OSPE For Flashcards
Perbedaan merozoit pada p. vivax dan p. falciparum?
di early stage skizon, kalau vivax belum ada merozoit tapi falciparum udah ada merozoit
Bagian tubuh nyamuk yg menusuk kulit manusia, menghisap darah, dan memasukkan sporozoit ke tubuh manusia?
Probiosis
Bentuk infektif dari w. bancrofti?
Larva stadium III
Media dan sifat biakan Corynebacterium diphtheriae
McTelLoe
Mc Leod: koloni hitam
Telurit agar darah: koloni hitam
Loeffler serum: koloni putih
Reagen pewarnaan BTA?
FAM.
- Fuchsin carbol
- Asam alkohol (H2SO4 5% dan alkohol 60%)
- Methylen blue
Bakteri basil tunggal yg punya spora terminal dan Gram +?
clostridium. (drumstick)
Perbedaan salmonella dan shigella ketika dikultur pada media selektif SSA?
basil gram (+), tidak spora, tidak kapsul, palisade (huruf V,L,Y), pewarnaan Neisser tampak granula metakromatik?
Corynebacterium diphtheriae
Urutan tabung glukosa?
GLaMaManSu KUMHB
Glukosa = Kuning
LAktosa = Ungu
MAltosa = Merah
MANnitol = Hijau
SUKrosa = Biru
Bakteri yg tumbuh subur dan mengalami presipitasi pada egg yolk agar?
Clostridium
Bakteri basil gram positif yang bisa berubah jd gram negatif bila diinkubasi 24 jam?
Clostridium tetani
Perbedaan bakteri vibrio cholerae dan vibrio parahemolyticus di TCBS?
v. cholerae itu kuning, v. parahemo hitam
kandungan apa dalam TCBS yg mendukung kehidupan vibrio cholerae?
garam mineral & asparagin sebagai sumber karbon & nitrogen
Kenapa MCA bisa berubah jadi pink?
bakteri meragi laktosa di MCA - terbentuk asam laktat - pH indikator di MCA jadi pink
antibiotik yg kontraindikasi buat ibu hamil?
kloramfenikol dan ciprofloxacin
urutan p-drugs?
- diagnosis
- tujuan pengobatan
- kelompok obat based on efikasi
- safety, suitability, cost
- pilih p-drugs
urutan antibiotik dari yang efikasinya paling tinggi?
- cefixime
- ciprofloxacin
- kloramfenikol & tiamfenikol
- kotrimoksazol
- amoksisilin
antibiotik untuk MDR tifoid?
ciprofloxacin, ceftriaxone, dan azithromycin
antibiotik yg gaboleh diberikan jika leukosit <2000?
kloramfenikolllll
antibiotik yg ESO ggn pertumbuhan tulang?
ciprofloxacin
gol obat sulfa?
cotrimoxazole
bakteriosid?
ciprofloxacin, cotrimoxazole
kenapa cotrimoxazol kontraindikasi buat ibu hamil?
menghambat asam folat
perbedaan prinsip tubex dan widal?
tubex HAMBATAN aglutinasi.
widal aglutinasi.
sampel yg dapat digunakan pd px tubex?
serum atau plasma heparin
hasil px one drug test urin dibaca dalam waktu berapa menit dan hasilnya stabil sampai berapa jam pascatest?
dibaca dlm 5 menit, hasil stabil sampai 4 jam pascatest
mtDNA terdiri dari…
dua untai yang tersusun SIRKULER
kenapa mtDNA anak selalu sama dgn mtDNA ibu?
karena mtDNA pd sel ovum terdapat di sitoplasma, sedangkan mtDNA di sel sperma itu di leher sperma (ga ikut fertilisasi)
BENAR atau SALAH
DNA finger printing dalam bidang kedokteran forensik melacak DNA inti dan mtDNA sesuai tujuan px.
BENAR
primer yang digunakan pd PCR adalah primer…
oligonukleotida. diperlukan sepasang (dua buah) primer oligonukleotida.
Prinsip dasar PCR?
proses replikasi DNA dgn bantuan enzim Taq/DNA polimerase dan sepasang primer oligonukleotida yang masing-masing komplementer dgn ujung 3’ dari salah satu untai DNA sasaran.
Apa saja komponen PCR?
- DNA template (hasil ekstrasi)
- primer oligonukleotida: 2 buah (sepasang), yaitu forward dan reverse
- dNTP: 4 macam, yaitu dATGCtp
- Taq/DNA polimerase
- Mg 2+: kofaktor
- Larutan buffer
komponen PCR yg akan diamplifikasi?
DNA template
komponen PCR yang didesain spesifik?
primer oligonukleotida
kenapa primer oligonukleotida didesain spesifik?
untuk mencegah amplifikasi bagian lain DNA
shg diperlukan info ttg susunan genom DNA u/ menentukan daerah spesifik, biasanya conserved region.
berapa primer oligonukleotida yang dibutuhkan? panjangnya brp basa? namanya apa?
- sepasang (2 buah) primer oligonukleotida
- panjang 18-10 bp
- forward (5’) & reverse (3’)
primer itu komplementer
komponen PCR yg berperan sbg building blocks yg menambahkan rantai DNA baru?
dNTP
DNA polimerase berasal dari bakteri apa? terus kenapa?
Thermus aquaticus karena tahan suhu tinggi (100C lebih)
Komponen PCR yg berperan sbg kofaktor?
Mg2+
Peran larutan buffer pada PCR?
menciptakan lingkungan ionic dan pH optimum untuk reaksi PCR
Tahap PCR?
Denaturasi
Annealing
Elongasi
Tahap PCR suhu tinggi? berapa suhunya? fungsinya? durasinya?
- Denaturasi / peleburan
- 94-96 C
- memutus ikatan H pd DNA shg mjd untai tunggal
- 1-2 menit
Tahap PCR denaturasi menyebabkan apa?
ikatan H terputus - DNA tidak stabil - siap mjd template bagi primer
Pada tahap apa terjadi penempelan primer pada DNA template?
Annealing / penempelan
Suhu pd tahap annealing? kenapa harus pas? durasi?
45-60 C [56]
penempelannya bersifat spesifik shg kalo suhunya ga sesuai nanti primer menempel pada sembarang tempat
durasi 1-2 menit
Tahap PCR yg merupakan proses perbanyakan eksponensial?
Elongasi / pemanjangan
Suhu pada tahap elongasi bergantung pada apa?
DNA polimerase yang digunakan. Kalau pake Taq polimerase biasanya 76 C [72] dgn durasi 1 menit
Kenapa jumlah DNA yg dihasilkan PCR berlimpah?
karena penambahannya eksponensial
Ketiga tahapan PCR (denaturasi, annealing, elongasi) akan diulang sebanyak…
25-35 kali
apa yg dimaksud fragmen DNA amplikon?
polinukleotida yg panjangnya hanya terbatas dari satu primer ke primer lainnya
Elektroforesis adalah… dan caranya…
metode pemisahan molekul yang bermuatan berdasarkan berat molekul.
caranya dimasukkin ke medan listrik.
Hasil elektroforesis adalah…
terbentuknya band yg merupakan fragmen DNA hasil amplifikasi.
Mengapa elektroforesis DNA bergerak dari kutub negatif ke positif?
karena DNA mengandung folat yg bermuatan negatif
BENAR atau SALAH.
Pergerakan DNA elektroforesis dipengaruhi oleh panjang basa yang dikandung DNA.
BENAR
BENAR atau SALAH.
Makin panjang basa yg dikandung DNA, makin ringan berat molekulnya, makin lambat ke kutub positifnya.
SALAH.
yg bener:
Makin panjang basa yg dikandung DNA, makin berat molekulnya, makin lambat ke kutub positifnya.
komponen PCR yg harus dimurnikan dulu?
DNA template.
dimurnikan dgn spektrofotometer (1,8-2 berarti murni). panjang gekombang 230,260,280 nm.
Apa aja isi master mix?
buffer, dNTP, Mg, primer (f&r), enzim taq polimerase, air.
apa perbedaan intron dan extron?
intron tidak ditranslasikan, mengandung basa berulang shg bisa diidentifikasi.
extron ditranslasikan.
Prosedur amplifikasi DNA?
- masukkan DNA template ke tabung eppendorf
- sentrifugasi 20 detik
- ambil 1mcL DNA template lalu cek kemurnian di spektro
- pengenceran DNA template
- sentrifugasi pd 3000rpm selama 5 menit
- buat mastermix
- bagi mastermix ke 3 tabung (2 untuk sampel dan 1 kontrol negatif) masing-masing 49 mcL
- tambahkan 1mcL DNA template pd 2 tabung, dan 1mcL air pada 1 tabung sbg pengganti DNA template
- vorteks dan sentrifugasi 20 detik
- tabung PCR taro di thermal cycler
amplifikasi 30 siklus dgn suhu denaturasi 95, annealing 56 selama 1 menit dan elongasi 72 selama 2 menit