Module 9: Méthodes d'analyse des échantillons de bioaérosols Flashcards
Énoncer les effets néfastes de l’aérosolisation et de l’échantillonnage sur les microorganismes contenus dans les bioaérosols (5)
Diminution du potentiel à croitre (viabilité)
Dégradation des acides nucléiques
Déshydratation
Pas de nutriments
Dommages membranaires
Quelles sont les différentes méthodes d’analyse par culture (2), microscopie (3), biologie moléculaire (2) ainsi que des méthodes d’analyse chimiques (3) et biologiques (2)
Quantification des colonies et des plages de lyses
Identification d’isolats de microorganismes
Microscopie photonique à fond clair
Microscopie photonique à contraste de phase
Microscopie photonique en fluorescence
PCR/qPCR
séquençage
Chromatographie en phase gazeuse
Chromatographie en phase liquide à haute performence
Spectrométrie de masse
Analyses immunologiques (ELISA)
Analyses de toxicité
Déterminer les limites des différentes méthodes d’analyse
Méthodes par culture
On ne sait pas combien d’organismes sont à l’origine des UFC ou UFP & seulement des organismes cultivables
Méthodes par microscopie
Pas bon pour identifier les bactéries (fond clair)
Bon pour identifier les bactéries seulement à l’état frais (contraste)
L’autofluorescence rend l’échantillon non analysable, limité par la diffraction de la lumière (fluorescence)
Méthodes moléculaires
Ne peut pas identifier tous les virus comme les bactéries avec 16S (pas de gène universel conservé)
Méthodes chimiques
Peu sensible et nécessite des échantillons très chargés en MO
Méthodes biologiques
On doit connaître l’identité des MO dans l’échantillon (immuno)
requiert une mise au point et une expertise rigoureuses (toxicité)
Énumérer les différentes méthodes d’identification des isolats de microorganismes cultivables
Bactéries
Gram + tests métaboliques + galerie API
Moisissures
Identification macroscopique et microscopique morphologique
Expliquer la méthode des trous positifs associée à l’emploi d’impacteurs à trous multiples.
La méthode des trous positifs tient compte de la probabilité de superposition de plusieurs microorganismes sur une même zone d’impaction.
Le kit commercial LIVE/DEAD® BacLight™ Bacterial Viability Kit permet de différencier en microscopie à fluorescence les bactéries viables de celles mortes. Comment est-ce possible?
Il y a deux type de fluorochromes.
Ceux qui pénètrent l’ensemble des cellules et qui se lient spécifiquement à l’ADN
Ceux qui ne pénètrent que les cellules ayant une membrane plasmique endommagée (mortes)
À quel impacteur est associée la table de correction, la Méthode des trous positifs? Que corrige-t-elle? Si j’ai 50 colonies de bactéries (r), quel est le compte le plus probable (corrigé, P) selon la table de correction?
L’impacteur à trous multiples
Elle corrige la superposition des microorganismes impactés sur la surface d’échantillonnage
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