Cours 5 à 8 Flashcards
Expression dans l’euchromatine et l’hétérochromatine
Euchromatine (non condensée) : régions riches en gènes
Hétérochromatine (condensée) : régions pauvres en gènes
Phase des chromosomes dans un karyotype
Métaphase arrêtée avec la colcemid
Nombre de molécules d’ADN chez un cellule en métaphase
92 molécules d’ADN
(23 paires ou 46 chromosomes répliqués)
Étapes de la mitose
- Prophase : chromatides sœurs sont condensées et liées
- Métaphase : Alignement des chromosomes sur l’axe
- Anaphase : séparation des chromosomes
- Télophase : cytocinèse
Types de chromosomes selon le centromère
I: Télocentrique - centromère près de
l’extrémité, bras court (p) presqu’invisible
II: Acrocentrique – bras long (q) beaucoup plus long que le bras court (q),
mais pas autant que télocentrique
III: Submétacentrique - p et q sont similaires mais pas égaux
IV: Métacentrique – p et q sont de tailles plus ou moins égales
Méthodes d’observation des chromosomes
- Cartographie cytogénétique
- Cartographie haute résolution
- Analyse par PCR et séquençage
Nombre de chromosomes anormal souvent observé dans les cancers
Aneuploïdie (dans le développement seulement 0,3% sont viables)
Une recombinaison homologue non allélique (pas la bonne séquence qui s’aligne) peut causer
Des duplications, des délétions, des inversions et des translocations
Concept de synténie
conservation évolutive de blocs de séquences lorsque deux groupes de chromosomes d’espèces différentes sont comparés
Le transposon Mariner
Il est autonome et utilise le concept «couper-coller» avec la Tpase qui se lie aux séquences ITR et ensuite la séquence est déplacée dans un autre dinucléotide TA
Que sont LINE, SINE et LTR et comment sont-ils déplacés?
Ce sont des rétrotransposons et utilisent le concept de «copier-coller». Il sont d’abord transcrit, puis réintégrés plus loin dans le génome
Caractéristiques des LINE-1
- Sont autonomes
- Possèdent 2 séquences codantes (ORF1 et ORF2)
- La réverse-transcriptase codée par ORF2 possède une faible processivité qui cause un transcription tronquée généralement
Ils dépendent de la machinerie des LINE et ne contiennent pas de protéine encodée
Les séquences Alu (SINE)
Sont des séquences encodant une enveloppe virale qui sont devenues non fonctionnelles au cours de l’évolution
Les rétrotransposons LTR (sont très similaires aux LINE1 dans leur mécanisme)
Définition pression sélective
Si la fonction du gène est importante pour la survie des cellules ou de l’organisme:
les mutations délétères seront perdues au cours de l’évolution car individus ou cellules ne pourront pas les transmettre aux
générations subséquentes
Par contre, une mutation bénéfique (long cou) sera conservée dans l’évolution
Raisons pourquoi les éléments mobiles sont conservés
- Possiblement impossible de s’en débarrasser étant donné leur nombre
- Les événements délétères sont rares (à l’échelle d’une espèce) donc la pression sélective est faible
- Génèrent de la diversité qui est peut-être bénéfique à l’échelle d’une espèce sur des temps évolutifs
Provenance du exon shuffling
La recombinaison entre des séquences répétitives permet une recombinaison homologue qui entraîne des réarrangements chromosomiques
Définition de paralogues
Duplication d’un gène qui permet sa spécialisation (sub-fonctionnalisation) ou l’acquisition d’une nouvelle fonction (néo-fonctionnalisation)
Définition pseudogènes
Sont des paralogues qui deviennent inactifs après une redondance (pas de pression sélective à le garder comme ne sert à rien)
Peuvent aussi être exprimés et deviennent ARN interférents
Les gènes de globines sont un exemple de
paralogues
cause l’anémie (perte de fonction des globules rouges) due à une synthèse anormale des chaînes de globine (nombre de gène est réduit et formation d’un gène hybride anormal dont l’expression réduite)
Thalassémie (syndrome de Lepore)
Encodent les ARN de transferts utilisés lors de la transcription des ARN messagers en protéine; transcrits par la ARN polymérase III
tDNA
Définition de gènes répétés en tandem
Gènes se suivent en répétitions toutes identiques et sont séparés par des séquences non-transcrites
Exemple de gènes en tandem
- ARNr, chez l’humain, blocs de 300-400 copies sur 5 chromosomes
- gènes d’histones, nombre de copies égal pour les 5 types d’histones pour éviter les histones libres qui ferait précipiter
Séquences obtenues par cross-overs qui s’accumulent avec le vieillissement et qui empêche la machinerie de réplication de jouer son rôle en séquestrant
« extra-chromosomal ribosomal circles » ou ERC
Qu’est-ce qui se passe lors d’erreur dans les séquences en tandem?
La conversion génique homogénéise les séquences entre elles. C’est une recombinaison qui est conservatrice puisqu’une seule répétition est modifiée en se basant sur l’autre. La fréquence est augmentée par la proximité
Séquences relativement courtes répétées en tandem (short tandem repeats ou STR)
ADN satellite
Comment sont générées les ADN satellite
Glissement ou mauvais appariement
Le polymorphisme de quelles séquences est utilisé en médecine légale?
STR