outils et caractères en taxo Flashcards
Qu’est-ce qu’un caractère taxonomique
Un attribut quelconque d’un membre d’un taxon par lequel il diffère ou pourrait différer d’un membre d’un taxon différent
comment faire le choix de charactère
Une justification est nécessaire. Il dépend de l’information qu’il procure versus sa capacité de résolution ou sa signification évolutive (cladistique vs phénétique)
Quelles sont les grande familles de caractères et leur sous-caractères
1-Caractères morphologiques
-Morphologie et anatomie générale
- Développement embryologique
2-caractères écologiques
-Caractères éthologiques
-niche écologique
3-Caractères biochimiques et moléculaires
-structure de molécules
-structure du code génétique
Que sont les caractères morphologiques
-Des données quantitatives (longueurs morphologique)
-Des données qualitative (comparaison de caractères anatomiques)
-Des caractères liés au développement (la prescence de caractères disparus à l’état disparus à l’état adulte.
Que sont les caractères écologiques/éthologiques
-la niche écologique/l’habitat
-le régime alimentaire
-le mode de reproduction
Que sont les caractères biochimiques et moléculaires
-La structure des protéines (électrophorèse et distance immunologique)
-Structure des acides nucléiques (hybridation ADN-ADN et comparaison séquences d’ADN/protéines)
L’objectif des séquences moléculaires
Determiner l’ordre d’enchainement des nucléotides d’un fragment d’ADN donné. Il faut comparer le % de différences entre taxons.
Quelles sont les propriétés des données moléculaires
1-Caractères simples à analyser
(ADN=4 choix possibles, 20 possibilité totals)
2-grande quantité d’informations disponibles ( chaque protéine est traité comme un caractère)
3-L’indépendance des caractères (mutations de l’ADN indépendantes, chaque site peut évoluer indépendamment des autres)
4-Poids égal entre les caractères (mutations d’un nucléotide à le même poids peu importe le site où il se produit. )
Les problèmes liés aux données moléculaires
-Les marqueurs ne peuvent pas toujours discriminer des espèces (mais la morphologie oui)
-Parfois, il n’y a pas de différence génétique (ADNmt) mais leur chant et la reproduction est différente
-La génétique appuie l’idée d’une seule espèce du a leur capacité de s’hybrider (les gènes différents sont ceux de couleurs)
-les génétiques peut lié deux taxons très différents morphologiquement
En conclusion, quels sont les liens entre les analyses morphologique et celles génétique
-Il y a des exemples inédits d’évolution de stratégies alimentaires divergentes entre deux taxons apparentés
-Les données morphologiques sont venues au scours d’une hypothèse élaborée à partir des données moléculaires
Quel est un autre défi dans les données moléculaires
-Les molécules évoluent à des vitesses différentes :
taxon ancien: ne pas utiliser une molécule à évolution rapide
Taxon récent: ne pas utiliser une molécule à évolution lente
Les choix du type de données moléculaires
1-Petite molécule (ADN très petit)
2-Transmission maternelle (pas de recombinaison méiotique, ADN transmis «intact» par la mère. Les variations sont dues aux mutations cumulées)
3-Taux de mutation élevé (évolution rapide, bon pour étudier les périodes relativement brève)
-Marquer satellite,non-codant (pas d pression évolutive, car ils ne codent pour rien)
