Premier examen Flashcards
Présence de traduction cotranscriptionnelle
Procaryotes
Présence d’opérons
Procaryotes
Présence d’épissage
Eucaryotes
La transcription d’un opéron donne
ARNm polycistronique
Transcriptome
ARN exprimé à partir de l’ADN (75% du génome)
Rôle du promoteur de gène
Indique à la ARN polymérase de s’arrêter et de commencer à transcrire (initiation de la transcription)
4 sous-unités de l’ARN polymérase bactérienne
Alpha (se lie au promoteur), Bêta (se lie au nucléotide), Bêta’ (se lie à l’amorce) et sigma (initiation)
La sous-unité dans l’ARN polymérase bactérienne qui varie le plus et permet d’assurer la spécificité dans le choix des site de transcription.
Sigma
Rôles des 3 types d’ARN polymérase eucaryotes
I : transcrit les ARNr (dans le nucléole), II : transcrit les ARNm (nucléoplasme), III : transcrit les petits ARN (ARNt et autres)(nucléoplasme)
Principales composantes du complexe Pol II-ADN-ARN
- Attache (piège l’ADN dans le sillon)
- Entonnoir (Entrée des NTPs)
- Ion catalytique Mg2+
- Gouvernail (Dissociation ARN-ADN et association ADN-ADN)
- Pont (bouge à l’ajout des nt)
- Mur (Dirige ADN et ARN à l’extérieur du site actif)
Indique la terminaison transcriptionnelle chez les bactéries (terminateur)
Séquence palindromique qui forme une structure tige-boucle
Quelle est l’utilité du facteur Rho chez les bactéries?
Reconnaît le site de liaison, puis migre vers la polymérase (5’ vers 3’) pour décrocher l’ARN et la polymérase de la bulle transcriptionnelle.
Les différents partie de l’opéron lactose
- Gène Lac I (I) : encode la protéine répresseur de la transcription de l’opéron
- Promoteur (P) : séquence où l’ARN polymérase se lie
- Opérateur (O) : Séquence reconnut par le répresseur
Impact du glucose sur l’opéron lactose
Quand le glucose est haut, l’AMPc est moins élevée. Quand il est bas, la grande quantité d’AMPc se lie à la protéine CAP qui se se lie à la polymérase et augmente la transcription.
Spécificités de l’opéron arabinose
- Le répresseur AraC exprimé par la séquence araC change de conformation avec la liaison de l’arabinose et le gène est exprimé
- présence de 2 opérateurs sur l’opéron
Dans cet opéron, l’opérateur et le promoteur sont superposés. La polymérase est repoussée par le dimère répresseur lié au tryptophane.
L’opéron trp (tryptophane)
Ce qui se passe si le ribosome intègre rapidement le tryptophane dans l’opéron trp
La transcription est bloquée, l’ARNm adopte une conformation tige-boucle 3-4 terminateur
Ce qui se passe si le ribosome n’intègre pas de tryptophane dans l’opéron trp
Le ribosome ne peut pas continuer la traduction comme le tryptophane n’est pas disponible donc il reste bloqué et l’ARNm adopte une conformation tige boucle 2-3 anti-terminateur qui permet la transcription.
Comment se compose la coiffe de l’extrémité 5’ des ARNm?
Le 7-méthyl guanosine est ajouté via le pont 5’-5’ triphosphate avec la guanylyl transferase. On obtient 7 G un à la suite de l’Autre
Fonctions de la coiffe et de la queue poly-A des ARNm
- Protège l’ARNm de la dégradation par les exonucléases 5’ vers 3’ (ou 3’ vers 5’) (maintien de la stabilité)
- Aide au transport des ARNm à l’extérieur du noyau
- Aide à la reconnaissance des ARNm par les protéines
Maturation des ARNm
- Coiffe 5’
- Polyadénylation 3’
- Épissage
Réactions pour la polyadénylation 3’
- Clivage de la région 3’ variable (10-35 nt)
- Synthèse de la chaîne poly-A par la poly-A polymérase (PAP)
Mécanisme moléculaire de l’épissage
- Première transestérification qui libère l’exon 1 en 5’
- Deuxième transestérification qui fait avec l’exon 1 qui se colle à l’exon 2 pour éjecter l’intron
Le splicéosome
- permet l’épissage dans un processus complexe
- 2 ions Mg2+ coordonnés par une métalloenzyme
Gène qui présente un cas d’épissage alternatif où un seul exon est exprimé dans chaque région
Gène DSCAM chez la drosophile
2 manières d’avoir des ARN circulaires
- Back-splicing où l’extrémité 5’ reconnaît la 3’ et forme un CircRNA qui est très stable contre les exonucléases
- Lariats introniques (introns rejetés) qui peuvent être stable
À quoi sert le domaine C-terminal (extended CTD) de RPB1
Plateforme pour le recrutement de protéines qui vont agir sur la maturation grâce à la phosphorylation de résidus par des kinases
Avantages de déplacer l’ARNm dans la cellule selon ses séquences plutôt que la protéines déjà traduites
- Économie d’énergie
- Évite les erreurs de localisation
- Assemblages co-traductionnels
- Expression modulée par l’environnement
Les pré-ARNr sont flanqués de séquences qui permettent…
La formation de tiges boucles qui sont ensuite clivées dans la partie double brin par l’ARNase III
Utilité des snoARNs
- Dérivent des introns des ARNm
- Guide la maturation en faisant des modifications sur les pré-ARNr
Enzyme qui permet la coupure du coté 5’ pour la maturation des ARNt
L’ARNase P
Séquence ajoutée à l’extrémité 3’ des ARNt lors de leur maturation
CCA par la tRNA nucléotdidyl transférase
Définition de l’interférence par ARN
Processus par lequel de petites molécules
d’ARN , de source exogène ou endogène, peuvent moduler l’expression génique,
typiquement en causant la dégradation ou l’inhibition d’un long ARN complémentaire
Le mécanisme des ARN interférents
Le complexe siRNA-RISC s’associe à l’ARNm pour le cliver avec l’activité endonucléase de RISC donnée par la protéine argonaute
Mécanismes des miARNs
- Appariement imparfait: miARN
inhibe la traduction de l’ARNm en
protéine. - Appariement parfait: miARN
induit dégradation de l’ARNm
cible
