Module 8

Question 1

Concernant l’assignation populationnelle

Quelle est la méthode

Answer 1

méthodes statistiques qui utilisent de l’information
génétique afin d’établir l’appartenance d’un individu (ou d’un groupe d’individus) à
une population

Info génétique
• Information génétique:
– Marqueurs polymorphes (microsatellites, SNP, AFLP)
– Génotype multilocus de l’individu inconnu
– Fréquences alléliques des populations candidates

Question 2

Quelle est l’utilité du logiciel structure

Answer 2

• Définir des groupes génétiques homogènes (cluster)
• Assignations individuelles
• Vérifie la présence ou l’absence de migrants entre ces groupes et d’hybrides

Question 3

Quelle st la méthode globale de l’assignation populationelle

Answer 3

Échantillonage global

Génotypage

faire un tableau des génotypes : identifer des allèles de dif locus pour les individus échantillonés ( microsat)

Question 4

Quelle info génétique ont a besoin pour l’assignation parentale

Answer 4

• Information génétique:
– Marqueurs très polymorphes (microsatellites)
– Génotype multilocus du rejeton inconnu
– Génotypes multilocus des parents candidats

Question 5

Que sont les méthodes possibles en assignation parentale

Answer 5

1- méthode exclusion

2. Méthode d’allocation
   a) Catégorique
   b) Fractionnelle

Question 6

A quoi consiste la méthode d’exclusion ?

On l’utilise quand %

Answer 6

• À utiliser lorsque : on connait un des 2 parents
• Principe : Un parent et son jeune partagent au moins un allèle par locus. Un parent
  candidat qui ne partage pas au moins un allèle à chaque locus avec le rejeton est
  éliminé.

Question 7

Que sont les avantages et les inconvénients de la méthode d’exclusion

Answer 7

• Avantages:
  o Simple d’utilisation
• Inconvénients :
  o L’exclusion complète peut être difficile dans de grosses populations (beaucoup
  de parents potentiels et de progénitures)
  o Si mutation germinale chez le parent, fausse exclusion

Question 8

Que sont les avantages et les inconvénients de la méthode d’allocation catégorique

Answer 8

• Avantages :
  o Erreurs de génotypage et mutations prises en compte dans l’assignation
• Inconvénients :
  o Puissance de calculs supérieure (ordinateurs)
  o Moins intuitif

Question 9

Quel est le principe de la mtéhode d’allocation fractionnelle ?

Les avantages ?

Les inconvénients

Answer 9

• Principe : Assigner la probabilité de parenté de chaque parent d’un groupe de
  parents potentiels, en considérant que les différents génotypes des parents
  potentiels peuvent avoir une probabilité différente d’avoir engendré le génotype du
  rejeton
• Avantages :
  o Erreurs de génotypage et mutations prises en compte dans l’assignation
  o Nécessite moins d’informations au préalable
• Inconvénients :
  o Pas d’assignation définitive à un seul couple de parents

Question 10

Que sont les les erreurs à considérer pour les analyses (EXAMEN )

Answer 10

• Erreurs de génotypage
• Présence d’allèles nuls
• Occurrence de mutations

Question 11

A quoi faut il faire attention lors de l’assignation parentale

Answer 11

– Loci polymorphiques en nombre suffisant
(sinon, manque de résolution)
– Bonne couverture d’échantillonnage des parents candidats (si possible…)
(sinon, assignation par défaut
– Erreurs à considérer dans l’analyse :

– Génotypage d’un nombre élevé de rejetons pour analyses de succès
reproducteur
(sinon, mauvaise représentativité)