Módulo 3 parte 2

Question 1

Which of the following about Glycosylation is false?
A. It attaches a carbohydrate to a specific amino acid
B. Happens in roughly half the proteins expressed in a cell
C. Takes place in the cytosol, endoplasmic reticulum and Golgi apparatus.

Answer 1

C. It doesn’t happen in the cytosol

Question 2

There are two main types of portein glycosylation: C-Linked Glycosylation and N-Linked Glycosylation. True or false?

Answer 2

False. It’s N-linked and O-linked

Question 3

During O-Linked Glycosylation, what is targetted?

Answer 3

The hydroxyl group in serine and threonine, adding a glycan residue

Question 4

In N-Linked Glycosylation, a carbohydrate is attached to the hydroxyl group of asparagine. True or false?

Answer 4

False. It’s attached to the amide nitrogen of asparagine

Question 5

Name three functions of glycolisation

Answer 5

➢ Help in protein folding, stability and trafficking (controls localization and transport);
➢ Limit the access of macromolecules to the cell surface;
➢ Protect the cell surface without impairing its movements;
➢ Are involved in cellular adhesion and communication processes;
➢ Participate in the regulation of development;
➢ Modulate enzyme activity and protein interactions

Question 6

N-Glycosylation takes place in the lumen of the ER and happens as the protein is being translated. True or false?

Answer 6

True.

Question 7

A protein can have the consensus sequence for N-Glycosylation but the consensus sequence doesn’t get glycolisated. Why?

Answer 7

The consensus sequence needs to be exposed.

Question 8

In N-Glycosylation, the _________ is transferred from the _________ precursor _________ to an _________ residue

Answer 8

oligosaccharide - lipid - dolichol - asparagine

Question 9

In N-Glycosylation, the oligosaccharide is connected to dolichol through a pyrophosphate, and by breaking this bond enough energy is released for the oligosaccharide to bind to asparagine. True or false?

Answer 9

True.

Question 10

(Glycosylation) It is considered to exist three major classes of oligosaccharides: Simple oligosaccharides, complex oligosaccharides and High-mannose oligosaccharides. True or false?

Answer 10

FALSO. NÃO EXISTEM OLIGOSACÁRIDOS “SIMPLES”

Question 11

High-mannose oligosaccharides differ in composition from the original oligosaccharide due to the fact that lots of mannose residues are added to it. True or false?

Answer 11

False. Normally no new residues are added to them and their mannose content is close to the original.

Question 12

Complex oligosaccharides are able to increase the number of interactions that the protein has and helps specify the proteins it will interact with by having a high ammount of positively-charged residues. True or false?

Answer 12

False. They have lots of NEGATIVELY charged residues.

Question 13

The process of Glycosylation takes place inside the golgi complex, where there are redundant enzymes. What this means is that if one enzyme fails, another can fill in the gap for them. True or false?

Answer 13

False. No complexo de golgi existem enzimas específicas que em caso de falha comprometem o processo inteiro.

Question 14

Numa primeira fase inicial da N-Glicosilação, são removidas três moléculas de glucose, uma pela ação da glucosidase I e duas pela ação da glucosidase II e removida uma manose pela manosidase. V/F?

Answer 14

Verdadeiro.

Question 15

A N-glicosilação começa no lumen do ER, mas acaba no lumen do complexo de golgi. V/F?

Answer 15

V.

Question 16

Uma glicoproteína que não apresente resíduos de glucose pode ser reconhecida pela calnexina e pela calrreticulina o que evita a agregação incorreta. V/F?

Answer 16

Falso. É de salientar que a glicoproteína quando apresenta uma glucose pode ser reconhecida pela calnexina e pela calrreticulina o que evita a agregação incorreta, o que não acontece quando são removidos todos os resíduos de glucose.

Question 17

Vão ser removidos três residuos de manose da glicoproteína que esteja a ser processada no cis-golgi pela golgi manosidase I e são adicionados resíduos de N-acetilglucosamina através da N-acetilglucosamina transferase I. V/F?

Answer 17

V.

Question 18

Após a ação da enzima golgi manosidase II, as proteínas passsam a ter resíduos que as tornam sensíveis à Endoglicosidase H. Verdadeiro ou falso?

Answer 18

Falso. Passam a ser resistentes.

Question 19

Durante uma experiência, uma proteína que se está a seguir começou a ser processada pelo complexo de golgi. Um cientista acidentalmente spilled Endoglicosidase H na área de trabalho, mas relaxou os seus colegas porque a proteína, como já está no complexo de golgi, já é resistente a esta enzima. Explique porque é que ele está errado.

Answer 19

Porque não é a proteína estar no complexo de golgi que lhe dá resistência, mas sim a ação da golgi manosidase II.

Question 20

Apresente uma diferença e uma semelhança entre a Calnexina e Calreticulina na glicolisação.

Answer 20

Do ponto de vista funcional estas duas proteínas não apresentam diferenças.
Do ponto de vista da sua localização, a calnexina encontra-se na membrana do ER enquanto que a calreticulina é solúvel.

Question 21

A relevância da Calnexina e Calreticulina na glicosilação vem do facto de elas poderem servir como enzimas. V/F?

Answer 21

Falso. Elas podem servir como chaperonas.

Question 22

A UDP glicosil transferase é uma enzima que funciona como detetor de folding, que tem a capacidade de transferir um resíduo de glucose para a proteína caso ela não esteja folded corretamente. V/F?

Answer 22

V

Question 23

O Ciclo da calnexina/calreticulina é um ciclo que assegura que as proteínas saem do ER sempre com o folding correto. Se elas não possuirem o folding correto, então elas continuam no ciclo permanentemente. V/F?

Answer 23

Falso. Se uma proteína ficar muito tempo neste ciclo, ela vai ser marcada pelas proteínas EDEM para ser degradada

Question 24

A O-Glicosilação ao contrário da N-glicosilação, não ocorre no ER, e só ocorre no complexo de golgi. V/F?

Answer 24

V

Question 25

Na O-Glicosilação são adicionados ________ resíduos de ____________ pelas _______________.

Answer 25

poucos - N-acetilglucosamina - glicosiltransferases

Question 26

Nas proteínas com âncoras lipídicas, é adicionado um ________________ à região _-terminal da proteína e ocorre no _____________________.

Answer 26

fosfatidilinositol - N - lumen do ER

Question 27

Proteínas com âncoras de GPI existem unicamente na zona extracelular. V/F?

Answer 27

Falso. Também pode existir em membranas de organelos.

Question 28

(Eu sei que a ubiquitinação também pode servir como sinal celular para outras cenas mas esquece isso por agora)
Uma mono ou poli ubiquitinação levam ambas à degradação de proteínas no proteossoma. V/F?

Answer 28

Falso. Uma mono ou oligoubitiquinação levam à degradação da proteína no lisossoma.
Uma poliubiquitinação é a única que leva à sua degradação no proteossoma.

Question 29

O que é a sumoilação?

Answer 29

SUMOylation is a process in which SUMO proteins are covalently attached to specific lysine residues in target proteins, thereby regulating various aspects of protein function, including transcription, subcellular localization, DNA repair and cell cycle.

Question 30

As vesículas possuem um revestimento proteico na sua face citosólica e esse é desfeito ainda antes da fusão com a membrana alvo. V/F?

Answer 30

V

Question 31

Uma das funções do revestimento proteico nas vesículas é concentrar proteínas específicas na região onde a vesícula é formada. V/F?

Answer 31

V

Question 32

Indique os três tipos de vesículas que conhece. Essa classificação deve-se ao quê?

Answer 32

Vesículas de clatrina, vesículas COP l e vesículas COP ll.
A classificação provem do tipo de revestimento proteico.

Question 33

O revestimento proteico é um indicador do local de onde as vesículas originam. V/F?

Answer 33

Falso. É um indicador do local para onde se têm que dirigir as vesículas.

Question 34

Indique para onde são transportadas as diferentes vesículas.

Answer 34

Vesículas de clatrina – transporte entre o complexo de Golgi numa fase mais tardia e a membrana plasmática;
Vesículas COP I – transporte entre o complexo de Golgi e o ER;
Vesículas COP II – transporte entre o ER e o complexo de Golgi;

Question 35

As vesículas têm roughly sempre o mesmo tamanho e forma. V/F?

Answer 35

Falso. Elas podem apresentar diversos tamanhos e formas.

Question 36

Na regulação do transporte vesicular, são muito importantes as proteínas com atividade de ATPase. V/F?

Answer 36

Falso. São as com atividade de GTPase

Question 37

A função das Proteínas ligadas ao GTP no transporte de vesículas relaciona-se com a sua regulação espacial e temporal. V/F?

Answer 37

V

Question 38

As GTPases funcionam como um interruptor que dão o sinal para se iniciar o processo. V/F?

Answer 38

V

Question 39

Na sua forma ativa, as GTPases estão ligadas a G-P e na sua forma inativa estão ligadas a G-P. Elas passam de forma ativa para inativa através da ação de G–s e passam de inativa para ativa pela ação de G–s.

Answer 39

T - D - (G)AP - (G)EF

Question 40

A ativação de SAR-1 leva a que esta dê bind a GDP, que induz uma alteração conformacional que involve a exposição da sua cauda hidrofóbica e a sua seguinte integração na membrana do ER. V/F?

Answer 40

Falso. A ativação é feita quando está ligado a GTP.

Question 41

As GTPases hidrolisam o GTP muito rapidamente, o que promove a dissociação do revestimento e a saída da cauda hidrófoba da membrana. V/F?

Answer 41

Falso. GTP é hidrolisado lentamente.

Question 42

A sequência KDEL leva a formação de que tipo de vesículas?

Answer 42

COP l

Question 43

As vesículas COPII formam-se em locais com muitos ribosomas. V/F?

Answer 43

Falso. Em locais de saída do ER, normalmente sem ribossomas.

Question 44

O empacotamento das vesículas COPII é muito específico. V/F?

Answer 44

V

Question 45

O empacotamento das vesículas COPII é muito específico, onde são empacotadas vesículas com sorting signals. v/f?

Answer 45

Falso. Vesiculas sem sorting signals também são empacotadas, mas com menos eficiência.

Question 46

Na formação do revestimento de COP ___ é importante a presença do ______________, um heterodímero Sec23/24, no qual o Sec__ é um ___ que se liga especificamente ao Sar-1 enquanto que o Sec__ vai ligar-se sobretudo a cargas membranares ou à porção citosólica de recetores que ligam cargas solúveis no lúmen.
É ainda necessário o heterodímero ________ que atua na deformação da membrana e na formação da estrutura em gaiola da vesícula.

Answer 46

II - GTPase Sar-1 - 23 - GAP - 24 - Sec13/31

Question 47

Um recetor que tem alta afinidade para a sequência KDEL, quando uma proteína misfolded apresenta este sinal no Golgi, forma-se uma vesicula COPI, com a proteína ligada ao recetor e esta é reciclada para o ER. V/F?

Answer 47

V

Question 48

Na reciclagem, quando a vesícula chega ao ER, a proteína é libertada através de alterações na acidez, sendo que o pH do ER é mais ácido. V/F?

Answer 48

Falso. O pH do ER é mais alcalino.

Question 49

O complexo de golgi pode ser dividido em _ partes, que são…

Answer 49

5
o cis Golgi network (rede de entrada a partir do ER), o cis Golgi (marcado por ósmio), Golgi medial, Trans Golgi (pode ser marcado por disfosfatase de nucleósidos) e Trans Golgi network (rede de saída do Golgi que pode ser marcada por fosfatase ácido).

Question 50

Qual é a parte do complexo de golgi que está mais próximo do ER?

Answer 50

cis Golgi network

Question 51

Como se distingue as diferentes regiões do golgi?

Answer 51

nas suas cisternas existem vesículas com diferentes conteúdos proteicos.

Question 52

No complexo de Golgi, as vesículas que se formam são do tipo COPI e são responsáveis pela reciclagem de proteínas entre este complexo e o ER e o tráfego de proteínas dentro do Golgi. V/F?

Answer 52

V

Question 53

Quais são os 4 principais tipos de modelos para explicar o transporte entre cisternas de Golgi? Defina-as sucintamente.

Answer 53

Modelo de maturação de cisternas: As diferentes partes do Golgi são dinâmicas, e vão amadurencendo, ou seja, elas começam todas como cis Golgi network e acabom todas como Trans Golgi network. Neste caso, os enzimas residentes são sempre reciclados através das vesículas para a cisterna que lhe é especifica.

Modelo de transporte vesicular: Neste modelo, o complexo de Golgi é considerado como uma estrutura quase
estática e as moléculas passam pelas cisternas através de vesículas de transporte. (Proteínas grandes podem não caber)

Modelo da maturação de cisternas modificado: Este modelo assume que existe uma distribuição rápida das proteínas pelo Golgi e que estas deixam o Golgi de forma uniforme. Portanto, neste modelo as cisternas vão amadurecendo para formar cada uma delas, mas também existe algum transporte vesicular.

Modelo de partição rápida: Existem dois domínios lipídicos, um rico em esfingolípidos que contém as proteínas residentes do Golgi e outro rico em glicerofofolipidos que desempenha as funções de transporte.

Question 54

As vesículas formadas no golgi são muito ricas em…

Answer 54

colesterol

Question 55

Cada subunidade de clatrina é constituída por __ cadeias pesadas e __ cadeias leves.

Answer 55

3 - 3

Question 56

As clatrinas são capazes de ligarem à membrana e a proteínas transmembranares específicas de forma autónoma. V/F?

Answer 56

Falso. Para promover a ligação da clatrina à membrana e a proteínas transmembranares específicas, são necessárias as adaptinas. Normalmente são estas adaptinas que reconhecem a carga.

Question 57

Qual é a função da dinamina?

Answer 57

A dinamina associa-se à vesícula em formação, quando o revestimento já tem uma área considerável e cliva a parte ligada à membrana de modo a que a vesicula acabe de se formar. (É ela que corta o cordão umbilical da vesícula)

Question 58

É necessário adaptinas para se formar uma vesícula de clatrina. V/F?

Answer 58

V

Question 59

Qual é a função de Hsp70 nas vesículas?

Answer 59

Remover o seu revestimento. (É uma ATPase)

Question 60

Indique as três proteínas muito importantes no processo de fusão de vesículas.

Answer 60

1. Proteínas SNARE (SNAP Receptor) – Especificidade e catálise da fusão
2. GTPases de reconhecimento de Rab – regula a ancoragem da vesícula com a membrana alvo
3. Proteínas SM (Sec1 in yeast, Munc18 in mammals) – Regula o binding das proteinas SNARE

Question 61

As proteínas SNARE existem apenas na membrana do organelo recetor. V/F?

Answer 61

Falso. Existem nas membranas do doador e do receptor

Question 62

Qual é a interação das NSF com as SNARES?

Answer 62

NSF serão as responsáveis pela remoção das interações entre SNAREs e promover a sua reciclagem.

Question 63

A região N-terminal das Rab é muito variável e determina a sua localização intracelular. V/F?

Answer 63

Falso. É a região C

Question 64

As proteínas Rab apresentam muita variabilidade, por isso, a afinidade das proteínas Rab depende da fase citosólica das bicamada lipídicas em cada organelo. V7F?

Answer 64

V

Question 65

Qual é o principal objetivo das proteinas Rab em relação as vesículas de transporte?

Answer 65

1. Concentrate and bind vesicles to the correct target
2. Release SNARE proteins speeding up the pairing/fusion

Question 66

Vesículas de clatrina têm uma meia-vida muito longa. V/F?

Answer 66

Falso, muito curta. (Uma vida de consequências)

Question 67

Quando existe um ligando extracelular pretende entrar para a célula, este liga-se a um recetor especifico da membrana que normalmente se liga a um domínio de clatrina. V/F?

Answer 67

V

Question 68

O que é que a célula faz quando necessita de colesterol?

Answer 68

Ela sintetiza receptores de LDL ao nivel da membrana.

Question 69

A maturação dos endossomas é geralmente acompanhada pela sua acidificação. V/F?

Answer 69

V

Question 70

Quais são os três principais destinos dos endossomas?

Answer 70

Reciclagem, degradação ou transcitose

Question 71

A reciclagem do recetor de LDL é lenta, visto que ocorre após a maturação do endossoma. V/F?

Answer 71

Falso, é rápida porque ocorre ainda com o endossoma primário.

Question 72

O que é um corpo multivesicular?

Answer 72

Um meio termo entre endossoma primário e tardio que migram ao longo dos microtubulos para o interior da célula.

Question 73

Como é que se converte um endossoma tardio num lisossoma?

Answer 73

Endossomas tardios podem ser convertidos em lisossomas ao receberem os hidrólases ácidos provenientes do TGN.

Question 74

Que tipos de exocitose existem?

Answer 74

A exocitose regulada e não regulada. Na não regulada, os compostos são produzidos e imediatamente são entregues a membrana/exterior sem seletividade.
Na regulada, as moléculas são retidas dentro de vesículas de secreção e só são exocitadas quando encontram um sinal que lhes mande serem exocitadas.

Question 75

No TGN ocorre a agregação seletiva das moléculas e o seu empacotamento, mediado por sinais de sorting. A maturação envolve a concentração de conteúdo, em resultado da reciclagem da membrana e da progressiva acidificação.

Answer 75

O que são vesículas de secreção?

Question 76

Nas vesículas de secreção, elas encontram-se ancoradas a membrana celular mas o complexo transSNARE está incompleto, o que permite que elas estejam presas à membrana sem se fundirem com a membrana até ser recebido um estímulo. V/F?

Answer 76

V

Question 77

O contacto entre ER e outros organelos envolve a fusão das membranas das suas vesículas com as membranas desses organelos. V/F?

Answer 77

Falso. Involve a sobreposição das membranas.