Pathologie Flashcards
Variation génétique
Il existe beaucoup de différences génétiques et morphologiques entre les individus. Pas deux personnes génétiquement identiques.
Polymorphisme
Variation entre les individus
Deux causes de la variation génétique
- mutations
- recombinaison méiotique
Mutation
TOUT ÉVÉNEMENT CAUSANT un changement dans la séquence nucléotidique d’une molécule d’ADN
Types de mutations
- mutation somatique (sera portée par une cellule qui n’est pas une gamète, ne se transmet pas)
- mutation germinale (sera porté par les gamètes, se transmet à la génération suivante)
- mutation constitutive (portée par toutes les cellules, se transmet de gén en gén.)
Catégories de mutations
1) changement de séquence
2) délétions
3) insertitions
Changement de séquence (3 types)
- non sens (codon de terminaison)
- faux sens (autre changement de nucléotide)
- muette (change rien)
Et les inversions
Agents causant des mutations
- chimiques
- physique
- biologiques
- endogènes (métabolites)
Parmi les mutations suivantes qui peuvent survenir dans la séquence codante d’un gène, laquelle est LE MOINS susceptible d’être dommageable pour la fonction de la protéine affectée ?
- Délétion de 1 base ( ou paire de bases)
- Délétion de 2 bases (ou deux paires de bases) 3. Mutation faux sens
- Mutation non-sens
- Mutation muette
- Mutation muette (who would have thought)
Recombinaison méiotique
Elle survient dans les cellules germinales d’un individu et réalise un mélange du matériel génétique de son père et de sa mère en «échangeant» littéralement des portions de chromosomes paternels contre des segments équivalents des chromosomes maternels et vice versa.
Marqueur génétique et types de marqueurs
toute variation de séquence de l’ADN (polymorphisme ou mutation) créant des allèles différents à un même locus.
- marqueurs phénotypiques
- marqueurs phénotypiques biochimiques
- marqueurs de l’ADN
Comment est calculée la distance génétique
par rapport à la fréquence de recombinaison
Diagnostic génotypique
l’étude du bagage génétique (génotype) d’un individu à un locus donné dans le but de déterminer s’il est porteur d’une altération pouvant expliquer une maladie héréditaire ou une maladie acquise.
Pourquoi on fait un diagnostic moléculaire (indications)
- confirmation de diagnostic potentiel
- diagnostic de porteur
- diagnostic prénatal
TROIS GRANDS GROUPES DE DIAGNOSTICS GÉNOTYPIQUES
1) INDIRECT
2) SEMI-DIRECT
3) DIRECT
Diagnostic indirect
Étude de la ségrégation des marques flanquants plus ou moins éloignés du locus morbide dans la famille.
Cas index obligatoire. Incertitude dans les résultats en fonction de la distance des marqueurs.
Calcul de la probabilité que deux événements se produisent ensemble
Multiplier les probabilités
Calcul de la probabilité qu’un ou autre événement se produise
Additionner les probabilités pour chaque événement
Quel type de calcul mathématique est TRÈS UTILE en génétique ?
Le calcul des probabilités
Diagnostic semi-direct
Gène localisé et identifié. Les marqueurs sont donc très rapprochés, plus fiable. Cas index obligatoire.
Diagnostic direct
Analyse de l’individu seule suffit, la mutation est déjà identifiée.
Si on fait la découverte d’une maladie génétique qui affecte autant les filles que les garçons sur plusieurs générations différentes d’une famille, à quel MODE DE TRANSMISSION LE PLUS PROBABLE a-t- on affaire ?
Autosomal dominant
Maladie autosomale dominante
Va se propager sur plusieurs générations, une copie du gène muté est nécessaire pour activer la maladie
Maladie récessive liée au sexe
Plusieurs générations, surtout chez les gars. Devient comme dominante pour un XY.
Autosomale récessive
Slm dans la fratterie. Besoin des deux copies du gène muté donc papa et maman doivent être porteurs (c qui explique que ça ne se partage pas de gen en gen. nécessairement!)
Parmi les limites du diagnostic génotypique on retrouve TOUTES les suivantes SAUF :
1. Les mutations germinales (néomutations)
2. Les mosaïques germinales
3. La pénétrance incomplète des mutations pathogènes 4. L’hétérogénéité génétique
5. La nécessité toujours prélever toute la famille sur plusieurs générations
- La nécessité toujours prélever toute la famille sur plusieurs générations (pas besoin pour dx direct)
Limites du diagnostic génitypique
-néomutations
Néomutation
Maladie génétique sans histoire familiale
Hétérogénéité génétique
Coûteux de rechercher TOUTES les mutations connues d’un gène (ex CFTR pour FK)
Nécessité de recourir à un spécialiste en conseil génétique (cas complexe)
Pas mal tel que tel
Mosaïque somatique
Mutation somatique pendant l’embryogénèse
Pénétrance des mutations
Être porteur ne confère qu’un risque de maladie (slm une proportion va développer la maladie)
Phénocopies
Mêmes symptômes que maladie génétique mais pas lié au gène muté = danger de fausses conclusions
Si la distance génétique entre les marqueurs génétiques A et B est de 5% de recombinaison et celle entre les marqueurs génétiques B et
C est de 8% de recombinaison et que l’ordre des marqueurs génétiques est A .. B .. C , alors quelle est la probabilité d’une DOUBLE RECOMBINAISON génétique entre les marqueurs génétiques A et C ?
5% x 8% = 0,4%
