Molekylære mekanismer ved membrantransport Flashcards
Hva skjer under proteinglykosylering?
En tidligere dannet forløper-oligosakkarid blir overført som en komplett enhet til proteiner. Fordi dette oligosakkaridet blir overført til sidekjede-NH2-gruppen av et aspargin i proteinet, sies det å være N-bundet eller asparagin-bundet. Lipidmolekylet dolichol ankrer oligosakkaridet i ER-membranen. Oligosakkaridet blir overført til mål-asparaginet i et enkelt enzymatisk trinn av en oligosakkaryl transferase.
Hva er en av de viktige biosyntetiske funksjonene til ER?
Kovalent tilsetning av oligosakkarider til proteiner.
Omtrent halvparten av de løselige og membran-bundede proteinene som blir prosessert i ER - inkludert de som er skjebnebestemt for transport til Golgi, lysosomer, plasmamembranen, eller det ekstracellulære rommet - er glykoproteiner som blir modifisert på denne måten.
Noen proteiner i cytosol og i kjernen blir også glykosylert, men med en enklere sukkermodifikasjon hvor en enkel N-acetylglukosamin-gruppe blir lagt til en serin eller treonin i proteiner.
Hva er en av grunnene til at glykosylering er en så vanlig modifikasjon av proteiner som går inn i ER?
Fordi noen proteiner krever N-bundet glykosylering for ordentlig folding i ER, selvom den presise lokasjonen av oligosakkaridet som er bundet til proteinets overflate ikke virker å ha noe å si.
Hvordan blir proteiner fra ER valgt for degradering?
N-bundede oligosakkerider fungerer som timere som måler hvor lang tid et protein har tilbragt i ER. Sakte trimming av en bestemt mannose på kjerneoligosakkridtreet av mannosidase i EI lager en ny oligosakkridstruktur som ER-lumenale lektiner fra translokasjonsapparatet gjenkjenner. Et protein som folder seg og forlater ER raskere enn monnisidasen kan fjerne sin målmannose unngår derfor degradering.
I tillegg til lektinene i ER som gjenkjenner oligosakkaridene, assosierer chaperoner og proteindisulfididomeraser med proteinene som skal degraderes.
GTPaser kan fungere som molekylære brytere. Hvilke to klasser av proteiner regulerer vekslingen av bryteren?
Guanine nucleotide exchange factors (GEFs) aktiverer proteinene ved å katalysere utvekslingen av GDP for GTP.
GTPase-activating proteins (GAPs) inaktiverer proteinene ved å trigge hydrolyse av den bundne GTP til GDP.
Hvilke to typer markører fungerer for å forsikre spesifisiteten av vesikkelmålretting?
Rab proteiner styrer vesiklene til spesifikke plasser på den riktige målmembranen.
SNARE proteiner aktiverer sammensmeltingen av lipidlagene.
Hvordan blir transportvesikler transportert til riktig bestanddel i cellen?
Alle transportvesikler har overflatemarkører som identifiserer med i henhold til opprinnelse og type last, og målmembranen har komplementære reseptorer som gjenkjenner de riktige markørene.
Hvilke typer SNAREs utgjør det komplementære paret når to membraner smelter sammen?
vSNAREs (vesicle membrane) og tSNAREs (target membrane)
Hva påvirker affiniteten til KDEL-sekvensen?
pH i bestanddelene, som reguleres av H+ pumper.
