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BCM-1003 - Métabolisme et reg > Module 1 > Flashcards

Module 1 Flashcards

1
Q

Qu’est-ce qu’un metabolisme ?

A

C’est un processus dynamique et régulé qui ajuste son activité à l’environnement de la cellule afin d’assurer l’homéostasie. Somme des transformations chimiques qui ont lieu dans une cellule ou un organisme.

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Q

Qu’est-ce que la metabolomique ?

A

C’est la science qui vise à identifier, quantifier et cataloguer la totalité des métabolismes présents dans une cellule ou un organe. (le metabolome)

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3
Q

Qu’est-ce qu’un sentier métabolique ?

A

Série de réaction enzymatique qui forme le métabolisme

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4
Q

Qu’est-ce qu’un metabolites ?

A

Série d’intermédiaire métabolique qui converti les précurseurs en produits

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5
Q

Qu’est-ce que le metabolisme énergétique ?

A

C,est une branche du métabaolisme intermédiaire qui se consacre à l’étude des réactions produisant de l’énergie

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6
Q

Qu’est-ce que le catabolisme ?

A

Phase du métabolisme où les nutriments (glucides, lipides, protéines) sont convertis en produit simples (Eau, CO2, NH3).

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7
Q

Que veut dire exergoniques et à quelle sentier appartient-il ?

A

Sentier qui libère de l’énergie et c’est le sentier cataboliques

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8
Q

Qu’est-ce que le anabolisme ?

A

Réaction de synthèse de biomolécules

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9
Q

Que veut dire endergoniques et à quelle sentier appartient-il ?

A

Sentier qui requiert de l’énergie et c’est le sentier anaboliques

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10
Q

Quelles sont les fonction primaires du métabolisme ?

A
  1. Acquisition et utilisation de l’énergie
  2. synthèse des biomolécules
  3. expulsion des déchets
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11
Q

Qu’elles sont les 3 organisations de sentier métaboliques ?

A
  1. Linéaire : Suite de réaction enzymatique indépendante où le produit de l’un est le substrat de l’autre
  2. Circulaire : Produit initiale est regénéré suite a une série de réactions où le produit de l’un est le substrat de l’autre
  3. Spiralé : Même suite de réaction sont répété pour allonger ou raccourcir une moléculle donnée
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12
Q

Qu’est-ce qu’un sentier convergeant et qu’elle sentier en fait partie ?

A

C’est qu’il transforme une grande variété de substrat (protéine, sucres, lipides) en un nombre limité de produit facilement sécrété (eau, ammonium, CO2) et c’est donc les sentier cataboliques

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13
Q

Qu’est-ce qu’un sentier divergeant et qu’elle sentier en fait partie ?

A

Ils synthétidesent une grande varété de produits (protéines, lipides, sucres) en nombre restreint de subtrat précurseur et c’est donc les sentiers anaboliques

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14
Q

Pourquoi les voie métaboliques sont interdépendante ?

A

car les voie anabolique sont couplé avec les voies cataboliques puisque les voies anaboliques ont besoin d’énergie synthétise par les voies cataboliques (ATP ou NADPH)

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15
Q

Pourquoi ont dit que les sentier métabolique sont branché et interconnecté ?

A

Car il partage certain métabolite et peuvent utiliser les même précurseurs. Aussi certain intermédiaire peuvent servir de précurseur pour d’autre.

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16
Q

Comment peut-on délimiter le début et la fin d’un sentier ?

A

ils sont choisi de facon arbitraire, selon la tradition ou selon ce qui fcailiste la comprehension

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17
Q

Est-ce que les sentier sont irreversibles et regule ? et pourquoi ?

A

Oui,
ils sont regule : ils réagisse au fluctuation de l’environnement, il repond aussi a des instructions génétiquement programmé.

ils sont irréversibles : car il y a toujours au moins une réaction irreversible dans la voie (barrage)

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18
Q

Pourquoi la cellule doit controller chacune des voies métabolique ?

A

-cellule doit aiguiller les molécules dans la voie qui a ce qu’elle a besoin
-Pour eviter du gaspillage, les voie de synthèse et de dégradation d’un même produit ne peuvent fonctionner en même temps (sentier antagoniste) et doivent etre régulé réciproquement

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19
Q

Comment une régulation réciproque peut-elle etre possible ?

A

puisque des sentier antagonistes peuvent partager des enzymens, au moins une étape est catalysé par des enzymes différentes et ces enzymes sont donc régulé de manière différente

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20
Q

Pourquoi la compartimentation cellulaire est important ?

A

Car cela permet d’avoir un niveau additionnel de controle des sentier antagonist. elle permet aussi de maintenir la concentration des intermédiairees, des enzymes et des régulateurs à des niveaux différents

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21
Q

Est-ce que les cellules d’un tissu ont des sentiers metabolique pouvant repondre au besoin du corps entier ?

A

NON, ils repondent spécifiquement au besoin du tissu et lui permettre d’accomplir sa fonction

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22
Q

Les réactions métaboliques sont-il toujours catalysé par des enzymes ?

A

Pas toujours, il existe quelque exeptions

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23
Q

Pourquoi les enzymes sont importante dans les réactions métaboliques ?

A

Elle sont importante car :
-sans elle, les réaction serai trop lente pour supporter la vie.
- la spécificité des enzymes garantit des réaction efficaces et minimise la formation de produit inutile ou toxique
-Permettent de coupler une réaction endergonique et une réaction exergonique et ainsi rendre la première possible
-Peuvent etre régulé ce qui permet de controler la vitesse des sentiers

24
Q

Est-ce que les sentier métabolique reste les mêmes? Et pourquoi ?

A

Non, ils évoluent. Ca peut etre a cause l’`épuisemenjt d’un substrat, l’utilisation de nouveaux nutriments ou pour protéger contre des produits toxiques

25
Q

Qu’est-ce que les séquencage de centaine de génome eucaryotes et procaryote on permis de réacliser ?

A

Cela a permis de trouver de l’information sur l’organisation et la strcuture des sentiers primitifs ainsi que donner une vue d’emnsemble du réseau métabolique entier de ces espèces.

26
Q

Quelles sont les généralité qu’on a pu découvrir avec la comparaison des sentier métabolique ?

A
  • 10 à 30% d’un génome est dédier a des fonction métabolique
  • principes gouvernant seniter sont même pour eucaryotes et procaryotes
    -Sentier métabolique sont ubiquitaires (présent et actif dans toute cellule et etre vivant)
    -procaryotes on + grande diversité
27
Q

Quelles sont les stratégie pour créer de nouveaux sentier ? (6)

A

-Forward Evolution : grande qt de E donc favorise création de l’enzyme E5 pour rajouter E–E5–>P
-Backward Evolution (retroevolution) : E viens a manquer pour créer P donc on rajout D avant ( D–E4–>E–E5–>P)
-Evolution by gene duplication and divergence: création d’un embranchementsur sentier existant ( C—->D
|—->X
-Duplication et divergeance d’un seniter métabolique complet: duplication d’un sentier complet puis un ou plusieur gene divergent
-Evolution by pathway reversal : inversion de l’étape du sentier qui est irréversible.
-Patchwork model : recrutant et combianant des enzymes provenant de plusieur seniers différents

28
Q

Quelles sont les 2 facteurs qui détermine quelle réactions aura lieu ?

A
  1. La pertinance de la réaction
  2. La vitesse
29
Q

Quelles sont les 5 types de transformation chimiques utilisé par la cellule ?

A
  1. La formation ou le bris de liens C-C
  2. Les transferts de groupements
  3. Les transferts d’électrons (oxydoréduction)
  4. Les réarrangements, les isomérisations et les élminations
  5. Les réactions impliquants des radicaux libres
30
Q

Qu’est-ce qu’un lien covalent ? et que ce passe-t-il quand on les brise ?

A

Partage d’une paire d,électron entre deux atomes. Si cette liaison est rompe les deux électrons peuvent etre conservé par l’un des deux atomes (rupture hétérolytique) ou + fréquent, etre partagé entre les deux électrons (rupture homolytique )

31
Q

Qu’est-ce qu’un carbanions et un carbocation ?

A

Carbanion : C avec un e de plus donc C-
Carbocation : C avec un e de moins donc C+

32
Q

Qu’est-ce qu’un nucléophile et un électrophile ?

A

Nucléophile : groupement focntionnels riche en électrons et capable de donner des électrons
Électrophile : groupment focntionnels pauvre en électrons et qui cherche électrons

33
Q

Un carbone est-il un électrophile ou un nucléophile ?

A

Dépendant sont environnement, il peut etre soit l’un soit l’autre

34
Q

Quelles sont les deux réactions qui font la base du métabolisme de dégradation et de biosynthèse ?

A
  1. clivage hétérolitique de C-C (un carbanion et un carbocation)
  2. Formation lien C-C avec un carbanion nucléophile et un carbocation électrophile
35
Q

Pourquoi les groupements carbonyle sont important ?

A

CAr sont carbone a une charge partielle positive a l’électronégativité de O donc le C est électrophile.
Il peut facilité la formation d’un carbanion sur un carbone adjacent.
Des seniter entiers sont organisés autour de l’introduction d’un groupement carbonyle à une position permettant la rupture ou la formation d’un lien C-C

36
Q

Qui peut jouer le même role que le groupement carbonyle ?

A

Le groupement imine

37
Q

Qu’elle sont les 3 classes majeures de réaction ou le groupement carbonyle est important ?

A

-La condensation aldoliques
-Les condensation d’ester de Claisen
-décarboxylation des acides B-cétoniques

38
Q

Qu’est ce que la condensation aldolique ?

A

-Sert a la formation de lien C-C.
-Repose sur le fait que le carbone A adjacent à un groupement carbonyle pers facilement un proton ce quii génère carbanion (nucléophile).
-La présence d’un groupement carbonyle permet de stabiliser par resonnance entre carbanion. Formation de lien entre le C carbanion et le carbolnyle d’une autre molécule.

39
Q

Qu’est-ce que la condensation d’ester de claisen ?

A

-Sert a la formation de lien C-C.
-Repose sur le fait que le carbone A adjacent à un groupement carbonyle pers facilement un proton ce quii génère carbanion (nucléophile).
-le groupement carbonyle est sur un groupement thioester (**S)
-La présence d’un groupement carbonyle permet de stabiliser par resonnance entre carbanion. Formation de lien entre le C carbanion et le carbolnyle d’une autre molécule.

40
Q

Qu’est-ce que la décarboxylation des acides B-cétonique ?

A

-Formation d’un carbanion en perdant un molécule de CO2
- Carbanion réagis avec électrophile

41
Q

Quelles sont les 3 groupes qu’il est fréquent de transférer dans les systèmes ? Et entre quoi se font ces transferts ?

A

Goupement Acyle, phosphoryle et glycosyle
Entre deux nucléophiles (réacions de substitution nucléophile)

42
Q

Comment ce passe un transfert du groupement acyle (R-CO-)

A

Addition d’un nucléophile au C d’un carbonyle du groupement acyle. sont porteur initiale est alors éliminé
La carnitine acyltransférase catalyse ce type de transfert

43
Q

Comment ce passe un transfert du groupement phosphoryle ?

A

Addition d’un nucléophile a P d’un groupement phosphoryle
Donne un intermédiaire instable lié à 2 nucléophile
L’un des nucléophile est donc rejeté pour donner produit finale
(kinase catalysent le transfert d’un groupement phsphoryle en utilisant ATP comme donneur)

44
Q

Meilleur groupement labile pour substitution ?

A

Orthophosphate inorganique et pyrophosphate inorganique

45
Q

Comment ce passe un transfert du groupement glycosyle ?

A

Il se fait par substitution d’un groupement nucléophile par un autre sur le carbone anomérique d’un ose cyclique.
Glycosyltransférases sont la famille d’enzyme catalysant cette réactions

46
Q

Qu’est-ce qu’une réaction de déshydrogénation ?

A

réaction d’oxydation ou perte de deux électrons et de deux ions H
et les enzyme qui catalysent sont les déshydrogénase

47
Q

Expliquer une autre réactions d’oxydation autre que le déshydrogénation ?

A

réaction ou atome C forme un lien avec atome O.
Enzyme oxydase ou oxygénases si O viens de O2

48
Q

Que suit un réaction d’oxydation ?

A

Obligatoirement accompagné par une réaction de réduction (les électron arraché par oxydation sont transférés à un accepteur)

49
Q

Comment la majorité des organisme vivant obtiennent l,énergie requise ?

A

Grace a l’oxydation des carburants métabolique (ex : sucre, acide gras) qui libèrent de l’énergie. (formation de sentier catabolique avec suite de réaction d’oxydation)

50
Q

Qu’est-ce qu’une réaction d’élimination ?

A

Formation d’une double liaison a partir d’une simple liaison en éliminant ex : H2O, NH3, alcool(ROH), amine primaire (RNH2)

51
Q

Qu’estce qu’une réaction d’isomérisation ?

A

C’est le déplacement d’un double liaison a cause d’un déplacement de H

52
Q

Qu’est-ce qu’une réaction de réarangement ?

A

Rompent et reforment liaison entrainant un réarangement du squellette de la molécule

53
Q

Qu’est-ce qu’une réaction impliquant des radicaux libres ?

A

c’est une réactions d’une rupture homolytique qui forme des radicaux libres et qui sert d’étape préliminairea d’autre réactions

54
Q

Pourquoi l’ATP existe sous diverse forme ? et quelle sont elle ?

A

CAr les biochimiste utilise des réaction simplifié pour décrire les réactions. Par exmple l’ATP est une molécule chargé ATP4- et on peut la représenté sous plusieurs forme : ATP4-, HATP3-, H2ATP2-, MgHATP-, Mg2HATP
(les équation biochimique émettent les ions H+ et Mg+ pour simplifier equation)

55
Q

Quelles sont les différente fonction des équation chimique vs équation biochimique ?

A

Équation chimique : utile pour comprendre le mécanisme chimique de réaction
Équation biochimique : indique la direction de la réaction a cond spécifique et sert a calculer la constante d’équilibre de la réaction

BCM-1003 - Métabolisme et reg (2 decks)

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