Néoplasie Flashcards
Types de virus pouvant E carcinogén.
Virus ARN
Virus ADN
Méc ax virus ongcogène à adn
S’intègre de manière stable ds génome c hote
= permet transcrip. Gène viraux
= exp. Prot virales transformantes
nom Catégorie de virus oncogène à adn
Virus transformant
3 virus les plus important dans la catégorie oncogène adn
Ebv
Hpv (vph)
Hbv hep B
6 Types vph pouvant E cancer col
16-18-31-33-35-51
3 types néo pouvant être formés par virus hpv (vph)
Cancer épidermoide col
Dysplasie sévère
Cancer in situ col
Forme virus vph ds les lésions bénignes
Maintenu s-f épisomale (non intégré
Forme virus vph ds les lésions cancéreuses
Forme intégrée génome
Caract vph lorsque génome est intégré
Exp oncoprott E6- E7
4 noms de néo causé par EBV
Lymphome burkitt
Lymphome type B a-s immunodef
Maladie hodgkin
Carcinome naso pharyngé
Méc ax EBv pouvant E lésions néo
1-ebv infecte C
2- expression molécule cd21 + surface lympho B et C épith oropharynx
3- entre période latence
si immunité diminuer ou supprimé, sort de latence et E mut oncogén.
Type de néo causé hep b
Carcinome hépato C
Types de rayons pouvant e néo peau
Uva
Uvb
Uvc
3 types de néo peau causé par rayons uv
Carcinome épidermoide
-carcinome baso c
Mélanome
Mec action uvb pour e néo peau
1- expo uvb
2- E form dimère pyrimidine a-n adn
3- si non réparé, dimère E erreurs transcript gène
2 catégories de gènes pouvant être la cible uvb lors chang. Néo
Oncogènes
Gène sup tumeurs
5 Types de néo pouvant être causé par radiation électromagnétique et particulaire
Leucémie
Cancer thyroide
Néo sein
Néo poumons
Néo glande salivaires
4 Ex de radiation particulaire
Particules
-alpha
-beta
-protons
-neutrons
2 types de radiations électromagnétique
Rayons x
Rayons gamma
Nom de syndrome gén récessif E plus grande vulnérabilité aux effets radiations -néo a-s
Xéroderma pigmentosum
Fanconi
Bloom
Ataxie- télangiestasie
Mec ax de certains syndrome génétiqe rare pouvant aug. Vulnérabilité aux effets-néo r-a radiation
Syndrome gén. E mécanisme AN réparation ADN
Nommer les 3 types possibles de polymorphismes
SNP
STR (microsatellites)
CNV (séq. Répétitives gène entier)
Nommer une mut. Ponctuelle snv
Kras
Ex insertion- dél. Gène
EGFR poumons
4 types de point mutation
Silent
Nonsense
Miss sense
Frame shift
4 types lésions gén. À grande échelle
-délétion
-CNV
-amplification
Réarr. (Fusion transloc)
Rôles des micro RNA dans les lésions gén.
Rég. Expression proto onco et sup tumeurs
2 Exemple2 de marqueurs oncologiques de prédispo
BRCA 1
BRCA2
Exemple de biomarqueur dx et maladie a-s
BCR - ACL dans la LMC
2 Ex biomarqueur pronostic + maladie a-s
ER
PR
= bon prognostic néo sein
Ex biomarqueur prédictif + maladie a-s
HER2
Néo sein
Définition mut driver ((conducteurs)
Mut ds gênes du cancer,
E dev ou prog. Néo
Def. Mut passenger (passager)
Mut ds autres gènes
Gén. Silencieuses
Retrouver en grande qte ds expo carcinog.
Exemple de mut conducteur
KRAS
Exemple de mut passenger
DS21s11
Étapes de carcinogén. + conséq. C
1-initiation
mut r-a carcinogène = C avec stem like propriétés
2- acquisition instab. Génomique = mut affecte génôme
3- form C précurseure avec phénotype muté = acquisition hallmarks
4-form c néo
5- form subclones avec plusieurs autres mut
6- masse néo hétérogène
La carcinogénèse est expliquée par (2)
Acc mut driver et passenger
Étapes de la carcinogén. Néo colon + chang. Gén. A-s
1-mut germ ou C somatique a-n gêne sup tumeur
= first hit APC = muq à risque
2- aN méthylation E inact. 2e allèles = second hit
= APC B catenine
3- = mut proto onco ex. KRAS
adénome tubuleux - tubulo villeux- villeux
4-sénescence induite oncog. Ex. TP 53
Ou
Perte autres gène sup. Tumeur ex SMAD, TP53, télomérase
5= form. Néo
4 classes de gène de cancer
Proto onco
Sup tumeur
Apoptose
Réparation adn (ou interax tumeur hôte)
C’est quoi hybridation in situ
Hybridation sur ch sonde ADN complémentaire fluorescente pour voir marqueur spécifique ur CH
Hybridation in situ visualisé avec quelle techno
Microscopie à fluorescence FISH
But de l’hybridation in situ
Détecter mut grande taille
Ex. Amplif, dél,transloc
Composante sonde fish
Courte séq adn arn spécifique à une cible marqué avec couleur fluorochrome
Loc possibles sonde fish
-a-n gène specifique
- centromère
-télomère
- ch painting (partout)
Quelles info donnent la lecture de fish
-présence ou abs signal cible de la sonde
-localisation spatiale du signal cible
Def proto oncog
Gène C normaux impliqué ds croissance prolif C
Def gène oncogène
Version muté ou sur exp proto onco
2 Caract gène oncogène
Mut gain fct indep
Effet dominant sur la C
5 Rôles des oncogènes
-fx de croissance
-récepteurs fx croissance
-transduc signaux
-Fx trans nucl
-rég. Cycle C
Nom fx de croissance a-n gène oncogène
PDGF
3 Ex récepteurs pour fx de croiss
-HER2
-neu
- EGFR
2 Ex transducteurs signaux pour gène oncog
RAS
RAF
Ex fx transc nucl. Pr gène oncog
MYC
2 ex reg cycle C des gène oncog
Cyclines
CDK
4 Mécanismes activation oncogène
Mut ponctuelle
Amplif génique
Transloc
Sur exp (boucle autocrine)
Interprétation de labo :
Que veux dire HER2 +
Présence amplif gène HER2
Donc tx ac anti-her2 pertinent et efficace
Fréquence cancer avec composantes héréditaires
5-10 %
3 Caract mut germinale
Héréditaire
Présent ovais ou spermato
Tt C ont la mut
4 Caract mut somatiques
Acquit
Présent tissus non germinal
Pas héréditaire
Mut présente seulement tumeur
Rôle N des gènes sup tumeurs
Agit comme frein prolif C
2 Caract gène sup tumeur
Mode ax récessif a-n C
Type gouverneur ou gardien
2 ex gène sup tumeurs
RB
Tp53
Expliquer principe du two hit hypothesis
Prend 2 evn gén s-f mut pour inactiver le gène RB
Que permet l’interprétation du 2 hit hypothesis
Distinguer forme sporadique et fam du rétinoblastome
Nom Catégorie du gène RB + ss type
Sup tumeur, Type gouverneur
RB
Perte ou gain fct ?
Ax a-n (2)
PF
Gène RB direct
Gène voie signalisation ex. P16, cdk4, cycline
2 Fonction principale gène Rb
Frein croiss C
Contrôle transition C1-s
Catégorie de gène pr TP53 + ss type
Sup tumeur. , ss type gardien génome
Gène le plus fréq muté dans les néo
Tp 53
70%
Ex de mut r-a gène tp53
MDM2
3 Rôle tp53 + contexte activité
Si stresseurs interne
= activ. e arrêt phase G1 quiescence
= activ réparation adn
=sénéscence apoptose
Nommer 3 gènes sup tumeur qui inh contact
E-cadérine
Apc
-B catenine WNT
Nommer 2 gène sup tumeurs
TGF-B
TP53
Fréquence néo sein
5%
3 gènes E haut risque de néo sein
BRCA1 -2
Tp 53 (li-fraumeni)
PTEN (cowden)
3 gènes à risque faible ou modéré néo sein
CHEk2
ATM
PALB2
2 Autres types de néo E par brca 1+2
Ovaires, prostate
Fréquence néo sein parmis BRCA1-2
+
50-85%
Description type mut gène brca1
Mut germinale a-n gène rep adn
(Recombin. Homologue)
3 Conséq. Défaut gène réparateur adn
E acc mut
Facilite dév. Néo
Incapacité maintien intégrité génome malgré division C
3 système de réparation de l’ADN
-mésappariement (mismatch repair)
-excision (nucleot excision repair)
-recombin (recombin repair)
Car gène rép ADN
-mode ax récessif
-mut gén. Dans certains synd fam
Nommer 3 exemples de systèmes de rép ADN
5 Source poss adn pour Technique détection mut
Sang
Tissus frais
Tissus congelé
Frottis cyto
Tissus paraffiné
3 Méthodes de dét mut
Séquençage sanger
PCR
Séquençage nouvelle gén. (NGS)
Type de mut qui nécessite C médecine génique
Mut considérée pathogénique
Décrire effet warburg
Phospho oxy changé pour glycolyse aérobique
But effet warburg
Généré métabolites précurseurs pour synth composantes C
Exé ADN ARN PROT lipide
Conséquence utilisation effet wardburg
E form. Métabolites a-n mitochondrie
= création lactate
Effet warburg fav. Par (1)
3 ex
Ax proto onco
Ex. RAS, myc, récept fx croiss
Effet warburg est l’effet contraire des gènes…
2 ex
Sup tumeurs
Ex pten, tp53
Cause lymphome burkit
-infection latente à EBV E mut a-n MYC
= aug. Prot MYC
Méthode activation oncogène myc ds lymphome burkitt
Transloc myc de ch= augm oncogène MYC = aug. Prot myc
Conséquence activation oncogène myc ds lymphome de burkitt
Augmentation expression gène promouvoit croiss
3 méthodes pour détecter mut transloc
Fish
Pc
Séq nouvelle gén (NGS)
Expliquer principe pcr
Technique amplif. Expo. ADN cible
Nom complet anomalie trouvé au test fish si lmphome de burkit +
Transloc (8-14) E juxtapo. Gène MYC avec promoteur IGH
Étiologie du lymphome folliculaire
Conséquences Engendrées
Transloc 14-18
Justapos. Promoteur IGH à BCL2
Lymphome folliculaire entraine comme méc ax…
Sur exp prot anti apoptique
Conséquence de alt gène apoptose
Éévasion mort C
Méc ax pour évasion apoptose physio
Interférence avec voie intrinsèque a-n mitochondrie
Inactiv pro apoptotique (tp53)
Sur exp gène anti apopto. (Bcl2)
Nom gène pro apoptose
Tp 53
Nom gène anti apoptose
BCL2
7 Noms agents infectieux avec pot carcinogène
-Virus ARN oncog = HTLV-1
- virus ADN onco= hpv, EBV, hhv -8, hbv, polyomavirus
-h pylori
3 méc ax des carcinogène infectieux
-prot virales oncogéniques
- rx inflamm chronique
-intégration virale a-n génome
Diff entre prot E6-E7 a-n hpv bas risque et hpv haut risque
Description VEGF
Quelle C produit le VEGF
Test fait pour objectivé présente VEGF
Réaction ihc pour le vegf
Fréq carcinome colorectal métastat. (CCR)
10 %
Taux survie carcinome colorectal métastatique (CCR)
Faible survie
Méc action néo CCR (cancer carcinome colorectal métas.)
-a-n voie signalsation EGFR
Chang. PTEN et prot RAS
Donc active la voie prolif C trop
Type de mut E résistance tx anti EGFR
Kras
5 Sources possibles ADN pour détecter mut RAS
-sang
-tissus frais
-tissus congelé
-frottis cyto
-tissus parrafiné
Explication principe analyse biomarqueurs moléculaire
-prélèv tissus
-mis lame
-microdissection
-extraction ADN
- PCR si gène unique
Ou
SNG si gènes multiples
Utilité de la patho moléculaire dans tx ciblées
Évalue stat mutationnel
= prévoir rép tx (réponse +, - ou toxicité)
4 Caract séquençage génome complet
Non biaisé
Détecte tt mut
Couteux
Sensib limité
5 Caract séq. Exome complet
Détecte tt snv
Détecte tt CNV
Couteux
Sensib limité
Pas de fusion
Caract séquençage ciblé
Panel de gènes intérêt
Plus abordable
Rapide
Sensible
Peut avoir biais a-n gène ciblés
Explication principes test panel de gène néo
Séquençage plusieurs gènes en mm temps sur 1 échantillon
Méc évasion sys imm
Sélection subclone peu immunogène (pas reconnu sys)
Diminution exp cmh type 1
Présence prot inh d’immunosup (checkpoint inhibitors)
