Module 1 Flashcards
Qu’est ce que le métabolisme?
C’est une activité cellulaire hautement coordonnée par laquelle plusieurs systèmes multienzymatiques coopère pour les 4 fonctions du métabolisme.
Quelles sont les fonctions du métabolisme?
- Obtenir de l’énergie chimique en captant l’énergie solaire ou en dégradant les nutriments riches en énergie.
- Convertir les nutriments en différents précurseurs.
- Polymériser les précurseurs monomériques en macromolécules.
- Synthétiser et dégrader les biomolécules.
Qu’est ce que le métabolisme intermédiaire?
C’est l’ensemble des sentiers métaboliques qui implique des molécules de faible poid moléculaire.
Qu’est ce de le métabolisme énergétique?
C’est la branche du métabolisme intermédiaire qui se consacre à l’étude des réactions produisant de l’énergie.
Quel type d’organismes utilise :
Source d’énergie : Lumière
Source de C: CO2
Photoautotrophe
Quel type d’organismes utilise :
Source d’énergie : Molécules organiques
Source de C: CO2
Chimioautotrophe
Quel type d’organismes utilise :
Source d’énergie : Lumière
Source de C: molécules organiques
Photohétérotrophe
Quel type d’organismes utilise :
Source d’énergie : Molécules organiques
Source de C: Molécules organiques
Chimiohétérotrophe
Quel type de sentier métaboliques (anabolique ou catabolique) utilise de l’énergie pour formé des molécules complexes à partir de précurseurs simple et qui est divergent?
Anabolique
Quels sont les caratéristiques d’un sentier catabolique?
Il dégrade des molécules complexes en précurseurs simple tout en libérant de l’énergie et qui est donc convergent.
Les réactions cataboliques libères de l’énergie sous quelle forme?
- ATP
- NADPH
- NADP
- Chaleur
Quels sont les particularités d’un sentier métabolique linéaire?
- Série de réactions indépendantes
- Chaque produit de la réaction précédente est le substrat de celle qui suit.
Qu’arrive t’il aux intermédiaires des réactions dans un sentiers circulaire?
Les intermédiaires sont régénérés à chaque fois que le cycle est complété.
Quel type de sentier permet d’allonger ou de rapetisser une molécule?
Sentier en spirale
Quel type de réaction est convergente?
Catabolique
Quel type de réaction est divergente?
Anabolique
Qu’est-ce qui caractérise une réaction convergente?
Utilise plusieurs substrat pour former un nombre de produit réduit.
Vrai ou faux
Les sentiers peuvent partager des intermédiaires et utiliser les même précurseurs.
Vrai.
Quel caractéristiques des eucaryotes permet de réguler les sentiers?
La compartimentation cellulaire
Dans quel intervalle de temps peux agir un régulateur de sentier?
Milliseconde à heure
Quels sont les types d’évolutions des sentiers?
- Forward Evolution
- Backward Évolution
- Evolution by gene duplication
- Duplication and divergence…
- Évolution by pathway reversal
- Patchwork modèle
Qu’est ce que le modèle Forward Évolution?
Lorsque substrat est produit en trop grande quantité, l’apparition d’une nouvelle enzyme est favorisé.
Qu’est-ce que le modèle Backward Evolution?
C’est lorsque d’un substrat (x) vient à manquer, une nouvelle enzyme est créer pour transformer un autre produit(Y) en substrat manquant (X)
Qu’est ce le modèle Evolution by gene duplication….
C’est le modèle ou un nouveau sentier est créer suite à l’embranchement à un sentier déjà existant.
Qu’est-ce que le modèle Duplication and divergence…
C’est le modèle qui a été utilisé pour la synthèse du tryptophane et de l’histidine
Qu’est-ce que le modèle Evolution by pathway reversal?
C’est la création d’une enzyme capable de catalyse la réaction inverse à un réaction irréversible, elle permet souvent de généré un tout nouveau sentier. Glycolyse à partir de gluconéogenèse.
Qu’est ce que le modèle Patchwork model?
C’est l’assemblage de plusieurs enzymes présentes dans d’autres sentier afin d’en créer un nouveau.
Quel est le rôle des enzymes dans le métabolisme?
Elles servent de catalyseurs aux réactions.
Quels sont les deux avantages majeurs des enzymes pour le métabolisme?
Les enzymes peuvent être régulé et elle sont très spécifique.
La spécificité des enzymes permet deux choses, lequels?
- Éviter de produire des produit toxique pour la cellule
- Produire les produits en quantité nécessaire sans en gaspiller.
Le couplage des réaction endergonique et exergonique est essentiel dans les sentiers métaboliques et est possible grâce aux enzymes. Pourquoi cela est-il essentiel?
Car plusieurs réactions très importante sont endergoniques et donc ne pourraient se produire spontanément. Par contre, elle sont possible lorsqu’elle sont couplées à des réactions exergoniques
Les sentiers métaboliques fondamentaux sont-ils ubiquitaires?
Oui, car il ont lieux simultanément.
Quels sont les 5 types de réactions chimiques dans les sentiers métaboliques?
- Réaction de formation et de bris de liens C-C
- Réaction qui entraîne des éliminations, des isomérisations et des réarrangements
- Réactions formant des radicaux libres
- Réactions de transfert de groupes
- Réaction d’oxydoréduction
Qu’est-ce qu’une rupture homolytique?
Lorsqu’une liaison est brisée, les deux électrons sont partagés entre les molécules. Un électron sur chaque atome.
Qu’est ce qu’une rupture hétérolytique?
Lorsqu’il y a bris d’un liaison, les électrons sont répartie de façon inégale, 2 électrons sur le même atome.
Un atome de carbone est-il électrophile ou nucléophile?
Les deux selon la situations son affinité pour les électrons change.
Quels sont les deux réactions qui constituent la base du métabolise de dégradation et de biosynthèse?
- Le clivage hétérolytique qui permet la formation de carbanion et d’un carbonations.
- La formation d’un lien C-C qui implique la liaison d’un carbanion nucléophile et un cabocation électrophile.
Quel groupement est souvent présent dans les molécules biologiques et important pour les réactions chimiques dans les sentiers métabolique?
Carbonyle qui a une charge partielle positive due à l’électronégativité du O, rendant le C électrophile.
3 réactions majeurs implique des réactions avec C-C. Lesquelles?
- Condensation aldolique
- Condensation d’Esther de Claisen
- Décarboxylation de l’acide-B-cétonique
Un autre groupement peut jouer le même rôle que le carbonyle, lequel?
Groupement imite.
Qu’est qu’une réactions d’élimination?
C’est une réaction qui permet la formation d’un double lien C-C.
Quels substances peuvent être éliminée par ce mécanisme?
- H2O
- NH3
- R-OH
- R-NH2
Qu’est-ce qu’une réaction d’isomérisation?
C’est une réaction qui permet de déplacer un H pour déplacer une double liaison.
Qu’est-ce qu’une réaction de réarrangement?
C’est une réaction qui permet de rompre et de reformer des lien C-C pour réarrange le squelette de C.
Comment sont formé les radicaux libres?
Rupture homolytique de liens covalences
Quelle réaction nécessite des radicaux libres?
Réarrangement
Réduction
Décarboxylation
Qu’est-ce qu’un transfert de groupe/ réaction de susbstitution nucléophile dans les systèmes biologiques?
C’est le transfert d’un groupe électrophile d’un nucléophile à un autre nucléophile.
Quels sont les électrophiles les plus souvent transférés?
- Acyle
- Phophoryle
- Glycosyle
Comment est effectué un transfert d’acyle?
Addition d’un nucléophile au carbone électrophile d’un composé acyle pour donner un intermédiaire tétraédrique. Le groupement qui portait initialement le groupement acyle est alors éliminé.
Comment ce fait le transfert d’un groupement phosphoryle?
Addition d’un nucléophile à l’atome de P du groupement pour donner un intermédiaire bipyramidale trigonelle instable lié aux 2 nucléophile. Finalement 1 des nucléophiles est éliminé pour former le produit final de la réaction.
Quels enzymes catalysent les réactions de transfert de groupement phosphoryle?
Les kinases
Quels sont les deux meilleure gourpements pour le transfert de groupement phosphate?
Phosphate inorganique(Pi) et pyrophosphorique inorganique (PPi)
Comment se fait le transfert d’un groupement glycosyle?
Substitution d’un groupement nucléophile pas un autre au C1 d’un ose cyclique. Il peut y avoi formation d’un carbanion qui est stabilisé grâce à la formation d’un ions oxonium.
Quels enzymes catalysent les transfert de groupement glycosyle?
Glycosyltransférases
Quelle enzyme catalyse le transfert d’un groupement acyle?
La cartonniez acyltransférase.
Qu’est ce qu’une réaction de déshydrogénation et quelle enzyme la catalyse?
Une réaction d’oxydation qui se traduit par la perte de 2 électrons et de 2 ions H. Déhydrogénases
Quelles réaction d’oxydation utilisent les enzymes oxydase/oxygénase pour être catalysées?
Réaction où l’atome C forme un lien avec O.
Les sentiers cataboliques sont constitués d’une suite de quelle sorte de réaction?
Réaction d’oxydation qui résulte dans le transfert d’électrons des carburants métabolique à l’oxygène.
Quel est le rôle de l’oxygène dans les sentiers cataboliques?
Son affinité pour les électrons rend le processus de transferts d’électron très exergonique, fournissant ainsi l’énergie nécessaire à la synthèse d’ATP.
Rappel ** Catabolisme libère de l’énergie
A quoi servent les équation biochimiques standards?
Indiquer la direction d’une réaction dans des conditions spécifiques ou pour calculer la constante d’équilibre de la réaction.
