradées ou mal repliées (polyubiquitinylées)
De combien de complexes est composé le protéasome ? Lesquels ?
3 complexes :
- Un 20S catalytique : 2 anneaux ext pour régulation et 2 anneaux int pour catalyse)
- Deux régulateurs : 19S et 11S
Quel est le mécanisme d’action du complexe 19S du protéasome ?
Régulateur -
1) Reconnaisance de la protéine
2) Dépliement et ubiquinilation
3) Ouverture des pores et passage de la protéine dans le complexe 20S
Quel est le mécanisme d’action du complexe 20S du protéasome ?
Catalytique -
1) Clivage des protéines par 7 SU de 3 types
2) Relargage des polypeptides
Dans quel processus cellulaires important le protéasome a-t-il un rôle majeur ?
Régulation du cycle cellulaire, apoptose, stress cellulaire, système immunitaire
