Module 4.2 : L'épissage de l'ARN Flashcards
3 processus co-transcriptionnels
- L’addition de la coiffe
- L’addition de la queue de poly-A
- L’épissage
*Tous coordonnée par le niveau de phosphorisation de la queue CTD
Qu’est-ce qu’un exon
Partie restante post-épissage, ARNm mature, pas uniquement codante!!!
La découverte des introns et de l’épissage
On s’est rendu compte qu’à partir du même transcrit, ce qui est conservée variait (diversité)
Relation nombre d’introns et complexité de l’organisme?
- Plus l’organisme est complexe,
plus il y a d’introns/gène - Chez l’humain,
- entre 1 et 363 introns/gène
- moyenne 8 introns/gène
Taille introns/exons et variabilité
Introns : grands, mais très variables ! (De 60 pb à 800 000 pb)
* Moyenne 1800 pb
Exons : Petit et moins variables
* Moyenne 150 pb
Avantage de l’épissage relié à l’épissage alternatif?
Créer plus de protéines à partir de moins de gènes, meilleure diversité!
Quelles sont les éléments de la séquence d’un intron qui permettent sont épissages par le spliceosome?
- sites d’épissage :
* GU au site 5’ de l’intron
* AG au site 3’ de l’intron - Site de branchement A près du site d’épissage 3’
- Tractus Py : zone riche en pyrimidine après le site de branchement.
2 réactions de transestérification ont lieu durant l’épissage (bris et reformation de lien phosphodiester)
- Le A (branch site) fait une attaque nucléophile sur l’extrémité 5’ de l’intron (gr. phosphate)
→bris du lien phosphodiester
1.2 : A va former 3 liens phosphodiester :
* 2 liens 5’-3’ et 3’-5’ (standard)
* 1 lien 2’-5’ avec le G du site d’épissage 5’
→ forme de lassot.
2.* 3’-OH de l’exon 1 libéré attaque le groupement phosphate 5’ de l’exon 2
* Excision de l’intron (lariat)
* Union des deux exons
De quoi dépend la machinerie du spliceosome ?
- Des snRNP (“snurps”) : small nuclear RiboNucléoProtéines
→ 5 Complexes ARN-protéines - requiert l’hydrolyse de l’ATP
Le spliceosome est énorme(12 megadaltons / 30 fois ARN polymérase) de quoi est-il composé autrement que les snurps?
Pour le cours : de splicing factors : des hélicases
Trois rôles snRNP?
- Ils reconnaissent le site d’épissage 5’ et le site de
ramification - ils rassemblent ces sites
- ils catalysent les réactions de transestérification
Premier complexe du spliceosome, il y a deux Interactions ARN-protéines
Complex E (pour early)
1. U2AF : U2 auxiliary factor
2. BBP : Branch-point-binding protein
→ U2AF arrive le premier et facilite l’arrivée de BBP, U1 reconnait et se lie au site d’épissage 5’
Quelle est le deuxième complexe du spliceosome et décrit le.
Complexe A : U2 prend la place de BBP et cela favorise l’excroissance du branch site A, le rendant disponible à la catalyse!
Troisième complexe du spliceosome
Complexe B : entrée de 3 nouvelles snRNP (U6, U4 et U5) : particule tri-snRNP [Stabilisateur]
* Perte de U2AF
*U6, comme U1 reconnait le site d’épissage en 5’
→ cela rapproche U1 et U2, forme en U
**Manque une étape, la première de C
Quatrième et dernier complexe du spliceosome ?
Complexe C (pour Catalyse)
1. premier réarrangement du
spliceosome remplace U1 par U6
au site 5’ de l’intron
→ Hélicase ATP-dépendant dégage U1 (brise l’hybride ARN-ADN)
2. Un deuxième réarrangement du
spliceosome éjecte U4 et vient
placer U2 et U6 côte à côte.
→ Formation du site catalytique! Permet les 2 réactions de transestérification vu précédemment.
