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Module 3 - Les Acides Aminés Flashcards

1
Q

Les protéines ont une variété de fonctions nomme en 3 et décrit les

A

Catalyse: De nombreuses protéines sont des enzymes. La grande majorité des réactions chimiques du vivant sont catalysées par des enzymes. Il existe des milliers d’enzymes différentes dans la cellule.

  • Transport : Certaines protéines permettent le transport de petites molécules ou d’ions d’un endroit à un autre dans l’organisme (ex. : hémoglobine).
  • Stockage des nutriments : Elles peuvent également servir à la mise en réserve d’un élément ou d’une molécule nécessaire à l’organisme (ex. : ovalbumine et caséine).
  • Structure : Les protéines sont responsables de la forme et de la rigidité des cellules, des tissus et des organes (ex. : kératine et collagène).
  • Mouvement : Des assemblages de protéines confèrent aux cellules la capacité de se mouvoir et aux muscles de se contracter (ex. : myosine).
  • Décodage de l’information génétique : Plusieurs protéines participent aux processus de transcription et de traduction (ex. : ADN polymérase). Elles peuvent également activer ou inhiber l’expression des gènes.
  • Régulation : Certaines protéines servent d’hormones ou de récepteurs hormonaux responsables du contrôle de différentes activités cellulaires.
  • Défense ou agression: Il existe des protéines dont le rôle est de défendre les organismes contre des organismes étrangers et hostiles (ex. : anticorps) ou d’aider à l’attaque d’une proie (ex. : venin).
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Q

Comment nomme-t-on les vingts acides aminés qui constitue les unités de base servant à la construction des protéines

A

Les acides aminés standard

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3
Q

Quel role joue les acides aminés non standard?

A

Neurotransmetteurs, hormones ou des intermédiaires métaboliques important

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4
Q

Tous les acides aminés standards sont des …

A

Acides alpha-aminés

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5
Q

Touts les a.a standards peuvent être décrit par la formule dans laquelle la lettre R désigne la chaîne latérale. Quel est l’exception?

A

La proline, structure circulaire, ne possède pas de groupement amine primaire, mais un groupement amine secondaire

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6
Q

Quel a.a ne possède pas d’activité optique

A

La glycine, n’est pas chirale

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7
Q

Nommez 3 caractéristiques communes aux acides aminés protéogéniques. Identifiez les 2 exceptions

A
  • ils sont tous des acides alpha-aminés
  • ils ont tous une fonction carbonyle et une fonction amine primaire (sauf la proline)
  • ils ont tous une activité optique (sauf la glycine)
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8
Q

Quel sont les deux a.a qui sont des isomères de structure

A

L’isoleucine et la leucine

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9
Q

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité

Alanine

A

A, Ala, non polaire

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10
Q

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité

Arginine

A

R, Arg, polaire, chargé +

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11
Q

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité

Asparagine

A

N, Asn, polaire

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12
Q

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité

Acide aspartique ou aspartate

A

D, Asp, polaire, chargé -

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13
Q

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité

Cystéine

A

C, Cys, polaire

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14
Q

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité

Acide glutamique ou glutamate

A

E, Glu, polaire chargé -

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15
Q

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité

Glutamine

A

Q, Gln, polaire

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16
Q

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité

Glycine

A

G, Gly, non polaire

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17
Q

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité

Histidine

A

H, His, polaire, chargé +

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18
Q

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité

Isoleucine

A

I, Ile, non polaire

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19
Q

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité

Leucine

A

L, Leu, non polaire

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20
Q

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité

Lysine

A

K, Lys, polaire, chargé +

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21
Q

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité

Méthionine

A

M, Met, non polaire

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22
Q

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité

Phénylalanine

A

F, Phe, non polaire

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23
Q

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité

Proline

A

P, Pro, non polaire

24
Q

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité

Sérine

A

S, Ser, polaire

25
Q

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité

Thréonine

A

T, Thr, polaire

26
Q

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité

Tryptophane

A

W, Trp, non polaire

27
Q

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité

Tyrosine

A

Y, Tyr, polaire

28
Q

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité

Valine

A

V, Val, non polaire

29
Q

Les a.a standards sont des acides faibles polyprotique, explique

A

Ils ont tous au moins 2 pKa

30
Q

Une courbe de titration permet de determiner …

A

Les valeurs des pKa d’un a.a ainsi que la valeur de son point isolélectrique

31
Q

Qu’est-ce qu’un zwitterion

A

Molécule possédant à la fois une charge positive et négative, donc une charge nette nulle
Aussi appelé ion hybride ou ion dipolaire

32
Q

Qu’est-ce que le pI

A

Le pH auquel la totalité des molécules de l’a.a est sous forme de zwitterion

33
Q

Le pI depend de quoi?

A

La somme des pKa divisé par 2

34
Q

Quelle est la différence entre un a. Alpha-aminé et un a. Beta-aminé

A

Les acides alpha-aminés portent leur groupement amine sur le carbone alpha, tandis que le groupement amine d’un acide beta-aminés est lié au carbone beta.

35
Q

Quels acides aminés protéogéniques ont la capacité d’absorber les rayons
ultraviolets?

A

Les acides aminés possédant un cycle aromatique: la phénylalanine, la tyrosine e le tryptophane

36
Q

Quels sont les acides aminés contenant un groupement hydroxyle?

A

La sérine, la thréonine et la tyrosine

37
Q

Quels sont les acides aminés beta-hydroxylés?

A

La sérine et la thréonine

38
Q

Quels acides aminés possèdent plus d’un carbone asymétrique?

A

L’isoleucine et la thréonine

39
Q

Quel acide aminé possède un groupement amine secondaire?

A

La proline

40
Q

Quel est l’acide aminé le plus basique?

A

L’arginine, c’est celui dont le second groupement basique ionizable a le plus grand pKa

41
Q

Quel acide aminé contient un groupement thioéther?

A

La méthionine

42
Q

Dans la nature, quelles molécules contiennent des a.a de la série D?

A

Les parois bactériennes e certains antibiotiques

43
Q

Quel est le rôle principal de ces composés

  • GABA
  • Histamine
  • thyroxine
A

GABA: neurotransmetteur
Histamine : neurotransmetteur
Thyroxine : hormone, pro hormone

44
Q

Les 20 a.a standards peuvent être divisés en 7 classe selon la nature de leur chaîne latérale. Nomme les

A 
Chaine latérale aliphatique 
Fonctions apha-iminoacide
Cycle aromatique 
Atome de soufre 
Groupement hydroxyle 
Deuxième groupement basique 
Deuxième groupement amine et leur dérivé amide
45
Q

Quelle est la classification d’a.a la plus utilisée?

A

Selon la polarité

46
Q

Quels sont les 4 groupe de la classification selon la solubilité

A

Non polaire
Polaire non chargé
Polaire chargé, acide
Polaire chargé, basique

47
Q

Quels les deux a.a polaire chargé qui sont acide

A

Aspartate et le glutamate

48
Q

Quels sont les 3 a.a polaire chargé , basique

A

Histidine, lysine et arginine

49
Q

Certains a.a non standard servent de médiateurs chimiques:
Hormones et neurotransmetteur
Définit les

A

Hormones: sécrétés par les glandes, peuvent circuler dans le sang et agir à distance
Neurotransmetteur: sécrétés par des neurones et agissent à courte distance, généralement sur d’autre neurone

50
Q

Qu’est-ce qu’une modification post-traditionnelle, chez qui le retrouve-t-on?

A

Certains a.a non-standards font leur apparition dans la chaîne polypeptidique suite à la modification chimique d’a.a qui sont déjà intégrés à la chaîne
Chez les procaryote et eucaryote

51
Q

Qu’est-ce qu’une molécule amphotère

A

Une molécule qui peut se comporter comme un acide et une base à la fois.
Portent une fonction acide (groupement carboxyle, -COOH) et une fonction basique (groupement amine, -NH2)

52
Q

Défini ce qu’est un pK1 et un pK2

A

PK1: ionisation du groupement alpha carboxyle
PK2: ionisation du groupement alpha amine

53
Q

7 a.a standards possèdent une chaîne latérale R qui peut s’ioniser, ils ont un troisième pKa, comment l’appelle-t-on?

A

PKr, associé au groupement ionisable de la chaine latérale

54
Q

Quel est la charge nette d’un a.a ayant que 2 groupement ionisable qui possède à la fois une charge positive et une négative?

A

Charge nette de 0

55
Q

Quand retrouve-t-on une délocalisation de la charge

A

Fréquemment lors de la présence d’un groupement portant une charge et une double liaison
Observe pour les chaînes latérale de l’histidine, le glutamate et arginine, aspartate

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