Primer Parcial Flashcards
Conjunto de estrategias y tecnologías empleadas para la caracterización molecular del genoma.
Genómica
Estudio de las técnicas y estrategias necesarias para obtener tanto los mapas básicos del genoma, posibles a distintos niveles de resolución, como la secuencia completa del DNA genómico, o mapa basico a la resolución máxima, el nucleótido individual.
Genómica Estructural
Estudio del conjunto de todas las proteínas originadas por el genoma: expresión génica a proteínas, modificación y degradación de éstas y desarrollo de su función.
Genómica Funcional
El fenotipo
Genotipo + Ambiente + Historia de Vida + Epigenética
Secuencia de DNA, tanto nuclear como mitocondrial.
Genotipo
Colección de tus rasgos observables, además de su secuencia de ADN
Fenotipo
Estos rasgos son de gran importancia para las aplicaciones clínicas de la genómica:
✣ Gobiernan la susceptibilidad a la enfermedad y los factores de riesgo
✣ Determinan la efectividad de medicamentos en diferentes individuos.
✣ Permiten la prevención y el tratamiento personalizados de enfermedades basadas en secuencias de ADN o farmacogenómica.
Todas las células de tu cuerpo, excepto los ……… , tienen casi la misma secuencia de ADN
espermatozoides, los óvulos y las células del sistema inmunitario
La propia historia de vida de tus
padres podría haber alterado los ———
en sus células
patrones epigenéticos
Un genoma restringe pero no ——– las características de un organismo.
dicta
Cambio en el color del cabello, los
tatuajes, la cirugía estética y la
“endocrinología estética”
interposición entre el genotipo y el fenotipo:
Representan el 21% y el 13% del genoma.
Los elementos intercalados largos y
cortos (LINES y SINES)
Pueden aparecer como decenas o
cientos de miles de copias, 15% del
genoma.
Los minisatélites y microsatélites
Algunas regiones del genoma son relativamente pobres en genes codificadores
de proteínas
subteloméricas en todos los
cromosomas, y los cromosomas 18 y X.
Los cromosomas que son relativamente
ricos en genes codificadores de proteínas.
19 y 22
Regiones empalmadas de ARNm y no traducidas a
proteínas
Intrones
Es lo que causa las diferencias de tamaño entre los
genes que codifican proteínas
La variabilidad en el tamaño del intrón
Un locus genético codificador de proteínas contiene
los exones e intrones, con sitios de señal de splicing en las uniones intrón-exón.
A menudo, en la vecindad de un gen existen un conjunto de genes estrechamente
relacionados. esto se debe a que un mecanismo común de evolución es …
la duplicación de genes
seguida de divergencia.
El Proyecto Genoma Humano se inauguró formalmente en
1990
4 métodos para secuenciar el ADN basado en la terminación del alargamiento de la cadena durante la síntesis
Secuenciación de ilúmina, torrente de iones, sola molécula y poros
Cada cadena de molde se adhiere a un primer y comienza la amplificación por PCR. En cada ciclo, la cadena de ADN alargada de cada primer está anclada en su lugar en un extremo, pero está libre en el otro extremo para formar un bucle y emparejarse con un
primer casi complementario (el método se llama PCR puente).
El resultado de múltiples rondas de PCR es un pequeño grupo de productos de PCR
idénticos
Seq Ilumina
Estos productos ahora sirven como
templados de secuenciación
En este caso, los adaptadores de PCR terminan en grupos químicos que se adhieren a cuentas microscópicas
Cada vez que se una un nucleótido a la cadena complementaria se generará una variación de pH en
micro pozo que es detectado por un semiconductor
Secuenciación de torrente de iones
En este método, cada uno de los nucleótidos con una sonda fluorescente se agrega uno a uno al
chip, en cualquier cámara en la que se incorpora un nucleótdo, se libera una señal.
Secuenciación de una sola molécula de DNA
En este método, el templado es una cadena larga monocatenaria de ADN que es reconocida por una proteína motora que se une a la cadena y la impulsa a través de un canal en una proteína transmembrana.
Secuenciación de nanoporos
Son posibles lecturas de 50 kb y más con este dispositvo, pero dichas lecturas largas pueden tener tasas de error superiores al 10%
Secuenciación de una sola molécula de DNA
El principal inconveniente es que los nucleótdos pueden pasar sin detección, se pueden agregar
nucleótidos fantasmas o se pueden llamar incorrectamente, cada tipo de error ocurre a una tasa de hasta 5 a 10 por ciento.
Secuenciación de nanoporos
Es cualquier de los cromosomas, excepto los cromosomas sexuales.
Un autosoma
El Cromosoma 1 tiene unos 800 genes, mientras que el Cromosoma 22 contiene alrededor de 750 genes. Esto se debe a que:
Los autosomas están numerados según su tamaño
Mendel estudió rasgos que incluían atributos
como la altura y la forma de la semilla
La variación en cada uno de estos rasgos está causada por
la presencia de diferentes alelos en
loci individuales.
Principio de la herencia dominante y recesiva
Primer principio de la herencia de Mendel
Este principio dice que los genes de diferentes locus se transmiten de manera independiente.
Un locus puede tener el alelo «liso» o el alelo «arrugado», y el otro puede tener el alelo «alto» o el alelo «bajo».
Tercer principio de la herencia de Mendel
En los organismos que se reproducen sexualmente tienen genes que aparecen en parejas y que sólo un miembro de esta pareja se transmite a la descendencia (se segrega).
Segundo principio de la herencia de Mendel
Enfermedad autosómica recesiva en la que sólo se ve afectado el homocigoto recesivo.
Fibrosis Quística
Ejemplo de ello es la enfermedad recesiva fenilcetonuria (PKU), que se observa aproximadamente en uno de cada 10.000 nacimientos europeos.
El mismo genotipo puede producir diferentes fenotipos en diferentes ambientes.
La mayoría de las veces la descendencia afectada se produce por la unión de un progenitor no afectado con un heterocigoto afectado.
La mitad de los hijos serán heterocigotos
y expresarán la enfermedad, y la otra mitad
serán homocigotos no afectados
Enfermedades autosómicas dominantes
Progenitores con riesgo de tener hijos con una enfermedad genétca desean conocer el
riesgo, o probabilidad, de que sus futuros hijos estén afectados.
Si un progenitor está afectado por una enfermedad autosómica dominante y el otro no, el ———- de cada hijo es de 1/2
riesgo de recurrencia.
Ambos progenitores de individuos afectados son portadores heterocigótcos.
Herencia autosómica recesiva
Explica el cuadro de punett de la Herencia autosómica recesiva
- ¼ de los hijos de dos heterocigotos serán homocigotos no afectados -½ serán portadores heterocigótcos sin afectación fenotípica -¼ serán homocigotos afectados
El emparejamiento más frecuente en la enfermedad recesiva es el de:
2 progenitores portadores heterocigóticos.
¼ de los hijos de este emparejamiento serán homocigótcos para el gen de la enfermedad y
por tanto estarán afectados
Factores que afectan a la expresión
de los genes causantes de enfermedad
Mutación de novo, Mosaicismo, Penetrancia reducida y de edad, pelíotropia, expresión variable y consanguinidad
Si un niño nace con una enfermedad genética que no ha aparecido previamente en la familia
Mutación de novo
Causa la mutación de novo
Esto significa que el gen transmido por uno de sus progenitores sufrió una alteración en la secuencia del DNA, que provocó una mutación de un alelo normal a
un alelo causante de enfermedad.
En ocasiones, dos o más hijos presentan una enfermedad autosómica dominante o ligada al cromosoma X sin que haya antecedentes familiares de la enfermedad.
Mosaicismo de línea germinal
Causa Mosaicismo de línea germinal
Durante el desarrollo embrionario de uno de los progenitores, se produjo una
mutación que afectó a la totalidad o a
parte de las células de la línea germinal
Una persona con un genotipo causante de enfermedad podría no mostrar el fenotipo de la enfermedad en absoluto a pesar de que puede transmitir el alelo causante de enfermedad a la generación siguiente.
Penetrancia reducida
Ejemplo de Penetrancia reducida
Retinoblastoma
El retraso en la edad de inicio de una enfermedad
Penetrancia dependiente de la edad
Grado de gravedad del fenotipo de la enfermedad.
Expresión variable
Genes que provocan más de un efecto en el cuerpo
Pleiotropía
Ejemplo de Pleiotropía
Sx de Marfaran
Las uniones consanguíneas tienen más probabilidades de producir hijos afectados por
trastornos autosómicos recesivos.
Cuanto más rara es la enfermedad recesiva, más probabilidades hay de que
los progenitores de un individuo afectado sean consanguíneos.
Trimetilaminuria es un ejemplo de
autosómica recesiva
Fenilcetonuria es un ejemplo de
-
Corea de Huntington es ejemplo de
Asociada a edad
Sx de Kniefelter es ejemplo de
-
