Module 8 Flashcards
Qu’est-ce que la sensibilité (Se) d’un test diagnostique binaire?
C’est la probabilité qu’un test réalisé sur une personne malade se révèle positif.
Qu’est-ce que la spécificité?
La probabilité qu’un test réalisé sur une personne saine se révèle négatif.
Qu’est-ce que la VPP?
La VPP est la probabilité d’être réellement positif (malade, infecté, etc.) lorsque le test est positif.
De quels facteurs va dépendre la VPP?
- Se (sensibilité)
- Sp (spécificité
- Prévalence
A : le test est positif
B : la patient est malade (réellement)
Se = ?
P(AIB)
A : le test est positif
B : la patient est malade (réellement)
VPP = ?
P (BIA)
Pourquoi la réalité est bien pire (calculer le VPP)?
- Présence (non anticipée) d’hétérogénéité dans les données
- Mauvais contrôle du niveau global α dans les analyses
- Calcul de puissance inadéquat lors de la conception de l’étude (ou alors étude qui ne complète pas son recrutement)
Pourquoi π ne peut pas être trop élevé?
Car il deviendrait non éthique de faire un ECR si on était à 90 % certain que l’intervention soit efficace
Que représente π?
La probabilité marginale (avant l’étude) que l’intervention soit vraiment efficace
Est-ce que la puissance = VPP?
Non
Quand est spécifié la puissance d’un ECR?
Lors de la conception de l’ECR et du calcul de la taille d’échantillon
Qu’est-ce qui compte le plus pour un organisme réglementaire et pour le patient, VPP ou puissance?
VPP
Qu’est-ce qui compte le plus pour une demande de financement, VPP ou puissance?
Puissance (forte probabilité de rejeter H0 si l’intervention est réellement efficace)
Combien d’études minimum pour l’homologation?
2
Qu’amène l’exigence de 2 ECR?
- Augmente sensiblement la VPP
- Réduit le risque de mettre sur le marché un traitement inefficace
Pourquoi est-ce qu’on a un intérêt des 2 côtés si un faux positif concerne seulement un côté de l’intervalle?
Pour savoir si il y a un effet néfaste et son niveau de signification
Comment obtient-on un échantillon représentatif de la population?
- Sélection aléatoire
- Méthode d’échantillonage
Que permet d’obtenir l’échantillon représentatif?
Une estimation valide des paramètres
Est-ce que, généralement, les échantillon des ECR sont représentatif?
Non
Est-ce c’est grave d’avoir un échantillon non-représentatif?
Non, validité interne
En vertu de quoi les groupes sont comparables?
- Absence de biais
- Randomisation
Qu’est-ce qui rend l’échantillon de l’ECR non représentatif?
Critères d’inclusion et d’exclusion
Est-ce que la validité externe peut se démontrer si il n’y a pas de validité interne?
Non
Que définissent les critères d’inclusion et d’exclusion?
Ces critères définissent la population de patients pour laquelle les résultats de l’étude vont s’appliquer
Le recrutement dans les essais cliniques est _____________.
opportuniste
Est-ce que la preuve de la validité externe est nécessaire pour l’homologation?
Non
Nom des études pour la validité externe?
Études complémentaires
Quelles sont les caractéristiques des essais cliniques pragmatiques?
- Moins de critères d’exclusion/inclusion
- Groupes plus hétérogènes
- Réponse au traitement hétérogène
- Conditions réelles
Différence efficience vs efficacité?
- efficacité: théorique
- efficience: efficacité dans la vrai vie
Est-ce que l’allocation 3:1 demande plus de participants que l’allocation 1:1?
Oui
40% de plus
Comment est-ce qu’on vérifie si nos résultats sont dû à un biais de confusion?
Stratification
Qu’élimine une randomisation qui fonctionne?
Le biais de confusion
Est-ce que la randomisation a plus de chances de fonctionner sur un grand ou sur un petit échantillon?
Grand
Est-ce qu’il existe des approches statistiques pour contrôler les biais de confusion?
Oui (hors de porté de ce cours)
Utilité de la table 1 (présentation des statistiques au recrutement)?
Identifier des facteurs de confusion
Problème de la stratification?
- On ne peut pas stratifier pour une variable qu’on a pas mesuré
- Ne fonctionne que pour des facteurs dichotomiques
Quand est-ce que la stratification n’est pas disponible?
Facteur de confusion non dichotomique
Qu’utilisent les approches statistiques pour contrôler le biais de confusion?
Modélisation
Modélisation desing 1 CRP continu?
Yi = β0 + β1Ti + ϵi
Yi = β0 + β1Ti + ϵi
Décrit les variables.
- Yi est la réponse du patient i
- Ti une variable indicatrice (0 si gr placebo, 1 si gr exp)
- ϵi est l’erreur aléatoire
- β0 moyenne du gr placebo
- β1 différence de moyenne
But du modèle de régression?
Estimer le β1
Formule d’un modèle multivarié?
Yi = β0 + β1Ti + β2Fi + ϵi
Fi?
Facteur dichotomique (ex: variable de confusion)
B3?
Terme d’interaction
on ajoute dans la formule: B3 (Ti X Fi)
Lorsque F est un facteur de confusion, on dira que l’estimateur de β1 est _______________________.
ajusté pour le facteur F
Que permettent les modèles multivariés?
- Estimer B1
- Augmenter la puissance
- Réduire l’erreur-type
Que sont les 2 principales sources de variations?
- Entre les participants
- Entre les centres de recrutement
Formule qui inclut l’impact des centres?
Yi = β0 + β1Ti + β2Ci + ϵi
Ci = 0 pour centre 1 et Ci = 1 pour le centre 2
Avantage de ce modèle: Yi = β0 + β1Ti + β2Ci + ϵi?
- Il permet de séparer la variation entre celle des patients et celle des centres
- Ceci réduit l’erreur-type pour l’estimation de β1 et augmente ainsi la puissance de l’étude
Quels ECRs utilisent cette formule: Yi = β0 + β1Ti + β2Ci + ϵi?
ECR multicentrique
Modèle de régression pour un CRP dichotomique?
Modèle de régression logistique
Modèle de régression pour un CRP dichotomique?
Modèle de régression logistique
Qu’utilise le modèle de régression logistique?
Rapport de cotes (RC), car ce modèle ne permet pas l’estimation de la différence de proportion
Modèle de régression pour les proportions?
Modèle de régression binomiale
Modèle de régression pour un CRP d’incidence?
Modèle Cox à risque proportionnel
Les modèles de régressions sont-ils paramétriques?
Oui
Vrai ou faux? L’efficacité des traitements est la même pour tous.
Faux
Le terme d’interaction peut être ___________.
négatif ou positif
Qu’est-ce qu’un terme d’interaction?
Au minimum le produit de 2 variables mesurées dans l’ECR
Comment peut-on créer un terme d’interaction?
En multipliant les variables
Que permettent de vérifier les termes d’interactions?
Vérifier l’homogénéité de l’efficacité
Cas d’un vaccins T x Age est 0
Interprétation?
Ceci implique que l’efficacité du vaccin est homogène au niveau de l’âge
Utilités dans un contexte d’ECR des termes d’interactions?
- Homogénéité de l’efficacité
- Contrôler les biais de confusion
Typiquement, si on cherche à vérifier que l’efficacité du traitement est homogène pour les différentes caractéristiques des patients (cliniques et socio-démographiques), que doit-on évaluer?
Les interactions entre le traitement et ces caractéristiques
Qu’est-ce qui se passe si on ne compartimente pas les différentes sources?
- Augmente l’erreur-type de la réponse
- Perte de puissance
La modélisation permet d’intégrer différentes sources de __________.
variation
Nomme 3 sources de variations.
- Entre les patients
- Effets du traitement
- Différents centres
L’erreur-type pour l’estimé de β1 pour le modèle 1, qui inclus le facteur traitement et centre, est proportionnelle à….
√ (Vp/Vt)
Vp = variance patient et Vt = variance traitement
L’erreur-type pour l’estimé de β1 pour le modèle 1, qui inclus le facteur traitement seulement et non le centre, est proportionnelle à…
√(Vp + Vc)/Vt
À quelle variation s’ajoute celle des centres si elle n’est pas prise en compte séparément dans le calcul de l’erreur-type?
À celle des patients
La variance d’une somme de variables est la somme des variances si __________________
il y a indépendance des variables
Nomme les 4 façons de quantifier l’effet d’un nouveau traitement.
Quand on a des deux prises de mesures par groupe
- En ignorant les valeurs du CRP prises au recrutement
- En calculant le changement absolu par rapport à la tension au recrutement
- En calculant le changement relatif par rapport à la tension au recrutement
- En modélisant la valeur du CRP du recrutement
Nom de la modélisation du CRP au recrutement?
analyse de covariacne: ANCOVA
Formule de ANCOVA?
Yi = β0 + β1Xi + β2Ti
Les changements _______ sont très prisés par les cliniciens.
relatifs
Est-ce que les 4 méthodes sont équivalentes ? (pour quantifier l’effet d’un nouveau traitement)
- Même conclusion
- Différence au niveau de IC et des tests statistiques
La taille d’échantillon est en fonction de l’___________
erreur-type
Meilleure méthode pour quantifier l’effet d’un nouveau traitement?
ANCOVA: modélisation par l’analyse de covariance
De quoi va dépendre l’impact sur la taille d’échantillon?
Va dépendre de la corrélation entre les mesures prises au recrutement et à la fin de l’intervention
De quoi protège ANCOVA?
Des biais de confusion
Est-ce qu’une des conditions pour le biais de confusion est qu’il soit associé à un facteur intermédiaire?
Non
Pourquoi le changement relatif est une méthode à proscrire?
Parce qu’il peut augmenter le nombre de participants de l’ECR
Qu’est-ce que l’ANCOVA? ANCOVA est comparable à quelle autre méthode?
L’ANCOVA est une différence absolue du changement par rapport au recrutement. Elle est comparable au calcul du changement absolu, mais estimation est meilleure et réduit l’erreur-type.
Pour quels CRP est utilisé l’ANCOVA?
Tous sauf incidence
Vrai ou faux? L’ANCOVA n’empêche pas de conclure de façon relative.
Vrai
Quel est le plus grand problème de tout les ECR?
Donnés manquantes
Qu’engendrent les pertes au suivi?
Biais de confusion
La taille du biais est associée au _____ des pertes.
chiffre
De quoi dépend le seuil acceptable de perte?
- Contexte
- Design (type d’ECR)
- CRP
Sorte de pertes qui permettent tout de même d’obtenir une réponse valide sans biais associé?
aléatoire
Est-ce qu’il est possible de prouver que les pertes au suivi sont aléatoires?
Non, il est rarement possible de prouver que les pertes ne sont pas associées au CRP et aux interventions
Meilleure solution pour les pertes?
Prévention
Une méthode souvent utilisée par les organismes réglementaires est ________________________.
l’imputation par la « pire » valeur
Que cherche à prouver l’imputation extrême?
La stabilité de la conclusion face à la pire situation possible
Nomme une autre méthode préventive contre les pertes?
Ajuster la taille d’échantillon en fonction des pertes au suivi anticipées (aide pour maintenir la puissance, pas pour diminuer le biais)
Perte de précision ou de biais la plus importante?
Biais
Pourquoi est-ce si difficile d’analyser les biais?
Ils sont difficiles de les quantifier et de définir leur direction
Mais si l’attrition est élevé, le contrôle par l’imputation extrême devient beaucoup trop _________.
conservateur
Est-ce que le CRP est rare dans la majorité des cas?
Oui
Quelle étude allons-nous faire avant celle qui utilise le CRP?
Étude préliminaire
Que va valider l’étude préliminaire?
Le mécanisme de l’intervention, la preuve de concept
Caractéristiques du critère de substitution (CS)?
- Peut se mesurer bien avant le CRP
- Peut se mesurer avec précision
- Prédit le critère de résultat principal (le CRP)
Avantages d’une étude avec un CS?
- Moins de gens
- Plus courte
L’intervention expérimentale, si elle est efficace, va interrompre le lien entre la ______ et le ___.
maladie
critère de substitution (CS)
Vrai ou faux? Une preuve du concept est suffisante pour démontrer un effet sur le CRP
Faux
Que faire après avoir validé la preuve de concept/l’effet de l’intervention sur le CS?
Faire la preuve de l’effet sur le CRP
Est-ce que la régression vers la moyenne est l’effet placebo?
Non
Décrit le design avant/après.
- Une mesure au début
- Une mesure à la fin
- Non expérimental
Qu’est-ce que le phénomène de régression vers la moyenne?
Les individus dans les extrêmes de la distribution vont régresser vers le centre de la distribution lorsqu’on les mesure à nouveau dans le temps
Pourquoi voit-on beaucoup de régression vers la moyenne dans les ECR?
Il est très fréquent que les critères d’inclusion et d’exclusion utilisés lors du recrutement vont sélectionner des patients dans les extrêmes de la distribution du CRP
Est-ce que la régression vers la moyenne est un problème?
Non, si on a un groupe contrôle
Est-ce que l’effet placebo peut se rajouter à l’effet de régression vers la moyenne?
Oui
À quelle mesure s’exprime la régression vers la moyenne?
La deuxième
Est-ce que le design avant/après permet de quantifier les tendances temporelles?
Non
Que permet l’IA?
- Simultanément observer et traiter rapidement un nombre presque illimité d’entrées
- Apprendre de chaque cas (apprentissage) et raffiner leurs algorithmes automatiquement
Est-ce que l’IA est très utile en ECR? Pourquoi?
Dans le cadre des ECRs, l’IA joue un rôle secondaire, car la question de recherche est spécifique et la structure des données en terme de réponse est relativement simple et connue
Rôles de l’IA dans les ECR?
- Questions secondaires en lien avec la génétique
- Médecine personnalisée
Dans quel contexte l’IA joue-t-elle un rôle important et pourquoi?
- Méta-analyses et revues systématiques
- Permet de faciliter l’extraction d’information et de raffiner les résultats au jour le jour
Qu’est-ce que l’IN?
L’intelligence numérique (IN) est un ensemble d’outils et de méthodologies, incluant l’IA, pour passer de la donnée à la décision
À quoi peut référer l’IN?
- À l’analytique des données, particulièrement sous ses angles descriptifs, prédictifs et prescriptifs
- Aux différentes approches d’ordre techno-scientifique qui permettent de passer de sources de données à de la création de valeur sociale ou économique
Qu’est-ce qu’un bit?
Un bit est la quantité minimale d’information transmise par un message, et constitue l’unité de base de l’information en informatique
8 bit?
Octet
Nomme les 6 V des données massives.
- volume
- vélocité
- variété
- visibilité
- valeur
- véracité
Problème avec les données massives?
Ressources : logiciel et matériel
Est-ce que l’ecr typique génère des données massives?
Non
