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Métabolisme et régulation > Module #2 > Flashcards

Module #2 Flashcards

1
Q

Système ouvert

A

Échange d’énergie de l’énergie et de la matière avec l’environnement

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Q

Système fermé

A

Échange seulement d’énergie avec l’environnement

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Q

Système isolé

A

Aucun échange avec l’environnement

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4
Q

Entropie

A

Degré de désordre ou hasard, degré de dispersion de l’énergie

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5
Q

Cellules: système ouvert ou fermé

A

Ouvert

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6
Q

Bioénergétique

A

Variations d’énergie associée aux réactions biochimiques

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7
Q

Lois de bioénergétique

A

Production de l’énergie à l’intérieur de la cellule, échanges énergétiques avec l’environnement et les réactions chimiques étant impliquées.

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8
Q

Premier principe de la thermodynamique

A

Extraction, transformation, utilisation et échange d’énergie

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9
Q

Échappement des cellules du deuxième principe de la thermodynamique

A

Création de l’ordre de par leur faculté à fabriquer des biomolécules hautement ordonnées et riches en énergie

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10
Q

Définition de l’équilibre d’une cellule

A

État stationnaire dynamique obtenu quand la vitesse d’apparition d’un composé cellulaire est compensée exactement par sa vitesse de dégradation ou d’utilisation

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11
Q

Différences entre la thermodynamique et la bioénergétique

A

La thermodynamique ne se préoccupe pas du temps et de la voie suivie alors que la bioénergétique oui

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12
Q

Enthalpie totale

A

Énergie interne d’un système réactionnel

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13
Q

Énergie libre

A

Partie de l’enthalpie totale susceptible d’être utilisée pour effectuer un travail utile

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14
Q

Énergie entropique

A

Différence entre l’enthalpie totale et l’énergie libre

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15
Q

Produit de la température et de la différence d’entropie

A

Portion de la différence d’enthalpie qui est dissipée sous forme de chaleur

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16
Q

Vrai ou faux: la variation d’énergie libre permet de déterminer la vitesse de la réaction

A

Faux

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17
Q

Représentation de la variation d’enthalpie

A

Le nombre et le type de liaisons chimiques et les interactions non covalentes qui sont brisées et formées au cours de la réaction

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18
Q

Variation de l’énergie de l’énergie libre standard

A

Constante dépendant des propriétés intrinsèques des molécules qui réagissent et spécifique pour chaque réaction

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19
Q

Conditions standards biochimiques de la variation de l’énergie libre standard

A

Concentration de chaque réaction à 1 M, 298 K, concentration d’eau à 55 M et concentration des ions hydrogène ou protons à 10^-7 (pH=7)

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20
Q

Variation de l’énergie libre standard positif pouvant se produire

A

Lorsque des conditions où Q < Keq

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21
Q

Critère pouvant faire changer la spontanéité d’une réaction

A

Concentration des réactifs et des produits

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22
Q

Couplage de deux réactions (défavorable + favorable)

A

Deuxième réaction entraîne la première réaction
Les réactions catalysées par la même enzyme se servent de l’énergie libre de la réaction favorable pour entraîner la réaction défavorable

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23
Q

NAD+/NADH

A

Agent oxydant: NAD+
Agent réducteur: NADH
Nombre d’électrons transférés: 2
Hydrosoluble

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24
Q

NADP+/NADPH

A

Agent oxydant: NADP+
Agent réducteur: NADPH
Nombre d’électrons transférés: 2
Hydrosoluble

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25
Q

FMN/FMNH2

A

Agent oxydant: FMN
Agent réducteur: FMNH2
Nombre d’électrons transférés: 1-2
Groupement prosthétique

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26
Q

FAD/FADH2

A

Agent oxydant: FAD
Agent réducteur: FADH2
Nombre d’électrons transférés: 1-2
Groupement prosthétique

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27
Q

Ubiquinone/QH2

A

Agent oxydant: ubiquinone
Agent réducteur: QH2
Nombre d’électrons transférés: 1-2 (1 à la fois)
Liposoluble

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28
Q

Utilisation de l’ATP

A

Dans les voies anaboliques, contraction musculaire et transport actif primaire

29
Q

Liens phosphates de l’ATP

A

1er: lien phosphoester

2 autres: liens phosphoanhydrides

30
Q

Raisons expliquant que les liens phosphoanhydrides soient exergoniques

A
  • Répulsion électrostatique des groupements pyrophosphates
  • Stabilisation par résonance est moindre de celle de ses produits
  • Effet de solvatation: produits de l’hydrolyse plus stable, car ils sont plus hydratés que l’ATP.
31
Q

Forme prédominante de l’ATP et l’ADP dans des conditions physiologiques

A

Complexe avec le magnésium

32
Q

Avantages du complexe de l’ATP avec le magnésium

A
  • Diminution de la répulsion électrostatique
  • Augmentation de la variation de l’énergie libre standard
  • Interactions permettant le maintien du nucléotide dans une conformation reconnue par l ‘enzyme
  • Augmentation du nombre d’interactions entre le complexe et l’enzyme
  • Neutralisation des charges négatives des groupements phosphoryles
33
Q

Composés énergétiques

A

ATP, composés phosphorylés ou composés contenant des liens thioester

34
Q

Temps pendant lequel la quantité d’ATP intracellulaire répond aux besoins de la celluel

A

1-2 minutes

35
Q

Façons de produire de l’ATP

A

Phosphorylation oxydative, phosphorylation au niveau du substrat et transphosphorylation entre nucléotides

36
Q

Phosphorylation au niveau du substrat

A

Hydrolyse de composés riches en énergie

37
Q

Transphosphorylation entre nucléotides

A

Maintien de la concentration des différentes formes de nucléotides

38
Q

Groupes moléculaires riches en énergie

A

Acyl phosphates, énol phosphates, phoshoguanidines et composés avec un lien thioester

39
Q

Exemple d’acyl phosphate

A

1,3-bisphosphoglycérate

40
Q

Acyl phosphates

A

Hydrolyse favorisée par la compétition entre les différentes formes de résonance et la solvatation

41
Q

Énol phosphates

A

Capacité à transférer son groupement phosphate expliquée par le fait que la forme céto du pyvurate est plus stable que la forme énol

42
Q

Exemple d’énol phosphates

A

Phosphoénolpyruvate

43
Q

Phosphoguanidine

A

Capacité à transférer son groupement phosphate est dû principalement à la forte compétition entre les formes de résonance de groupement guanidine

44
Q

Exemples de phosphoguanidines

A

Vertébrés: phosphocréatine

Invertébrés: phosphoarginine

45
Q

Exemple de composés avec un lien thioester

A

Acétyl-CoA

46
Q

Composés avec un lien thioester

A

Énergie trouvée dans un lien thioester

47
Q

Autre forme pouvant contenir de l’énergie

A

Potentiel réducteur

48
Q

Réaction d’oxydation

A

Réaction provoquant la perte d’un électron (perte d’un H et gain d’un O)

49
Q

Agent oxydant

A

Molécule réduite, accepteur d’électrons

50
Q

Agent réducteur

A

Molécule oxydé, perte d’électrons

51
Q

Exemple de processus d’oxydation

A

Catabolisme

52
Q

Catabolisme

A

Source d’électrons: substrats
Agent oxydant: transfert d’électrons
Production de cofacteurs réduits: source d’électrons pour des réactions anaboliques

53
Q

Réactions d’oxydoréduction des voies métaboliques

A

Rupture d’une liaison C-H avec la perte de deux électrons de liaison par C

54
Q

Cofacteurs pour les déshydrogénases

A

NAD+ et NADP+

55
Q

NADH

A

Transport des électrons jusqu’à la chaîne de transport des électrons afin de produire de l’ATP via phosphorylation oxydative

56
Q

NADPH

A

Principales sources d’énergie libre requise pour la biosynthèse des molécules biologiques

57
Q

Groupements prosthétiques des oxydoréductases

A

FMN et FAD

58
Q

Implication de l’ubiquinone

A

Réactions d’oxydoréduction ayant lieu dans les membranes internes des mitochondries et des chloroplastes ou membranes plasmiques

59
Q

Transporteur liposoluble

A

Ubiquinone

60
Q

Forme radicalaire de l’ubiquinone

A

Semiquinone (oxydation partielle)

61
Q

Oxydant le plus puissant

A

Ubiquinone

62
Q

Potentiel de réduction

A

Mesure de la tendance des espèces chimiques à être réduites ou oxydées, mesure d’affinité pour les électrons

63
Q

E petit

A

Capacité de donner les électrons (bon agent réducteur)

64
Q

E grand

A

Affinité pour les électrons (bon agent oxydant)

65
Q

Détermination des conditions biochimiques standards

A

Demi-réaction de référence: réduction de H+ en H2 gazeux

66
Q

Circulation spontanée des électrons

A

Potentiel de réduction faible vers potentiel de réduction élevé

67
Q

Différence de potentiel de réduction

A

Accepteur (+) - donneur (-)

68
Q

Synonyme de différence de potentiel de réduction

A

Force électromotrice

69
Q

Sens d’une réaction d’oxydation réduction

A

Positif = sens indiqué

Métabolisme et régulation (6 decks)

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