Nucléotides et acides nucléiques Flashcards
Quelles sont les deux types d’acides nucléiques ?
Les acides ribonucléiques (ARN)
l’acide désoxyribonucléique (ADN)
Rôle des acides nucléiques ?
Ils stockent et transmettent l’information génétique
ADN
matériel génétique, support de l’hérédité
Chromosome
principalement ADN et protéines
Combien d’acides aminés différents avons-nous ?
20 acides aminés différents
Combien de nucléotides différents dans l’ADN ?
4 nucléotides différents
Transformation (expérience de Griffith)
transfert de matériel génétique d’une cellule à une autre, modifiant ainsi son génotype et son phénotype
CCL de l’expérience de Avery, McLeod et McCarty
le matériel responsable de la transformation est vraisemblablement l’ADN d’autant que ce matériel «déprotéiné»
Bactériophages T2
virus à ADN qui infectent des bactéries
Les phages
constitués d’ADN entouré d’une capside (protéines)
Rôle de l’ADN d’un virus dans l’infection d’une cellule par le bactériophage T2 ?
Lors de l’infection virale, seul l’ADN pénètre dans les cellules infectées.
Cet ADN est capable de reprogrammer les cellules à faire de nouvelles particules virales
Les acides nucléiques sont des polymères de nucléotides utilisés pour ?
stockage des informations génétiques (ADN)
transmission d’informations génétiques (ARNm)
traitement de l’information génétique (ribozymes)
synthèse des protéines (ARNt et ARNr)
régulation de l’expression génique (longs ARNnc-miARN)
Les nucléotides sont également utilisés sous forme de monomères pour les fonctions cellulaires.
Lesquelles ?
énergie pour le métabolisme (ATP)
synthèse de coenzymes (NAD+)
transduction du signal (AMPc)
Constitution d’un nucléotide ?
base azotée
pentose/sucre
phosphate
Constitution d’un nucléoside ?
base
pentose
Quelle est la différence entre un désoxyribonucléotide et un ribonucléotide ?
In deoxyribonucleotides the —OH group on the 2’ carbon of the ribonucleotide (in red) is replaced with H.
Purines
Molécules azotées hétérocycliques constituées d’un cyclepyrimidinefusionné à un cycleimidazole.
Charge du groupement phosphate à pH neutre ?
Chargé négativement à pH neutre
Ou est attaché le groupement phosphate sur le pentose ?
Généralement attaché en position 5’
Comment sont construits les acides nucléiques ?
Les acides nucléiques sont construits en utilisant la version 5’-triphosphates du nucléotide.
ATP
Il s’agit d’une molécule essentielle dans le transfert d’énergie cellulaire.
L’ATP stocke et transporte l’énergie nécessaire aux processus cellulaires, en libérant de l’énergie lorsqu’une liaison chimique spécifique est rompue.
GTP; nom complet
Guanosine triphosphate
TTP; nom complet
Le pyrophosphate de thiamine
CTP; nom complet
La cytidine triphosphate
Définition de GTP
C’est une molécule similaire à l’ATP (adénosine triphosphate) et joue un rôle crucial dans les processus cellulaires en tant que source d’énergie, notamment dans les réactions liées à la synthèse des protéines et à la signalisation cellulaire.
Définition de TTP
Le pyrophosphate de thiamine est une forme active de la vitamine B1, également connue sous le nom de thiamine.
Il joue un rôle important dans le métabolisme des glucides en tant que cofacteur enzymatique.
Définition courte de CTP
Il s’agit d’un nucléotide, composant essentiel des acides nucléiques tels que l’ADN et l’ARN, contenant la base azotée cytosine.
CTP est utilisé dans la synthèse des acides nucléiques pendant la réplication cellulaire et la transcription.
Deux des trois phosphates utilisés pour la construction d’acides nucléiques forment un groupe partant.
Lequel ?
pyrophosphate-PPi
Adenosine 29-monophosphate, 39-monophosphate, and 29,39-cyclic monophosphate.
How are they formed ?
formed by enzymatic and alkaline hydrolysis of RNA.
Forme des pentoses dans l’ARN
Bêta-D-ribofuranose
Forme des pentoses dans l’ADN
Bêta-2’-deoxy-D-ribofuranose
Caractéristique principale des bases azotées ?
Dérivées de la pyrimidine ou de la purine
Molécules : hétéro-aromatiques
Structures planes
Absorbent dans l’UV : 250–270 nm
Quelles sont les bases azotées qui se trouvent à la fois dans l’ADN et l’ARN ?
La cytosine, l’adénine et la guanine
Quelle est la base azotée qui se trouve uniquement dans l’ADN?
La thymine
Quelle base azotée se trouve uniquement dans l’ARN ?
Uracile
Comment sont les bases azotées dans un pH à 7 ?
Molécules neutres à pH 7
Caractéristique acido-basique des bases azotées
Tous sont de bons donneurs et accepteurs de H.
Le nom de l’adénine si nucléoside de l’ARN ?
Adénosine
Le nom de l’adénine si nucléotide de l’ARN ?
Adénylate
Le nom de l’adénine si nucléoside de l’ADN ?
Deoxyadénosine
Le nom de l’adénine si nucléotide de l’ADN ?
Deoxyadenylate
Nom de la guanine si nucléoside de l’ARN ?
Guanosine
Nom de la guanine si nucléotride de l’ARN ?
Guanylate
Nom de la guanine si nucleoside de l’ADN ?
Deoxyguanosine
Nom de la guanine si nucléotide de l’ADN ?
Deoxyguanylate
Nom de la cytosine si nucléoside de l’ARN ?
Cytidine
Nom de la cytosine si nucléotide de l’ARN ?
Cytidylate
Nom de la cytosine si nucléoside de l’ARN ?
Deoxycytidine
Nom de la cytosine si nucléotide de l’ARN?
Deoxycytidylate
Nom de la thymine si nucleoside de l’ADN ?
Thymidine ou deoxythymidine
Nom de la thymine si nucléotide de l’ADN ?
Thymidylate ou deoxythymidylate
Nom de l’uracile si nucléoside dans ARN ?
Uridine
Nom de l’uracile si nucléotide de l’ARN ?
Uridylate
Dans les nucléotides, comment est attaché le cycle pentose à la base azotée ?
par une liaison b N-glycosidique
Avec quelle carbone se forme la liaison bêta ?
La liaison est formée avec le carbone anomérique du sucre en configuration bêta.
Avec quel azote se fait la liaison beta N-glycosidique dans les pyrimidines ?
le N1 dans les pyrimidines
Avec quel azote se fait la liaison beta N-glycosidique dans les purines ?
N9 dans les purines
Caractéristique la liaison b N-glycosidique.
stable vis-à-vis de l’hydrolyse, en particulier dans les pyrimidines
Le clivage de la liaison est catalysé par ?
l’acide
Quelle type de rotation se fait autour de la liaison N-glycosidique ?
Angle 0° correspond à la syn conformation.
Angle 180° correspond à l’ anti conformation.
Quelle type de rotation se fait dans l’ADN ?
Anti-conformation is found in normal DNA.
Pour les bases de purine dans les nucléotides, seules deux conformations par rapport aux unités de ribose attachées sont stérilisées.
Lesquelles ?
anti ou syn
Quelle conformation pour les pyrimidines ?
l’anti conformation
Absorbance dans les UV (250–270 nm) est due à quoi ?
à la transition électronique pi-> pi*
Que deviennent les états excités des nucléobases ?
Les états excités des nucléobases se désintègrent rapidement par des transitions sans rayonnement.
Lestransitions électroniques moléculaires
Ellesse produisent lorsque lesélectrons de valencesont excités à partir d’unniveau d’énergievers un niveau plus élevé
Que fournit l’écart d’énergie associé à cette transformation?
fournit de l’information sur la structure de la molécule et est à l’origine de nombreuses propriétés moléculaires (comme lacouleur).
Que nous donne la loi de Planck ?
La relation entre le niveau d’énergie impliqué dans la transition électronique et lafréquencede radiation est donné par laloi de Planck.
De même, le passage d’un électron d’une orbitaleliante πà uneorbitale antilianteπ*est notécomment ?
pi->pi*
Quand se fait la méthylation ?
La modification se fait après la synthèse de l’ADN.
5-méthylcytosine est courante chez quelle type de cellules ?
chez les eucaryotes mais se trouve également chez les bactéries
La N6-méthyladénosine est courante chez quelle type de cellules?
les bactéries mais ne se trouve pas chez les eucaryotes
Marqueur épigénétique chez procaryotes
moyen de marquer son propre ADN afin que les cellules puissent dégrader l’ADN étranger (procaryotes)
Marqueur épigéntique chez eucaryotes ?
moyen de marquer quels gènes doivent être actifs (eucaryotes)