PowerPoint 5 Flashcards
Agrobacterium tumefaciens
- bactérie gram négative
- maladie: galle du collet chez certaines plantes
- implique la transfert d ’ADN
étapes de l’infection
• attachement • ancrage • transfert d’ADN • formation des tumeurs
produit qui induit les gènes de virulence (vir) chez Agrobacterium
l’acetylsyringone
site d ’attachement chez la bactérie
LPS, et les produit des gènes chvAB, exoC, pscA
site d ’attachement chez la plante
acide polygalacturonique sert comme le récepteur pour la bactérie
le synthèse et transport des sucres/polysaccharides
produits des gènes chvAB et pscA
*forme un réseau de fibres qui entourent les bactéries et les fixent à la plante
région transférée
ADN-T par recombinaison homologue
se dirige vers le noyau via les signaux de localisation nucléaires (NLS) trouvées sur les protéines VirD2 et VirE2
ADN transférée contient des gènes pour
la production des opines (octopine, nopaline, agropine) qui seront exprimés dans la plante, et pour la production des facteurs de croissance pour former des tumeurs
Cytokinines
hormones végétales qui induit la croissance de la
tumeur dans les tiges.
Auxines
hormones végétales qui induit la croissance tumorale
dans les racines.
virA
récepteur des signaux libérées par le plantes blessées (acetosyringone). Expression constitutive. Si activé, est auto-phosphorylé et active virG
virG
une fois activé par virA, contrôle la transcription de l’opéron vir.
virB
protéine membranaire, participe de façon importante à la formation du pore de conjugaison (système de sécrétion de type IV)
virC
helicase
virD
endonuclease (relaxase), guide l’ADN-T dans le noyau de la cellule végétale
virE
protéine ssb, stabilise le simple brin du T-ADN transféré
Qu’est ce qui est nécessaire pour faire la recombinaison homologue?
- Homologie: les deux séquences doivent être identiques ou très similaires >1 kb: RecA (voie RecBCD, voie RecF)
- Appariement entre 2 ADN bicatenaires complémentaires (le point où les deux molécules restent unies par appariement de séquences complémentaires est appelée synapse)
- Enzymes de recombinaison (pour digérer et joindre les molécules=nucléases et ligases)
- Formation d’un hétéroduplex entre 2 molécules d ’ADN (dans cette région, les brins sont le résultat d’un mélange des brins des molécules initiales)
Modèle de Holliday
invasion des 2 brins
Modèle de Meselson et Radding
invasion d ’un seul brin
Modèle de Szostak
réparation des cassures bicatenaires
Presynapsis
préparation de l’ADN par RecBCD pour liaison de RecA
Synapsis
échange des brins pour former JH [jonction de Holliday] par RecA
Postsynapsis
migration de branche et résolution de la JH par RuvABC
RuvA
liaison au jonction, elle garde la structure plate
RuvB
activité ATPase utilise l’énergie pour déplacer l’ADN (migration de branche)
RuvC
clivage (résolution de la jonction)
Système RecBCD
- Produit des gènes recB, recC, recD
- 3 sous-unités de la protéine Exonucléase V
- enzyme responsable pour la dégradation d’ADN
- linéaire chez E.coli • 300 000 daltons
- RecBCD: réparation des cassures bicatenaires
RecBCD: exonucléase V
Enzyme multifonctions
• exonucléase ATP-dépendante sur l ’ADN bicatenaire
• Activité d’hélicase sur l ’ADN linéaire bicatenaire
• endo et exonucléase sur l ’ADN monocatenaire
• activité ATPase ADN-dépendante
• l’enzyme n’agit pas sur l ’ADN bicatenaire circulaire
Hélicase capable de digérer l’ADN
RecC
Quand RecC rencontre le site chi:
- changement de conformation de l’enzyme
- liaison de RecA stimulé par RecB
- activité exo change les brins et change la polarité (activité exo change de 3’-5’ à 5’-3’)
