Prokariotų transkripcija

Question 1

SKirtumai tarp DNR ir RNR
(rnr ypatybės)

Answer 1

RNR cukrus - ribozė;
Rnr - viengrandė, susintetinama transkripcijos metu;
bazės yra ACGU;
antrinė struktūra sudaryta iš A dvigrandės, kurią formuoja trumpos sekos
RNR tranksriptai trumpesni nei DNR;
RNR gali formuoti 3D struktūras;

Question 2

Transkripcija

Answer 2

procesas, kurio metu pagal matricą (DNR grandinę) susintetinama jai komplimentari RNR molekulė

Question 3

kas yra genas molekuliniame lygmenyje

Answer 3

transkripcijos vienetas

Question 4

matricinė grandinė

Answer 4

DNR grandinė, pagal kurią sintetinama RNR transkripcijos metu

Question 5

koduojančioji grandinė

Answer 5

komplimentari matricinei DNR grandinė

Question 6

transkripcijos vienetas

Answer 6

transkribuojama sritis nuo promotoriaus iki terminatoriaus

Question 7

priešsrovinės (upstream) sekos

Answer 7

nukleotidų sekos, esančios koduojančioje grandinėje pirmojo transkribuojamo nukleotido priekyje

Question 8

pasrovinės (downstream) sekos

Answer 8

nukleotidų sekos, esančios už pirmojo transkribuojamo nukelotido

Question 9

kas yra promotorius

Answer 9

DNR nukleotidų seka, aktyvinanti transkripciją;
transkripciją valdanti DNR sritis, kurią atpažįsta transkirpcijos veiksniai/RNR polimerazė, prie jos jungiasi ir pradeda RNR sintezę (transkripcijos iniciacija).

Question 10

iRNR

Answer 10

ribosomų prisijungimo sritis; netoli šios vietos prasideda transliacija

Question 11

policistroninė

Answer 11

transkriptas gali koduoti daugiau nei vieną polipeptidą

Question 12

RNAP sudarantys subvnt skirstomi į funkcines grupes:

Answer 12

• subvnt, reikalingi fermento susimontavimui
• subvnt, kurie sudaro aktyvųjį centrą ir prijungia bri išdėsto DNR ir RNR molekules
• pagalbiniai subvnt

Question 13

RNR polimerazės sandara

Answer 13

šerdinė dalelė ( iš 5 subvnt - b‘, b, 2a (aI ir aII), w)
holofermentas (šerdinė dalelė + sigma baltymas)

Question 14

RNR polimerazių sudėtyje esantys judrūs katalizinio centro elementai:

Answer 14

• BH spiralė
• TL kilpa

Question 15

kas sudaro aktyvųjį centrą fermento kanale

Answer 15

konservatyvios RNR pol aminorūgščių liekanos

Question 16

kas cheluoja Mg2+ jonus

Answer 16

3 asparto a. r., esančios konservatyviame NADFDGD b’ subvieneto motyve

Question 17

katalizinė kilpa

Answer 17

gyvybiškai svarbios polimerazės asparto liekanos b’ subvienete

Question 18

ką daro RNR polimerazė

Answer 18

sintetina RNR molekulę de novo (be pradmens)

Question 19

kas yra pirmasis polimerazės jungiamas nukelotidas

Answer 19

ATP arba GTP

Question 20

katalizins centras

Answer 20

i ir i+1

Question 21

kokiamr transkripcijos vienete vyksta RNR sintezė

Answer 21

transkripcijos burbule, kur DNR grandinės yra laikinai išskirtos

Question 22

ką daro rifamicinai

Answer 22

stabdo transkripcijos elongaciją (trukdo susintetintos RNR išėjimui polimerazės kanalu, kai ji pasiekia 2-3nt ilgį)

Question 23

ką daro streptolidiginas

Answer 23

prisijungia netoli aktyviojo centro ir susiriša su jo “judrimis dalimis” - BH ir TL

Question 24

ką daro mikrocinas J25

Answer 24

prisijungia prie “piltuvo” ir trukdo substratų patekimui

Question 25

kam reikalingas sigma veiksnys

Answer 25

jis žymiai padidina holofermento giminingumą promotorių DNR

Question 26

su kuo sąveikauja sigma veiksnys holofermente

Answer 26

su šerdinės dalelės b ir b' subvnt

Question 27

ką daro pagrindinis sigma veiksnys

Answer 27

dalyvauja genų, reikalingų normaliam jos augimui, transkripcijoje

Question 28

ką daro alternatyvieji sigma veiksniai

Answer 28

dalyvauja genų, indukuojamų įvairių aplinkos veiksnių, transkripcijoje

Question 29

kokie sigma veiksniai su kokiomis struktūromis sąveikauja

Answer 29

sigma2 su promotoriaus -10 sigma4 su promotoriaus -35

Question 30

už ką atsakingas sigma2 srities 2.3 elementas

Answer 30

už promotoriaus DNR duplekso grandinių išskyrimą per transkripcijos iniciaciją

Question 31

sigma sritis 1.1

Answer 31

auto slopinimo funkcija