Eukariotų transkripcija Flashcards
ką sintetina RNR pol I
rRNR (18S, 5.8S, 28S) geno primtaką branduolėlyje
ką sintetina RNR pol II
visas iRNR nukleoplazmoje’ transkribuoja miRNR, kai kurias snRNR
ką sintetina RNR pol III
tRNR, 5S rRNR, snRNR ir kitas mažas RNR nukleoplazmoje
ką sintetina RNR pol IV ir V
transkriptus augalų ląstelių branduolyje; dalyvauja nuo RNR priklausomame genų tildyme
ką daro mitochondrijų RNR pol ir į ką panaši
sintetina mitochondrijų genų koduojamus transkriptus.
Panaši į bakteriofagų RNR polomerazes
ką sintetina chloroplastų RNR pol ir į ką panaši
sintetina chloroplastų genų koduojamus transkriptus. Panaši į bakterijų RNR polimerazę
kas yra eukariotų RNR pol slopiklis ir ką slopina
α amanitinas – slopina
RNR Pol II ir RNR Pol III
kam reikalingi transkripcijos veiksniai
jie atpažįsta promotorių
kur sutelkta ir ką transkribuoja RNR pol I
Sutelkta branduolėlyje – branduolio erdvės skyriuje, kur vykstapre-rRNR transkripcija ir brendimas.
Transkribuoja rRNR pirmtako geną - pre-rRNR
ką daro IGS
skiria transkripcijos vienetus
šerdinio rRNR promotoriaus sandara
+1;
daug GC;
AT turtingas ribosominis inicijatorius rInr
kas yra UCE (arba UPE)
šerdinio rRNR pormotoriaus priekyje esantis kontrolės elementas
kur yra I-o ir II-o tipo promotorių sekos
genų viduje
Pagrindinė TFIIIC veiksnio funkcija
prijungti TFIIIB
kas yra TFIIIB
veiksnys, kuris įeina į transkripcijos iniciacijos kompleksų sudėtį.
Jis atpažįsta visų tipų RNR pol III promotorius
kokiame etape valdoma struktūrinių genų raiška
valdomatranskripcijos iniciacijos etape
Transkripcijos
genų kompleksą sudaro
RNR polimerazė II ir transkripcijos veiksniai
RNR pol II aktyviajame centre esantys judrūs elementai:
BH spiralė
TL kilpa
ką daro transkripcijos veiksniai
- Tiesiogiai sąveikauja su trumpomis savitosiomis DNR sritimis promotoriuose ir stiprikliuose;
- Didina
transkripcijos iniciacijos dažnį.
ką daro koveiksniai
- tiesiogiai prie DNR nesijungia
- Per tikruosius transkripcijos veiksnius pritraukiami į transkripcijos vietą ir dalyvauja transkripcijos valdyme
- Tam tikri koveiksniai keičia chromatino struktūrą
kam reikia pagrindinių TV
bazinei tranksripcijai
ką daro TFIID
atpažįsta šerdinių promotorių elementus
ką atpažįsta TFIIB
BRE elementą
kas yra enhantsosoma
kompleksas, kuris susimontuoja kaip atsakas į interferoną ties stiprikliu
ką daro izoliatoriai
”Žymi“ ribą tarp heterochromatino ir euchromatino (neleidžia “plisti” heterochromatinui į transkripciškai “aktyvias” sritis)
kaip formuojamas PIC
pagr veiksniai kartu su RNR pol II sudaro transkripcijos aparatą ir formuoja transkripcijos preiniciacijos kompleksą
RNR pol II PIC komplekso sandara
TBP baltymas ir transkripcijos veiksniai – TAF’ai
TBP baltymas yra:
- universalus baltymas visų eukariotinių branduolio RNR polimerazių transkripcijos veiksnių sudėtyje
-Atsakingas už sąveiką su TATA sritimi, tačiau jungiasi prie promotorių įvairiais būdais, taip pat ir prie tų, kurie neturi TATA
ką daro TFIIA
- stabilizuoja TBP/DNR sąveiką;
- neleidžia jungtis slopikliams;
- skatina prisijungti TFIIB.
ką daro TFIIF
- tiksliai įjungia RNR Pol II į PIC kompleksą, išdėsto +1 at atžvilgiu
- neleidžia RNR Pol II neatrankiai sąveikauti su DNR.
ką daro TFIIE
- įtraukia į PIC kompleksą TFIIH veiksnio kinazės modulį CAK
- reikalingas pereiti iš iniciacijos į elongacijos fazę
kokie TFIIH fermentiniai aktyvumai
- dvi helikazės, XPB ir XPD
- nuo ciklinų priklausoma baltymų kinazė cdk7-ciklinas H
kas yra ir ką daro mediatoriaus kompleksas
Baltymų kompleksas, svarbus beveik visų
genų transkripcijai;
Jis jungiasi ir su transkripcijos veiksniais ir su
RNR Pol II. Aktyvina ir slopina tranksripciją
kokios yra CTD formos
- hiperfofosforilinta, RNAPIIO ( >50 a. r. fosforilinta);
- hipofosforilinta, RNAPIIA (mažai liekanų fosforilinta)