Predicción Proteínas + Dinámica Molecular Flashcards
1
Q
Fuerza entre dos moléculas con carga
A
2
Q
Potencial
A
3
Q
Energía potencial de enlace
A
4
Q
Energía potencial de enlace
A
5
Q
Energía potencial de ángulo de enlace
A
6
Q
RMSD
A
Root mean square deviation = raíz de la desviación cuadrática media de las posiciones de los átomos, distancia promedio entre los átomos en posición inicial y “actual” a lo largo del tiempo (gráfico distancia vs tiempo)
7
Q
RMSF
A
Root mean square fluctuation = Fluctuación cuadrática media (gráfico nm vs residuo)
8
Q
Estudios estructurales y dinámicos
A
Exploración conformacional
Refinamiento del modelo
9
Q
Perturbaciones que se pueden estudiar con Din Mol
A
- añadir/remover ligando
- aplicar fuerza mecánica
- app potencial externo
- mutación / modificación
- e° de protonación
- alterar ambiente prot
10
Q
Procesos estudiados con Din Mol
A
- transporte membrana
- cambio conformacional
- plegamiento
- union de ligando y vías de ensamblado
