mini test 3

Question 1

Classes d’acides aminés selon leur chaîne latérale R

Answer 1

1) non polaires (hydrophobes)
2) neutres (charge nette nulle) mais polaires
(hydrophiles)
3a) charge nette négative à pH 7, et
3b) charge nette positive à pH 7.

Question 1

La structure du Carbone a (Ca
)

Answer 1

un groupe aminé et à
- un groupe carboxyle (acide –COOH)
- un atome d’hydrogène et
- une chaine latérale variable ‘R

Question 2

Les acides aminés non polaires sont composé que de … et …

Answer 2

hydrophobe
composée que d’atomes de C et H
méthionine qui contient un atome de -S-

Question 3

Acides aminés polaires non-chargés sont composé que de … et …

Answer 3

hypophylle
composé que d’atome de OH, =O, -SH, ou –NH2

Question 4

Acides aminés polaires chargés sont composé de

Answer 4

+NH2 +NH3

Question 5

Qu’est- ce qu’un protéine ?

Answer 5

polymères linéaires d’acides aminés liés par des
liens peptidiques, i.e. une union du groupe a-carboxyle
d’un acide aminé à un groupe a-amine d’un autre acide
aminé.

Question 6

Caractéristique de liens peptidiques

Answer 6

Formation d’un dipeptide perte d’une molécule d’eau.
* Les acides aminés liés se nomment résidus
(car il y a une molécule d’eau en moins).
* Réaction dans des ribosomes (traduction de l’ARNm),
nécessite un apport d’énergie (GTP).
* Liaison relativement stable.

Question 7

Qu’est-ce qui explique l’atteinte d’une vitesse de réaction maximale, même si la concentration du substrat augmente?

Answer 7

Ce maximum indique la saturation des liaisons disponibles qui sont tous occupé par le substrat.

Question 8

Km : Signification

Answer 8

KM estime l’affinité d’un enzyme pour un substrat

Question 9

kcat : Signification

Answer 9

kcat représente la vitesse de transformation de ES → E+P par seconde (s-1)

Question 10

Quel est l’intérêt et la limitation du Kcat?

Answer 10

Kcat est la constante de vitesse d’une réaction lorsqu’un enzyme est saturé par son substrat. La limitation serait que les enzymes sont rarement saturés par leur substrat donc de ce fait la vitesse enzymatique est bien inférieur su Kcat ce qui limite l’intérêt physiologique de ce paramètre.

Question 11

kcat/Km : Signification ?

Answer 11

Représente la capacité globale de l’enzyme (efficacité catalytique) à convertir le substrat en produit.

Question 12

Inhibition compétitive ou non-compétitive

Answer 12

Dans une inhibition compétitive, l’inhibiteur se lie de façon réversible au même site que le substrat. Dans une inhibition non-compétitive, le substrat et l’inhibiteur se fixent à des sites différents.

Question 13

Comment agit un cofacteur allostérique?

Answer 13

Molécule capable de se fixer sur le site de régulation d’une enzyme allostérique et provoque une modification réversible de la configuration de celle-ci, entraîne son inhibition ou son activation.

Question 14

Différence effecteurs homotropique et hétérotropique?

Answer 14

Lorsque le substrat agit comme son propre effecteur, il s’agit d’un effecteur homotropique quant aux effecteurs hétérotropique, ils diffèrent chimiquement du substrat dont ils influencent la transformation enzymatique.

Question 15

Donnez un exemple d’une modification covalente des enzymes servant à leur régulation

Answer 15

La réaction de phosphorylation est catalysée par une famille d’enzymes appelées kinases.

Question 16

Temps de réponse des différents mécanismes de régulation de l’activité des enzymes.

Answer 16

La régulation de l’activité enzymatique par les effecteurs ou la phosphorylation agit = secondes et minutes. Les cellules peuvent réguler en quelques heures à quelques jours la concentration de leurs enzymes.

Question 17

Trois grands objectifs (ou utilisation) de l’énergie libérée par le catabolisme dans la cellule

Answer 17

1) un travail mécanique
2) le transport actif transmembranaire
3) la biosynthèse de diverses biomolécules

Question 18

Distinction des (photo/chimio) – (auto/hétéro)–trophes en termes de source d’énergie Et de source de C

Answer 18

Les autotrophes peuvent utiliser le CO2 (carbone oxydé) comme source de carbone et les hétérotrophes doivent utiliser du carbone organique tel que le glucose. Les phototrophes : organismes photosynthétiques utilisant l’énergie lumineuse pour réduire le CO2 en glucides et les chimiotrophes obtiennent leur énergie en oxydant des substances organiques.

Question 19

Comprendre le concept d’énergie libre, soit la capacité à faire un travail, i.e. à réagir.

Answer 19

L’énergie libre d’un composé combine sa quantité de chaleur emmagasinée ainsi que son degré de structure, la quantité d’entropie que ce composé peut gagner en réagissant

Question 20

Connaître le sens de la variation de l’énergie libre après une réaction.

Answer 20

Une réaction (bio)chimique n’est possible que si l’énergie libre d’un produit (en aval) est inférieure à celle du réactif (substrat, en amont).

Question 21

Quels sont les deux grands facteurs (ou variables) qui déterminent l’énergie libre d’un composé, soit sa capacité à réagir?

Answer 21

1) la nature intrinsèque des composés produits
2) les concentrations

Question 22

Quels sont les deux grands facteurs (ou variables) qui déterminent l’énergie libre standard d’un composé, soit sa capacité à réagir? OU Lors d’une réaction biochimique, la variation d’énergie libre (G) correspond à :

Answer 22

a) sa quantité de chaleur emmagasinée
b) son degré de « structure », i.e. la quantité d’entropie S (désordre)

Question 23

G = H - TS. Que représentent les lettres H et S dans cette équation?

Answer 23

H est l’enthalpie (chaleur) et S l’entropie (désordre).

Question 24

Nommez une caractéristique chimique qui détermine la quantité de chaleur (enthalpie) contenue dans une molécule, et donc qui détermine son énergie libre standard, soit sa capacité à réagir?

Answer 24

La valeur de G varie selon son degré de réduction/oxydation. Plus d’énergie moins d’oxygène, moins d’énergie plus d’oxygène.

Question 25

Sous quelle condition une réaction endergonique (ayant un G positif) peut-elle devenir probable (Température et concentration constantes) ?

Answer 25

La variation de l’énergie libre G ne s’applique pas que pour une seule réaction à la fois, mais aussi dans une séquence de réactions où les G sont additives.

Question 26

Qu’est-ce que la glycolyse? Résumé/Bilan de la réaction. Où?

Answer 26

Séquence de réactions qui métabolisent une molécule de glucose en deux molécules de pyruvate, de deux ATP et de deux NADH. C’est une série de 10 réactions s’effectuant dans le cytoplasme.