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Métabolisme et régulation > Module #2 > Flashcards

Module #2 Flashcards

1
Q

Système ouvert

A

Échange d’énergie de l’énergie et de la matière avec l’environnement

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Q

Système fermé

A

Échange seulement d’énergie avec l’environnement

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Q

Système isolé

A

Aucun échange avec l’environnement

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4
Q

Entropie

A

Degré de désordre ou hasard, degré de dispersion de l’énergie

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5
Q

Cellules: système ouvert ou fermé

A

Ouvert

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6
Q

Bioénergétique

A

Variations d’énergie associée aux réactions biochimiques

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7
Q

Lois de bioénergétique

A

Production de l’énergie à l’intérieur de la cellule, échanges énergétiques avec l’environnement et les réactions chimiques étant impliquées.

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8
Q

Premier principe de la thermodynamique

A

Extraction, transformation, utilisation et échange d’énergie

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9
Q

Échappement des cellules du deuxième principe de la thermodynamique

A

Création de l’ordre de par leur faculté à fabriquer des biomolécules hautement ordonnées et riches en énergie

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10
Q

Définition de l’équilibre d’une cellule

A

État stationnaire dynamique obtenu quand la vitesse d’apparition d’un composé cellulaire est compensée exactement par sa vitesse de dégradation ou d’utilisation

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11
Q

Différences entre la thermodynamique et la bioénergétique

A

La thermodynamique ne se préoccupe pas du temps et de la voie suivie alors que la bioénergétique oui

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12
Q

Enthalpie totale

A

Énergie interne d’un système réactionnel

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13
Q

Énergie libre

A

Partie de l’enthalpie totale susceptible d’être utilisée pour effectuer un travail utile

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14
Q

Énergie entropique

A

Différence entre l’enthalpie totale et l’énergie libre

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15
Q

Produit de la température et de la différence d’entropie

A

Portion de la différence d’enthalpie qui est dissipée sous forme de chaleur

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16
Q

Vrai ou faux: la variation d’énergie libre permet de déterminer la vitesse de la réaction

A

Faux

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17
Q

Représentation de la variation d’enthalpie

A

Le nombre et le type de liaisons chimiques et les interactions non covalentes qui sont brisées et formées au cours de la réaction

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18
Q

Variation de l’énergie de l’énergie libre standard

A

Constante dépendant des propriétés intrinsèques des molécules qui réagissent et spécifique pour chaque réaction

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19
Q

Conditions standards biochimiques de la variation de l’énergie libre standard

A

Concentration de chaque réaction à 1 M, 298 K, concentration d’eau à 55 M et concentration des ions hydrogène ou protons à 10^-7 (pH=7)

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20
Q

Variation de l’énergie libre standard positif pouvant se produire

A

Lorsque des conditions où Q < Keq

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21
Q

Critère pouvant faire changer la spontanéité d’une réaction

A

Concentration des réactifs et des produits

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22
Q

Couplage de deux réactions (défavorable + favorable)

A

Deuxième réaction entraîne la première réaction
Les réactions catalysées par la même enzyme se servent de l’énergie libre de la réaction favorable pour entraîner la réaction défavorable

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23
Q

NAD+/NADH

A

Agent oxydant: NAD+
Agent réducteur: NADH
Nombre d’électrons transférés: 2
Hydrosoluble

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24
Q

NADP+/NADPH

A

Agent oxydant: NADP+
Agent réducteur: NADPH
Nombre d’électrons transférés: 2
Hydrosoluble

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25
FMN/FMNH2
Agent oxydant: FMN Agent réducteur: FMNH2 Nombre d'électrons transférés: 1-2 Groupement prosthétique
26
FAD/FADH2
Agent oxydant: FAD Agent réducteur: FADH2 Nombre d'électrons transférés: 1-2 Groupement prosthétique
27
Ubiquinone/QH2
Agent oxydant: ubiquinone Agent réducteur: QH2 Nombre d'électrons transférés: 1-2 (1 à la fois) Liposoluble
28
Utilisation de l'ATP
Dans les voies anaboliques, contraction musculaire et transport actif primaire
29
Liens phosphates de l'ATP
1er: lien phosphoester | 2 autres: liens phosphoanhydrides
30
Raisons expliquant que les liens phosphoanhydrides soient exergoniques
- Répulsion électrostatique des groupements pyrophosphates - Stabilisation par résonance est moindre de celle de ses produits - Effet de solvatation: produits de l'hydrolyse plus stable, car ils sont plus hydratés que l'ATP.
31
Forme prédominante de l'ATP et l'ADP dans des conditions physiologiques
Complexe avec le magnésium
32
Avantages du complexe de l'ATP avec le magnésium
- Diminution de la répulsion électrostatique - Augmentation de la variation de l'énergie libre standard - Interactions permettant le maintien du nucléotide dans une conformation reconnue par l 'enzyme - Augmentation du nombre d'interactions entre le complexe et l'enzyme - Neutralisation des charges négatives des groupements phosphoryles
33
Composés énergétiques
ATP, composés phosphorylés ou composés contenant des liens thioester
34
Temps pendant lequel la quantité d'ATP intracellulaire répond aux besoins de la celluel
1-2 minutes
35
Façons de produire de l'ATP
Phosphorylation oxydative, phosphorylation au niveau du substrat et transphosphorylation entre nucléotides
36
Phosphorylation au niveau du substrat
Hydrolyse de composés riches en énergie
37
Transphosphorylation entre nucléotides
Maintien de la concentration des différentes formes de nucléotides
38
Groupes moléculaires riches en énergie
Acyl phosphates, énol phosphates, phoshoguanidines et composés avec un lien thioester
39
Exemple d'acyl phosphate
1,3-bisphosphoglycérate
40
Acyl phosphates
Hydrolyse favorisée par la compétition entre les différentes formes de résonance et la solvatation
41
Énol phosphates
Capacité à transférer son groupement phosphate expliquée par le fait que la forme céto du pyvurate est plus stable que la forme énol
42
Exemple d'énol phosphates
Phosphoénolpyruvate
43
Phosphoguanidine
Capacité à transférer son groupement phosphate est dû principalement à la forte compétition entre les formes de résonance de groupement guanidine
44
Exemples de phosphoguanidines
Vertébrés: phosphocréatine | Invertébrés: phosphoarginine
45
Exemple de composés avec un lien thioester
Acétyl-CoA
46
Composés avec un lien thioester
Énergie trouvée dans un lien thioester
47
Autre forme pouvant contenir de l'énergie
Potentiel réducteur
48
Réaction d'oxydation
Réaction provoquant la perte d'un électron (perte d'un H et gain d'un O)
49
Agent oxydant
Molécule réduite, accepteur d'électrons
50
Agent réducteur
Molécule oxydé, perte d'électrons
51
Exemple de processus d'oxydation
Catabolisme
52
Catabolisme
Source d'électrons: substrats Agent oxydant: transfert d'électrons Production de cofacteurs réduits: source d'électrons pour des réactions anaboliques
53
Réactions d'oxydoréduction des voies métaboliques
Rupture d'une liaison C-H avec la perte de deux électrons de liaison par C
54
Cofacteurs pour les déshydrogénases
NAD+ et NADP+
55
NADH
Transport des électrons jusqu'à la chaîne de transport des électrons afin de produire de l'ATP via phosphorylation oxydative
56
NADPH
Principales sources d'énergie libre requise pour la biosynthèse des molécules biologiques
57
Groupements prosthétiques des oxydoréductases
FMN et FAD
58
Implication de l'ubiquinone
Réactions d'oxydoréduction ayant lieu dans les membranes internes des mitochondries et des chloroplastes ou membranes plasmiques
59
Transporteur liposoluble
Ubiquinone
60
Forme radicalaire de l'ubiquinone
Semiquinone (oxydation partielle)
61
Oxydant le plus puissant
Ubiquinone
62
Potentiel de réduction
Mesure de la tendance des espèces chimiques à être réduites ou oxydées, mesure d'affinité pour les électrons
63
E petit
Capacité de donner les électrons (bon agent réducteur)
64
E grand
Affinité pour les électrons (bon agent oxydant)
65
Détermination des conditions biochimiques standards
Demi-réaction de référence: réduction de H+ en H2 gazeux
66
Circulation spontanée des électrons
Potentiel de réduction faible vers potentiel de réduction élevé
67
Différence de potentiel de réduction
Accepteur (+) - donneur (-)
68
Synonyme de différence de potentiel de réduction
Force électromotrice
69
Sens d'une réaction d'oxydation réduction
Positif = sens indiqué

Métabolisme et régulation (6 decks)

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