cladistique vs phénétique Flashcards
Qu’est ce que la classification cladistique
-basée sur la proximité évolutive
-deux taxons apparentés ont un ancêtre commun dans l’arbre
-La classification est le reflet de l’évolution, et non du degré de ressemblance.
Différence entre phylogénie ou généalogie
Phylogénie : rapport de proximité évolutive (qui est plus proche parent de qui)
Généalogie : Rapport ancêtre à descendant
(qui est ancêtre à qui)
Qu’est-ce qu’un noeud
déduction des innovations spécifiques de l’ancêtre présumé, par rapport au design de base
Qu’est ce qui est important en cladistique
Ne pas se laisser berner par les ressemblances superficielles. Le tout doit considérer seulement les groupes monophylétiques.
Le principe de base de la cladistique
La classification doit toujours refléter l’évolution et non pas le degré de ressemblance (qui est proche de qui au lieu de qui ressemble à qui)
Quelle est la classification cladistique la plus probable
Celle qui considère le moins de changements évolutifs. Elle est fondé sur le caractère improbable des changements évolutifs.
-Attention au convergence évolutive
Le principe de l’évolution
Elle est lente et procède par petites étapes à partir d’un design de base. Une innovation va donc conserver les traces de ces modifications, permettant d’en déduire l’orgine à partir d’un ancêtre commun.
Quelles sont les étapes de l’analyse cladistique
1ere : délimitation du groupe d’intérêt (taxons dont on veut résoudre la phylogénie)
2ieme : définir un groupe de référence (taxon qui sert à raciner l’arbre, car il présente l’état ancestral pour tous les caractères)
3ieme : Déterminer toutes les combinaisons d’arbres phylogénétiques possibles
4ieme : choix des caractères utilisés et identification de l’état ancestral et dérivé
5ieme : codage de la matrice des caractères
6ieme : évaluation de chaque arbre
7ieme :Sélection d’un arbre
Qu’est ce que le nombre de pas
c’est le nombre d’étapes évolutives nécessaires, si cette phylogénie est vraie
Le principe de base de la classification phénétique
la comparaison d’un grand nombre de caractères (ressemblance) doit refléter l’évolution et conséquemment la phylogénie
Quel est le traitment de la classification phénétique
Le traitement statistique permet d’agréger un grand nombre de mesures en un indice global de similarité phénétique
Il n’implique pas un lien d’évolution, on peut classer n’importe quoi
Que ce qui peut servir de propriété pour la classification phénétique
N’importe quelle propriété mesurable du phénotype
-Forme des os de fossiles
-Patrons des nervures des ailes des diptères
-couleur du plumage
-Longueurs morphologiques
-Nombre et formes des chromosomes
-Séquence des nucléotides de l’ADN
Comment faire les étapes de la classification phénétique
Ex: calcul du % de différences des acides aminés de l’hémoglobine de 4 espèces
Construction d’une matrice de distance : pourcentage de différences entre les taxons (nbr d’acides aminés différents divisé par le nombre total de sites)
1er étape : on détermine quelle combinaison de deux taxons montre le moins de différences (humain/chauve-souris)
2ieme étape : on crée un nouveau groupe dans la matrice (humain+chauve-souris) pour recalculer (faire la moyenne) une nouvelle matrice de distance
3ieme étape : on recommence l’étape 1, on détermine que la combinaison groupe 1 vs oiseau montre le moins de différences.
4ieme étapes: on débute la construction de l’Arbre phylogénétique en fonction des différences de pourcentages observées et calculées aux étapes précédentes
5ieme : et on recommence les calculs sur la matrice jusqu’à ce qu’il ne reste plus de taxon à comparer.
Cladistique vs phénétique
1:
C:Utilisation d’un faible nombre de caractères
P:Utilisation de beaucoup de caractères
2:
C:Les caractères doivent permettre de retracer l’évolution d’une structure
P: pas de soucie de la signification évolutive
3:
C: méthode: observation et déduction des transformations, souvent à partir de données fragmentaires
P: méthode: On applique un simple traitement statistique à l’ensemble des données
4:
C: On considère seulement les groupes monophylétique, on fuit les convergence évolutive
P: Pas de soucis pour les convergences et les groupes paraphylétiques
5:
C: «on réfléchit avant d’agir puisque toutes nos données ont une importance évolutive»
P:«on utilise tellement de données que ca finit par refléter l’évolution»
Quelle est l’alternative à la cladistique et à la phénétique et dans quel context est-il utilisé
la taxonomie évolutive, communication scientifique et vulgarisation
Le principe de base de la taxonomie évolutive
la cladistique peut amener des classifications déroutantes, contraire à une perception intuitive de la nature
Quel est le raisonnement de la taxonomie évolutive
il est basé sur le principe de la percée adaptative
Ex:
Nouvelles niches écologiques adoptées par les oiseaux, amenant l’évolution d’adaptations radicalement nouvelles. Les oiseau sont alors montré une spectaculaire radiation adaptative (les oiseaux sont spéciaux, donc ils méritent leur propre classe)
Quelle est la méthode de la taxonomie évolutive
on incorpore les principes et les méthodes de la cladistique et de la phénétique. On tire profit de leurs avantages, mais on incorpore aussi leurs faiblesses
Il y a beaucoup de critiques
