Noyau et organisation du génome Flashcards
Quelles sont les structures du noyau?
Enveloppe nucléaire Pores nucléaires Nucléole Régions denses Régions claires Nucléoplasme Matrice nucléaire
Rôle principal de l’enveloppe nucléaire?
Cloison autour du génome (ADN)
Rôle principal des pores nucléaires ?
Transport entre le cytoplasme et le noyau (dans les deux directions)
Rôle principal du nucléole ?
Fabrication des ribosomes
Comment se nomme spécifiquement les régions denses du génome?
Hétérochromatine
Comment se nomme spécifiquement les régions claires du génome (ADN)?
Euchromatine
Qu’est-ce que le nucléoplasme ?
La partie soluble du noyau
Qu’est-ce que la matrice nucléaire ?
Un réseau fibrillaire qui structure la chromatine
De quoi est constitué l’enveloppe nucléaire ?
2 bicouches lipidiques en continuité avec le RER
Filaments intermédiaires (lamines) formant la lame nucléaire
Qu’est-ce que la lame nucléaire et à quoi elle sert?
Treillis rigide formé de Lamine A,B et C et donnant la forme ronde au noyau
Qu’est-ce qui est importé dans le noyau et qu’est-ce que cela requiert?
Protéines résidentes du noyau (ayant un peptide signal de localisation nucléaire NLS)
Dépend des importines (karyophérines) qui sont des protéines G monomériques (RAN GTPases)
Qu’est-ce qui est exporté du noyau?
ARNm ARNt ARNr snoARN miARN lncARN
Quels sont les différentes bases azotées présentes dans l’ADN?
Adénine (purine, R)
Thymine (pyrimidine, Y)
Guanine (purine, R)
Cytosine (pyrimidine, Y)
Quel est le nom complet de ADN?
Acide désoxyribonucléique
De quoi est composé l’ADN?
Polymère composé
- Bases azotées
- Sucre (désoxyribose)
- Groupement phosphate
Par quel lien sont reliés entre eux les différents nucléotides ?
Lien phosphodiester sur le sucre
Quelle est l’orientation de l’ADN?
5’ phosphate à 3’ OH
Quelles sont les caractéristiques générales de l’ADN?
2 brins complémentaires
Sillons majeur et mineur
Brins antiparallèles
Orientation 5’ vers 3’
Quel est le dogme central de la biologie moléculaire?
ADN (gènes) -> Transcription -> ARNm -> Traduction -> Protéine
ADN contient les instructions déterminant les caractères héréditaires
Encodée pour donner ordre des résidus a.a. des protéines et déterminer le moment ou endroit où les protéines sont exprimées
Sens de lecture du code génétique
5’ vers 3’ sur un brin
De quelle façon sont lues les résidus a.a. ?
En triplets (codons)
Quels sont les 3 types de cadres de lecture?
À partir du 1er a.a.
À partir du 2e a.a.
À partir du 3e a.a.
Vrai ou faux: la séquence codante a un début et une fin ?
Vrai
Quel est le cordon d’initiation “Start”?
ATG codant pour méthionine
Combien y a-t-il de codons d’arrêt “Stop” et quels sont ses codons?
3 codons
TAA
TAG
TGA
Par quoi sont traduits les ARNm ?
Les ribosomes
Comment sont traduits les ARNm ?
Par les ribosomes en utilisant les ARNt
Que sont les séquences codantes?
Partie qui encodé pour des protéines
Comprend un codon “Start”, un codon d’a.a. et un codon “Stop”
Combien y a-t-il de possibilités de cadres de lecture ?
6 possibilités (3 par brins)
Quelle est l’unité fondamentale du génome?
Un gène
Qu’est-ce qu’un gène?
Un endroit dans l’ADN (locus) où trouver les informations codant pour l’expression de différentes protéines
Englobe la séquence codante, les séquences transcrites non codantes et les régions régulatrices
Qu’est-ce que le génome?
Ensemble des gènes contenus dans un organisme vivant
Quelle est la structure des gènes chez les procaryotes?
Promoteur
Séquence codante
Terminateur
Qu’est-ce qu’un opéron?
Gènes ayant des fonctions similaires (ou dans la même voie métabolique) qui sont assemblés ensemble
Décrivez l’ADN génomique des bactéries
Une seule molécule ADN double brin circulaire sans extrémité
90% de régions codantes
10% de régions non codantes (surtout régulatrices)
Décrivez les structures composants les gènes eucaryotes
Exons
Introns
Éléments régulateurs (promoteur, éléments proximaux et distaux)
Qu’est-ce qu’un exon?
Séquences codantes du gène eucaryote
Qu’est-ce qu’un intron?
Séquences non codantes du gène eucaryote
Après la transcription de l’ADN en ARN, qu’arrive-t-il à celui-ci ?
Il doit maturer par un processus appelé épissage
Qu’est-ce que l’épissage?
Les introns sont retirés du gène et les exons sont collés ensemble
ARNm contient les séquences codantes pour les protéines après maturation
À quoi servent les éléments régulateurs ?
Détermine a quel moment un gène devient actif et l’intensité de l’activation
De quoi est constitué le génome eucaryote?
ADN double brin linéaire
Combien y a-t-il de molécules d’ADN chez l’humain?
46 molécules d’ADN (chromosomes) formant 23 paires
Quelles sont les composants détaillés du génome eucaryote?
Un promoteur/gène
1.5% ADN code pour protéines (exons)
26% introns
8-20% éléments régulateurs
40-50% séquences répétées
Qu’est-ce qu’un satellites (séquences répétées)?
Répétitions de 60 pb à 2-3 kpb
Qu’est-ce qu’un minisatellites (séquences répétées)?
Répétitions 6-60 pb
Qu’est-ce qu’un microsatellites (séquences répétées)?
2-5 pb
Quels sont les deux formes de séquences répétées dans le génome eucaryote?
En tandem et dispersée
Quels sont les trois formes de séquences répétées en tandem?
Satellites
Minisatellites
Microsatellites
Quels sont les formes de séquences répétées dispersées?
LINE (long interspersed nuclear element)
SINE (short interspersed nuclear element)
Qu’est-ce que LINE?
Séquences répétées d’environ 6 000 on contenant un gène pour la transposase
Qu’est-ce que SINE?
Courte répétition de 500 pb
Que forme LINE et SINE ensemble?
Un élément transposable (transposons)
Quelle est la capacité des transposons?
Capacité de se répliquer dans le génome
Quels sont les deux mécanismes de transposition?
Couper/coller
Copier/coller
Qu’est-ce que le nucléosome et de quoi est-il constitué?
Unité de base de la chromatine et il est constitué de 8 histones (octamère d’histones)
Qu’est-ce que l’euchromatine?
Région claire (moins dense) de l’ADN génomique avec beaucoup d’ADN et beaucoup de gènes actifs
Qu’est-ce que l’hétérochromatine?
Région plus dense de l’ADN génomique contenant moins de gènes et situé en périphérie du noyau
En quoi sont assemblés les nucléosomes?
En fibre de 30 nm
Quels sont les quatre histones de base?
H2A
H2B
H3
H4
De quoi est constitué un octamère d’histones?
De 8 histones dont deux de chaque histone de base (H2A, H2B, H3 et H4)
À quoi sert l’histone accessoire H1 ?
Sert à la compaction
Association aux points entrée et de sortie de l’ADN et stabilise le brin
Qu’est-ce qu’un chromosome?
État de compaction ultime du génome
Quand sont formés les chromosomes?
Seulement lors des divisions cellulaires (mitose ou méiose)
Combien y a-t-il de chromosomes chez l’humain et quels sont les deux types de chromosomes?
46 chromosomes (23 paires)
44 chromosomes autosomes
2 paires de chromosomes sexuels
Quels sont les différenciations femelle/mâle chez les chromosomes sexuels?
Femelle : XX
Mâle : XY
Quelle est la structure des chromosomes?
2 chromatides soeurs identiques (2 copies après réplication) comprenant 2 molécules ADN attachées ensemble par un centromère et les extrémités protégés par les télomères
Qu’est-ce qu’un centromère et à quoi cela sert-il?
Point de fixation des chromatides soeurs et le site d’attachement du complexe kinétochore
Combien y a-t-il de centromère par chromosome?
Un seul
Qu’est-ce qu’un télomère?
Séquence ADN répétées, conservées de forme TTAGGG répétés 500 a 5 000 fois
Lieu assemblage des protéines qui coiffe et protégées les extrémités
Comment se forme les télomère?
Se referment en boucle par interaction du brin ADN simple-brin 3’ libre répété et liés à une multitude de facteurs de structure
Quelles sont les fonctions des télomères?
Protègent les chromosomes
Horloge moléculaire pour la cellule
Quelle est la fonction du nucléole?
Sites de production des ribosomes
Quelle est la structure du nucléole?
Assemblage ADN. Protéines et ARN
Gènes encodant ARNr répétés plus de 200 fois sur 5 chromosomes
