Module 3 - Les Acides Aminés Flashcards
Les protéines ont une variété de fonctions nomme en 3 et décrit les
Catalyse: De nombreuses protéines sont des enzymes. La grande majorité des réactions chimiques du vivant sont catalysées par des enzymes. Il existe des milliers d’enzymes différentes dans la cellule.
- Transport : Certaines protéines permettent le transport de petites molécules ou d’ions d’un endroit à un autre dans l’organisme (ex. : hémoglobine).
- Stockage des nutriments : Elles peuvent également servir à la mise en réserve d’un élément ou d’une molécule nécessaire à l’organisme (ex. : ovalbumine et caséine).
- Structure : Les protéines sont responsables de la forme et de la rigidité des cellules, des tissus et des organes (ex. : kératine et collagène).
- Mouvement : Des assemblages de protéines confèrent aux cellules la capacité de se mouvoir et aux muscles de se contracter (ex. : myosine).
- Décodage de l’information génétique : Plusieurs protéines participent aux processus de transcription et de traduction (ex. : ADN polymérase). Elles peuvent également activer ou inhiber l’expression des gènes.
- Régulation : Certaines protéines servent d’hormones ou de récepteurs hormonaux responsables du contrôle de différentes activités cellulaires.
- Défense ou agression: Il existe des protéines dont le rôle est de défendre les organismes contre des organismes étrangers et hostiles (ex. : anticorps) ou d’aider à l’attaque d’une proie (ex. : venin).
Comment nomme-t-on les vingts acides aminés qui constitue les unités de base servant à la construction des protéines
Les acides aminés standard
Quel role joue les acides aminés non standard?
Neurotransmetteurs, hormones ou des intermédiaires métaboliques important
Tous les acides aminés standards sont des …
Acides alpha-aminés
Touts les a.a standards peuvent être décrit par la formule dans laquelle la lettre R désigne la chaîne latérale. Quel est l’exception?
La proline, structure circulaire, ne possède pas de groupement amine primaire, mais un groupement amine secondaire
Quel a.a ne possède pas d’activité optique
La glycine, n’est pas chirale
Nommez 3 caractéristiques communes aux acides aminés protéogéniques. Identifiez les 2 exceptions
- ils sont tous des acides alpha-aminés
- ils ont tous une fonction carbonyle et une fonction amine primaire (sauf la proline)
- ils ont tous une activité optique (sauf la glycine)
Quel sont les deux a.a qui sont des isomères de structure
L’isoleucine et la leucine
Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité
Alanine
A, Ala, non polaire
Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité
Arginine
R, Arg, polaire, chargé +
Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité
Asparagine
N, Asn, polaire
Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité
Acide aspartique ou aspartate
D, Asp, polaire, chargé -
Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité
Cystéine
C, Cys, polaire
Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité
Acide glutamique ou glutamate
E, Glu, polaire chargé -
Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité
Glutamine
Q, Gln, polaire
Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité
Glycine
G, Gly, non polaire
Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité
Histidine
H, His, polaire, chargé +
Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité
Isoleucine
I, Ile, non polaire
Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité
Leucine
L, Leu, non polaire
Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité
Lysine
K, Lys, polaire, chargé +
Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité
Méthionine
M, Met, non polaire
Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité
Phénylalanine
F, Phe, non polaire
Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité
Proline
P, Pro, non polaire
Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité
Sérine
S, Ser, polaire
Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité
Thréonine
T, Thr, polaire
Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité
Tryptophane
W, Trp, non polaire
Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité
Tyrosine
Y, Tyr, polaire
Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité
Valine
V, Val, non polaire
Les a.a standards sont des acides faibles polyprotique, explique
Ils ont tous au moins 2 pKa
Une courbe de titration permet de determiner …
Les valeurs des pKa d’un a.a ainsi que la valeur de son point isolélectrique
Qu’est-ce qu’un zwitterion
Molécule possédant à la fois une charge positive et négative, donc une charge nette nulle
Aussi appelé ion hybride ou ion dipolaire
Qu’est-ce que le pI
Le pH auquel la totalité des molécules de l’a.a est sous forme de zwitterion
Le pI depend de quoi?
La somme des pKa divisé par 2
Quelle est la différence entre un a. Alpha-aminé et un a. Beta-aminé
Les acides alpha-aminés portent leur groupement amine sur le carbone alpha, tandis que le groupement amine d’un acide beta-aminés est lié au carbone beta.
Quels acides aminés protéogéniques ont la capacité d’absorber les rayons
ultraviolets?
Les acides aminés possédant un cycle aromatique: la phénylalanine, la tyrosine e le tryptophane
Quels sont les acides aminés contenant un groupement hydroxyle?
La sérine, la thréonine et la tyrosine
Quels sont les acides aminés beta-hydroxylés?
La sérine et la thréonine
Quels acides aminés possèdent plus d’un carbone asymétrique?
L’isoleucine et la thréonine
Quel acide aminé possède un groupement amine secondaire?
La proline
Quel est l’acide aminé le plus basique?
L’arginine, c’est celui dont le second groupement basique ionizable a le plus grand pKa
Quel acide aminé contient un groupement thioéther?
La méthionine
Dans la nature, quelles molécules contiennent des a.a de la série D?
Les parois bactériennes e certains antibiotiques
Quel est le rôle principal de ces composés
- GABA
- Histamine
- thyroxine
GABA: neurotransmetteur
Histamine : neurotransmetteur
Thyroxine : hormone, pro hormone
Les 20 a.a standards peuvent être divisés en 7 classe selon la nature de leur chaîne latérale. Nomme les
Chaine latérale aliphatique Fonctions apha-iminoacide Cycle aromatique Atome de soufre Groupement hydroxyle Deuxième groupement basique Deuxième groupement amine et leur dérivé amide
Quelle est la classification d’a.a la plus utilisée?
Selon la polarité
Quels sont les 4 groupe de la classification selon la solubilité
Non polaire
Polaire non chargé
Polaire chargé, acide
Polaire chargé, basique
Quels les deux a.a polaire chargé qui sont acide
Aspartate et le glutamate
Quels sont les 3 a.a polaire chargé , basique
Histidine, lysine et arginine
Certains a.a non standard servent de médiateurs chimiques:
Hormones et neurotransmetteur
Définit les
Hormones: sécrétés par les glandes, peuvent circuler dans le sang et agir à distance
Neurotransmetteur: sécrétés par des neurones et agissent à courte distance, généralement sur d’autre neurone
Qu’est-ce qu’une modification post-traditionnelle, chez qui le retrouve-t-on?
Certains a.a non-standards font leur apparition dans la chaîne polypeptidique suite à la modification chimique d’a.a qui sont déjà intégrés à la chaîne
Chez les procaryote et eucaryote
Qu’est-ce qu’une molécule amphotère
Une molécule qui peut se comporter comme un acide et une base à la fois.
Portent une fonction acide (groupement carboxyle, -COOH) et une fonction basique (groupement amine, -NH2)
Défini ce qu’est un pK1 et un pK2
PK1: ionisation du groupement alpha carboxyle
PK2: ionisation du groupement alpha amine
7 a.a standards possèdent une chaîne latérale R qui peut s’ioniser, ils ont un troisième pKa, comment l’appelle-t-on?
PKr, associé au groupement ionisable de la chaine latérale
Quel est la charge nette d’un a.a ayant que 2 groupement ionisable qui possède à la fois une charge positive et une négative?
Charge nette de 0
Quand retrouve-t-on une délocalisation de la charge
Fréquemment lors de la présence d’un groupement portant une charge et une double liaison
Observe pour les chaînes latérale de l’histidine, le glutamate et arginine, aspartate
