MODULE 7: La Systématique

Question 1

Définir la systématique et ses deux composantes

Answer 1

(i) la systématique: discipline dont l’objectif est de classifier les organismes et d’établir leurs liens évolutifs
(ii) deux types:
- Taxonomie: Discipline qui désigne et classifie les organismes
- Phylogénie: Discipline qui étudie l’histoire de l’évolution d’une espèce ou d’un groupe d’espèces apparentées

Question 2

1. Faire la distinction entre trait homologue et analogue
2. Expliquer en quoi cette distinction est importante

Answer 2

• Trait homologue: similarité morphologiques/structurales des organismes due à un ancêtre commun
• Trait analogue: structure similaire mais pas d’un ancêtre commun
  L’analogie regroupe des espèces qui ont quelques traits partagés spécifiques peut donc mener à des classifications linéenes qui ne réflètent pas la phylogénie des organismes (trait évolutifs - homologie)

Question 3

Être confortable avec les arbres phylogénétique et à utliser les termes les entourant

Answer 3

• arbres phylogénétique: diagramme arborescent hypothétique qui rend compte de l’histoire évolutive d’un groupe d’organismes et dans lequel chaque noeud représente l’ancêtre commun de ses descendants
• extrémités: descendants
• racine: ancêtre
• groupe frères (noeud se divisant en branches: évènement de spéciation) : descendants du même ancêtre
  -groupe monophylétique: groupe composée d’une espèce ancestrales et de tous ses descendants
• groupe paraphylétique: groupe composée d’une espèce ANCESTRALE et de CERTAINS de ses descendants
• groupe polyphylétique: groupe composée d’espèces parentales mais qui EXCLUE leur ANCÊTRE COMMUN LE PLUS RÉCENT

Question 4

Nommer les principes de base de la cladistique

Answer 4

• cladistique: méthode relevant de la systématique dont le principal critère de classification est l’ancêtre commun
• clade: groupe incluant une espèce ancestrale et tous ses descendants (clade monophylétique)

Question 5

Expliquer la logique derrière la construction des phylogénies et la distinction entre caractère dérivé commun et caractère dérivé ancestral commun

Answer 5

• l’évidence d’ascendance partagée vient de caractères homologues car les caractères analogues peuvent être trompeurs
• les caractères homologues peuvent être divisés en:
  (i) caractère ancestral commun: caractère partagé par les membres d’un clade particulier mais provenant d’un ancêtre qui n’est pas membre de ce clade
  (ii) caractère ancestral commun: innovation apparue au cours de l’évolution qui relève exclusivement d’un clade particulier (phylogénie basée sur celà)
  -

Question 6

Expliquer le principe de parcimonue maximale dans le contexte de la construction de phylogénis

Answer 6

• Principe de parcimonie maximale: l’arbre le plus probable est celui qui implique le petit nombre d’évènements évolutifs

Question 7

Discuter les différences entre un cladogramme et un phylogramme et nommer deux méthodes permettant d’ajouter des dates aux arbres phylogénétiques

Answer 7

• Cladogramme: Ne montre que le partron d’embranchement sans information sur le temps ou l’ampleur du changement
• Phylogramme: Montre les patrons d’embranchement ET la longueur des branches est proportionelle soit à l’ampleur du changement genétique soit au temps des différents points de bifurcation
  La datation peut être faite avec:
  1. Les fossiles: en combinaison avec la datation radiométrique et/ou la strtigraphie (étude des couches minérales)
  2. Les horloges moléculaires: assument que le taux de substitutions de nucléotides par unité de temps est constant pour un gêne donné
  NOTE: Utilités des analyses phylogénétique:
  1. Prédire des traits d’organismes éteints à partir des caractères partagés
  2. Comprendre l’orgini des maladies humaines
  3. 6ème extinction de masse en courte