Module 3 - virus respiratoires Flashcards

1
Q

qu’Est ce qui rend les virus à ARN+ ss très infectieux?

A

leur génome est reconnu immédiatement comme un ARNm

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2
Q

qu’est ce qu’une RDRP? quelle est sa différence avec une ARN polymérase cellulaire?

A

une RDRP est une ARN polymérase qui peut utiliser un brin d’ARN comme brin matrice. La pol de la cellule ne peut utiliser qu’un brin d’ADN comme matrice pour créer un ARN

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3
Q

à quoi sert la protéine VPg au bout du génome du rhinovirus?

A

à empêcher le génome d’être traduit. elle peut être retirée pour causer la traduction ou conservée pour encapsider les virions
Elle sert d’amorce à la 3Dpol pour la synthèse du brin ARN- lors de la réplication

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4
Q

Comment le rhinovirus entre-t-il dans la cellule?

A

entre les protéines de la capside VP1 et VP2-3, il y a un canyon qui est reconnu par le récepteur ICAM-1 cellulaire ou le LDLR

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5
Q

comment fonctionne les antiviraux contre le rhinovirus?

A

ils vont bloquer le canyon qui est reconnu par le récepteur cellulaire

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6
Q

qu’est ce qui libère le génome rhinoval de sa capside?

A

la baisse de pH dans les endosomes

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7
Q

pourquoi le rhinovirus n’a-t-il pas besoin de transporter des protéines dans la capside?

A

son ARN est reconnu comme un ARNm et donc immédiatement traduit en protéines

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8
Q

qu’est ce que le IRES dans le génome du rhinovirus?

A

une séquence d’ARN qui forme une tige-boucle et dirige le ribosome vers le codon d’initiation de la traduction

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9
Q

à quoi sert la section en forme de trèfle dans le rhinovirus?

A

il se lie aux protéines 3C (ou précurseur 3CD) et à des protéines de l’hôte (poly(a) binding protein) et permet d’amorcer la réplication en formant un complexe nucléoprotéique

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10
Q

Comment se fait la réplication du virome du rhinovirus?

A

Lorsque l’ARN a été traduit et que la 3Dpol est disponible, celle-ci utilise la protéine CPg comme amorce sur le brin d’ARN+ et synthétise un brin d’ARN-
Le brin d’ARN- est ensuite utilisé comme matrice pour répliquer le brin d’ARN+

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11
Q

quelle est la différence entre un ARN+ du rhinovirus qui contient la protéine VPg et qui ne la contient pas?

A

pas de VPg: utilisé pour la traduction en protéine

VPg: utilisé pour la réplication/encapsidation

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12
Q

Comment s’assemble la capside du rhinovirus?

A

les gènes structuraux sont traduits et clivés en VP0,VP1 et VP3 qui forment des pentamères.
La procapside est assemblée ave ces structures.
Lorsque l’ARN est encapsidé, VP0 est clivé pour former VP2 et VP4. Ce dernier clivage forme le novovirion

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13
Q

à quoi sert la protéine virale eIF-4G dans les rhinovirus?

A

fait perdre la capacité de guider la petite sous-unité du ribosome vers la coiffe des ARNm.
résultat: inhibition de la traduction d’ARNm cellulaires

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14
Q

quel branche du système immunitaire donne une protection contre les rhinovirus. Quels acteurs jouent dans cette défence

A
Le SI innée
Les interférons
le complément
Les phagocytes professionnels
Les cellules NK
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15
Q

pourquoi la réponse adaptative est elle moins importante chez les rhinovirus?

A

les anticorps n’apparaissent qu’en faible quantité et trop tard dans l’infection

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16
Q

quelle protéase est responsable de l’évasion du système immunitaire chez les rhinovirus?

A

la protéase 2A

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17
Q

quels mécanismes utilisent le rhinovirus pour évader le SI

A

interfèrer avec la sortie d’interférons à l’extérieur des cellules infectées
drift antigénique à cause de la polymérase ARN-dépendante peu fiable.

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18
Q

combien de type d’influenza existe-t-il?

A

3

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19
Q

quel type d’influenza est responsable est pandémies?

A

le type A

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20
Q

quelles espèces sont sensibles au type A de l’influenza?

A

les mammifères terrestres et marin et une espèce aviaire qui forme un réservoir de diversité virale

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21
Q

quelles espèces sont sensibles au type d’influenza B?

A

L’homme

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22
Q

quelles espèces sont sensibles au type d’influenza C

A

Les humains, chiens et porcs

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23
Q

quels types d’influenza peuvent créer des épidémies?

A

les 3 types

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24
Q

qu’Est ce qui différencie le rhinovirus de l’influenza au niveau de sont site de réplication virale?

A

l’influenza peut se reproduire dans les voies respiratoires inférieurs (jusqu’aux bronchioles)
Tandis que le rhinovirus est très souvent confiné aux voies supérieures

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25
Q

comment se transmet le virus de l’influenza?

A

par des goutellettes aérosols dans l’air
Directe par inhalation
Via les mains/fomites

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26
Q

à quoi ressemble le génome de l’influenza?

A

ARN- segmenté (groupe 5 de baltimore)

formé de 8 ribonucléoprotéines (RNP) différentes

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27
Q

L’influenza est il un virus nu ou enveloppé?

A

enveloppé

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28
Q

où se trouve la protéine M1 dans l’influenza?

A

à l’interface entre les RNP et l’enveloppe

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29
Q

qu’est ce qui est codé par les 8 fragments d’ARN de l’influenza?

A

1à 3: PB2,PB1 et PA. composantes de l’ARN polymérase

4: hémagglutinine
5: NP, liaison avec l’ARN pour former RNP
6: neuraminidase
7: M1 et M2, protéine de matrice et canal ionique
8: NS1 protéine multifonctionnelle et NEP/NS2. protéine de transport des RNP

30
Q

à quoi sert l’hémagglutinine

A

permet au virus de s’attacher à la membrane cytoplasmique par un récepteur (l’acide sialique)

31
Q

à quoi sert la neuraminidase

A

lyse l’acide sialique pour détacher les nonovirions à la fin de l’infection et hydrolyse le mucus couvrant l’épithélium.

32
Q

quels sont les points communs de l’hémagglutinine et la neuraminidase?

A

ils font partie du mode d’entrée/sortie de la cellule et sont visés par les anticorps anti-viraux de l’hôte

33
Q

quelle est la différence entre les liens qui relient l’acide sialique au reste de son récepteur chez les oiseaux et les humains?
quel est l’impact de cette différence

A

Les liens sialique-galactose sont alpha 2-3 chez l’oiseau et alpha 2-6 chez l’humain.
Cela permet une spécificité de l’influenza pour l’espèce aviaire ou mammifère

34
Q

à quoi sert le canal ionique M2 de l’influenza?

A

à permettre l’entrée de proton dans l’endosome, ce qui permet la fusion de la membrane du virus et cellulaire après la liaison de HA à l’acide sialique

35
Q

où se passe la réplication du génome viral de l’influenza?

A

dans le noyau

36
Q

quelles sous-unité composent la pol ARN-dépendante de l’influenza?

A

PB1, PB2 et PA

37
Q

quelle structure l’ARN de l’influenza doit-elle voler à l’ARN de l’hôte pour être transcrite/traduite? quelle protéine effectue cette modification?

A

La coiffe 5’ de l’ARNm. PB1 arrache la coiffe par activité endonucléase puis PB2 lie celle-ci au virus

38
Q

combien d’ARNm sont produits à partir de l’ARN- coiffé de l’influenza? pourquoi ce nombre ne correspont-il pas au nombre de fragments qui forment son génome

A

10 ARNm. il y a 8 fragments mais deux fragments subissent un épissage alternatif

39
Q

comment est ce que l’influenza produit d’autres copies de son génome ARN- et quel signal sert à changer l’expression d’ARN+ viral pour de l’ARN- viral?

A

lorsque la concentration de protéines virales (RNP) est suffisante, la troisième sous-unité de la polymérase ARN dépendante vient au noyau pour changer l’activité de la pol. au lieu d’utiliser le brin - comme template pour produire des ARNm viraux, on utilise le brin + comme matrice pour produire le génome viral

40
Q

comment l’influenza s’assemble-t-il en novovirion à la fin de son cycle reproductif

A

Le génome viral est exporté du noyau vers le cytoplasme gràce à la protéine NS2

41
Q

pourquoi y a t’il une très faible proportion des novovirions produits par une cellule qui vont être infectieux?

A

les virions doivent avoir tout les fragments de leur génome pour être infectieux et cet assemblage se fait au hasard. La cellule va donc produire plusieurs virions qui sont assemblés avec des fragments manquants.

42
Q

pourquoi la neuraminidase est elle essentielle au relâchement des novovirions?

A

les récepteurs à acide sialique vont séquestrer les novovirions sur la membrane sans l’action de la neuraminidase

43
Q

dès leur synthèse, les protéines HA et NA sont acheminés à la membrane. Pourquoi ne restent-ils pas dans le cytoplasme?

A

l’influenza quitte la cellule par bourgeonnement en volant la membrane de l’hôte pour créer la sienne. L’insertion de ces protéines dans la membrane permet de préparer celle-ci au bourgeonnement

44
Q

pourquoi l’influenza cause-t-elle une forte fièvre comparée aux rhinovirus?

A

l’influenza entraine une forte production d’interféron par les cellules infectées tandis que le rhinovirus inhibe la production d’interferon

45
Q

Comment l’influenza tente-t-il d’évader la réponse immunitaire?

A

La protéine NS1 va inactiver la protéine PKR qui permet de d’inhiber la diminution de traduction dans la cellule. (PKR permet de réduire la traduction dans les cellules pour inhiber la réplication virale)
NS1 va aussi inhiber la RNase L qui dégrade l’ARNm viral
Le virus fait aussi du glissement antigénique et de la cassure antigénique, ce qui fait varier ses antigènes.

46
Q

en quoi consiste la cassure antigénique? (antigen shift)

A

Une cellule peut être infectée par plus d’un type de virus en même temps. Puisque le génome est fragmenté, il peut y avoir un mix du génome des deux souches d’influenza pour produire un mutant qui présente un mix d’antigène provenant des deux souches

47
Q

comment fonctionnent les antiviraux contre l’influenza?

A

amantadine était auparavent utilisé pour inhiber les canaux ioniques M2, ce qui empêche le virus de fusionner avec la membrane cellulaire
Des inhibiteurs de la neuraminidase sont aussi utilisés pour empêcher les novovirions de se séparer de la cellule.

48
Q

Pourquoi l’amantadine n’est plus utilisée aujourd’hui?

A

une très gros proportion des virus de l’influenza sont devenus résistants à cet antiviral

49
Q

Comment se fait la transmission de la rougeole?

A

goutelettes respiratoires
Directe inhalation des sécrétions du nez/gorge
Gouttelettes aérogènes
Contact indirecte

50
Q

qu’est ce que la rougeole a de spéciale au niveau du tropisme du virus par rapport aux rhinovirus et influenza?

A

le virus ne cible pas les cellules qu’il utilise pour entrer dans le corps. La rougeole va aussi causer une infection systémique

51
Q

comment la rougeole passe-t-elle des voies respiratoires vers les ganglions lymphatiques?

A

elle utilise les cellules dendritiques de l’arbre respiratoire comme taxi vers le système lymphatique

52
Q

quel est le trajet de la rougeole dans le corps?

A
entrée par épithélium
migration vers ganglions lymphatique
dissémination dans le sang
infection d'une multitude de tissus (lymphoides/tube digestif/rein/poumons/foie/peau/conjonctive(
Transmission par aérosols respiratoires
53
Q

quel type d’acide nucléique retrouve-t-on dans la rougeole?

A

ARN- (groupe 5 de baltimore)

54
Q

à quoi servent les protéines de matrice dans la rougeole et dans l’influenza?

A

à stabiliser le génome à l’intérieur du virion

55
Q

combien de gènes se trouvent dans le génome de la rougeole

à quoi ressemble ce génome?

A

6 gène dans un génome non-fragmenté. Chaque gène à son propre ORF

56
Q

Comment se fait l’entrée de la rougeole dans la cellule?

A

l’hémagglutinine (H) permet la liaison à la membrane puis la protéine de fusion F permet de fusionner les membranes virales et cellulaires

57
Q

est ce que la rougeole est un virus hélicoidale ou icosaedrique? comment peut on le déduire à partir de sa protéine qui forme la capside?

A

Hélicoidale. Il n’a qu’une seule protéine qui forme la capside et elle n’est pas clivé lors de son cycle de reproduction

58
Q

quelles protéines permettent d’évader le système immunitaire, comment?

A

Les protéines V et C qui empêchent la production des interférons

59
Q

quelle est la différence entre l’hémagglutinine de la rougeole et de l’influenza?

A

l’influenza lie l’Acide sialique

La rougeole lie le CD46 ou le CD150

60
Q

dans quel type de cellule la rougeole fait elle la majorité de sa réplication?

A

des cellules épithéliales

61
Q

comment l’ARN- de la rougeole est il transcript en ARNm lorsque les nucléocapsides sont libérées?

A

la protéine L et P forment la polymérase ARN dépendant et produire l’ARN+ ainsi qu’une coiffe/queue poly-A

62
Q

Comment la queue poly-A est elle ajoutée sur l’ARNm de la rougeole? comment ce mécanisme diffère-t-il de chez les eucaryotes?

A

la polymérase virale ajoute des adénines par bégaiement quand elle atteint le signal de STOP.
C’est donc la polymérase qui ajoute la queue poly A contrairement aux eucaryotes chez qui la queue est ajouté par modification post-transcriptionnelle

63
Q

pourquoi y a t-il une grande quantité de la protéine N dans les virions de la rougeole?

A

Lorsque la polymérase décroche de l’ARN, elle recommence au début et le gène N est le premier sur le brin.

64
Q

à quoi sert la protéine N de la rougeole

A

lorsque celle-ci est en assez forte concentration dans le cytoplasme, il y a un arrêt de la polyadénylation/clivage des transcripts. La réplicase se met plutot à répliquer le génome entier en un brin + qui sert ensuite de matrice pour fabriquer le brin - qui sera encapsidé
La protéine N sert ensuite à encapsider l’acide nucléique sous sa forme hélicoidale

65
Q

quelle est la différence entre le bourgeonnement de la rougeole et de l’influenza?

A

la rougeole cause la lyse de la cellule lors du bourgeonnement tandis que celle de l’influenza laisse la cellule ‘‘intact’’ (la cellule va quand même mourrir à cause de l’infection virale)

66
Q

Comment la rougeole évade-t-elle le système immunitaire?

A

elle bloque la production d’interféron par la protéine V et la réponse antivirale à l’interféron par la protéine C

67
Q

est ce que les interférons causent les symptomes précoces de la rougeole?

A

non, c’est l’action des cellules et d’Autres mécanismes du système immunitaire inné qui cause ces symptomes

68
Q

pourquoi le virus de la rougeole ne peut pas faire de antigenic drift?

A

des légères mutations dans son génome rendent sa capside non-fonctionnelle

69
Q

Dans quel cas observe-t-on des complications graves dans une infection à la rougeole?

A

lorsque le virus s’attaque à des composantes importantes du système immunitaire comme les lymphocytes T

70
Q

Lequel des 3 virus respiratoires présentés n’a pas besoin de transporter son ARN polymérase sous forme protéique dans le virion? pourquoi?

A

le rhinovirus puisque son ARN est de sens positif. il est donc reconnu comme un ARNm par la cellule hôte et immédiatement traduit