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Automne 2022 > Microbiologie Examen 2 > Flashcards

Microbiologie Examen 2 Flashcards

1
Q

% de recouvrement de l’eau sur la terre et % de l’eau salée vs eau douce

A
  1. 75%
  2. 97% eau salée
  3. 3% eau douce
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2
Q

Pourquoi il y a bcp de microorganismes dans l’eau? (4)

A
  • Plus grande stabilité de température dans l’eau que dans un milieu terrestre
  • Disponibilité permanente de l’eau
  • Présence de matière minérale (phototrophe et chimiolithotrophe)
  • Présence de composé organique (hétérotrophe)
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3
Q

Ce qui fait varier la distribution des microorganisme dans l’eau

A

Profondeur qui fait varier lumière et O2 dissous

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4
Q

Rôle des microorganismes dans les deux zones d’un plan d’eau et manière qu’ils changent le milieu

A

Zone euphotique : rôle = photosynthétique (phytoplancton nourriture pour zooplancton)
Zone benthique : rôle = décomposeurs (si m.o. trop élevé, O2 s’épuise = eutrophisation)

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5
Q

Stratification thermique 3 zone

A
  • Épilimnion : surface
  • Thermocline : ligne avec une grande variabilit. de température
  • Hypolimnion : au fond
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6
Q

Rôle brassage saisonnier

A

uniformiser l’O2 et les nutriments inorg. dans les différentes zones du lac

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7
Q

Marée rouge causée par quel organisme et impact

A

Dinoflagellé qui peuvent libérer des neurotoxines dans l’eau

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8
Q

Différentes pollution naturelles des cours d’eau et effets

A
  • Produits de l’érosion du sol –> augmente la turbidité et la dureté
  • M.O entrainée par ruissellement –> anoxie des plans d’eau
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9
Q

Étapes de l’effet sur les plan d’eau d’une surcharge naturelle en m.o. (7)

A
  1. multiplication rapides des décomposeurs
  2. trop de décomposition
  3. anoxie
  4. disparition des sp. aérobie
  5. tx de décomposition ralentit car milieu anaérobie
  6. prolifération de bact. anaérobique qui font de la fermentation (odeur désagréable)
  7. Lac se comble (eutrophisation)
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10
Q

Tests pour évaluer une surcharge en en m.o. dans un plan d’eau et explication de l’un d’eux

A
  • DBO5 : eau milieu + ensemencement e.coli –> mesure O2 au début –> mesure O2 après quelque jours –> diffé entre les deux qte d’O2 = RCA = m.o.
  • DCO
  • COT
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11
Q

impact de la pollution agricole sur les plans d’eau

A

emploi absusif d’engrais artificielles et chimiques –> eutrophisation artificielle

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12
Q

Étapes de l’eutrophisation artificielles (6)

A
  1. Lessivage des nitrates et phosphates
  2. Festin pour les autotrophes –> prolifération des algues et cyanobactéries
  3. Production imp. de m.o. par photosynthèse
  4. Festin décomposeurs –> épuisement de l’O2
  5. tx de décomposition diminue et m.o augmente (température augmente et qte d’O2 diminue)
  6. Lac se comble
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13
Q

Effet eutrophisation sur qualité de l’eau

A
  • Turbidité augmente
  • Goût et odeur désagréable
  • Eau opaque car abondance d’algues
  • Présence potentiel de cyanotoxines
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14
Q

Comment le milieux agricole peux réduire ses impacts néfastes (4)

A
  • Diminuer l’ajout d’engrais chimiques
  • Engrais verts
  • Ne pas laisser le sol à nue car favorise l’érosion et lessivage des minéraux
  • Garder une bande riveraine pour filtrer les pollulants
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15
Q

C’est quoi la pollution biologique et effets sur la qualité de l’eau

A
  • C’est quoi :Rejets d’eaux usées non traités
    Effets : - Forte teneur en m.o. –> eutrophisation
    - Microorganisme présents dans les intestins des
    homéothermes –> infections et épidémies
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16
Q

Usage de l’eau dans la société (3)

A
  • Usages domestiques (boire, se laver, …)
  • Agriculture
  • Activités industrielles
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17
Q

Considération à prendre lors du prélèvement d’eau d’un robinet

A

Laisser couler l’eau de 3 à 5 min avant de prendre l’échantillon

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18
Q

indicateurs contamination fécale : c’est quoi, servent à quoi, indicateur le plus courant

A
  • Micro. inoffensifs présent dans les intestins des homéothermes
  • Présence permet de suspecter la présence de pathogènes (salmonelle, shigelle, vibrio, …)
  • Indicateurs les plus courants : coliformes
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19
Q

Pourquoi les coliformes sont indicateurs de pollution fécale (3 raisons)

A
  • corélation entre pollution fécale et coliformes
  • Très résistants
  • Très présent
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20
Q

Description général coliformes

A
  • bacilles
  • Gram -
  • Capacité à fermenter le lactose
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21
Q

Différence gram + et gram -

A

Gram + : mauve, pas de membrane sur la paroi et paroi épaisse

Gram - : Rose, membrane sur la paroi et paroi peu épaisse don alcool passe au travers ce qui permet au 2e colorant de colorer la bact en rose

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22
Q

Catégorie de coliformes

A
  • Coliformes totaux : provient de fèce, du sol, de l’eau et de la m.o. végétal (température incubation = 35 degré)
  • Coliformes fécaux : proviennent uniquement de l’intestin des homéothermes (E.coli) (température incubation = 45 degré)
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23
Q

Technique d’analyse de l’eau pour trouver le nb de bact total dans l’échantillon et description de la technique et normes

A

Numération standard sur plaque (gélose versée) : donne le nb total de BHAA

Norme : doit être plus petit que 500 BHAA/ml pour que l’eau soit potable

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24
Q

Test d’analyse de l’eau pour rechercher les coliformes concernant la fermentation avec inconvénients (4) et avantages (1)

A
  • Fermentation en tube multiple avec bouillon lactosé composé de test de présomption (bouillon LT et VBB), de confirmation (gélose EMB) et de démonstration
  • Permet de trouver le NPP
  • Inconvénient : peu représentatif car petit volume d’éch. , longue durée de temps (5 à 7 jours), complexe, couteux
  • Avantages : utile lorsque la charge bact. est élevé car est contaminé avec m.o. car on fais des dilutions
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25
Q

Test d’analyse de l’eau pour rechercher les coliformes concernant la filtration avec inconvénients (3) et avantages (4)

A
  • Technique sur membrane filtrante : pose le filtre sur géloses m-endo (coli. totaux), M-FC-BCIG (coli. fécaux) et m. enterococcus (strep. fécaux)
  • Inconvénients : indiacteur mauvais si densité élevé à cause de la compétition sur gélose, peut utile qd il y a de la m.o. (bouche le filtre), pas utile qd présence de substances toxique qui peuvent inhiber la croissance bact.
    Avantages : simple, rapide (24h), volume important d’eau annalysée, peu couteux
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26
Q

Test de confirmations de coliformes (totaux, féacaux, strep.) et résultats si présence de coli

A
  • Totaux :
    Colilert (+) –> jaune
    Cytochrome oxydase (-) –> pas de coloration
    Frottis et observation : bacilles roses (gram -)
  • Fécaux :
    3 même teste que totaux
    Galerie API 20 E (annalatical profile index)
  • Streptocoques fécaux :
    SA amidon (-) –> foncée car pas d’hydrolyse d’amidon
    Catalase (-) –> pas de bulles
    Bea (+) –> noir
    Frottis et observation –> coques mauves (gram+)
27
Q

Test qualitatif recherche de coliformes

A
  • Test présence absence : bouillon avec inhibiteur pour les non coliormes –> si ça pousse eau = douteuse
28
Q

Objectifs traitements eau brute en eau potable (3)

A
  • Élimination des enteropathogènes (épidémies)
  • Élimination des microorganismes qui nuisent à la qualité de l’eau (algues, bact. sulufureuse)
  • Élimination des substances et microo. qui causent des obstructions des conduites (sels, bacté visqeuses et ferrugineuses)
29
Q

Étapes traitements eau brute en eau potable en ordre (6)

A
  1. Tamisage et sédimentation
  2. Coagulation
  3. Floculation
  4. Décantation
  5. Filtration
  6. Désinfection
30
Q

3 types de désinfection de l’eau potable avantages et désavantages

A
  1. Ozone :
    - Avantages : Ne persiste pas dans l’eau, pas cancérigène et pas mauvais ou gout
    - Désavantage : ne tue pas tt les microorganismes
  2. UV :
    - Avantages : Ne persiste pas dans l’eau, tue 100% virus et bact. et pas de produits cancérigènes
    - Désavantages : plus coûteux
  3. Chlore :
    - Avantages : grande disponibilité, faible $$, grande stabilité dans l’eau, efficace
    - Inconvénient : tue pas les virus, mauvais goût, peut former produits toxiques
31
Q

Objectifs traitement des eux usées (3)

A
  • Prévention contamination pathogènes (baignade, …)
  • Éviter contamination des cultures et élevages (fruit de mers concentre les microo.)
  • Pévenir l’anoxie en réduisant la m.o. des rejets pour ne pas causer de l’eutrophisation
32
Q

Étapes traitement des eaux usées (3) et lègère description

A
  1. Traitement primaire (physico-chimique)
  2. Traitement secondaire (biologique) –> boues activées, biofiltres, digestion anaérobie
  3. Traitement tertiaire (élimination complète de la m.o. et des nutriments inorg.)
33
Q

Atome qui constitue les acides nucléiques

A

C H O P N

34
Q

Composition et structure de l’ADN

A
  • Constituée de nucléotides qui sont eux même constitué d’une base azoté, d’un glucide et d’un phosphate
  • Structure bicaténaire (2 brins d’ADN antiparallèles)
35
Q

Complémentarité des bases azotés

A
  • Adénine (A) avec Thymine (T) ou Uracile (U) dans l’ARN
  • Guanine (G) avec Cytosine (C)
36
Q

Définition gène

A
  • Portion d’ADN sur un chromosome qui code pour la production régulée d’une chaine de polypeptide
  • Chaque gène possède une séquence de nucléotide distincte avec un début et une fin
37
Q

ARN (3 types) et fonctions

A
  • ARN transfert : transfert les acides aminés vers les ribosomes
  • ARN messager : transcrit un gène d’ADN
  • ARN ribosomal : molécule constitutive des ribosomes
38
Q

Différences ADN et ARN

A

ADN = 2 brin, ARN = 1 brin
Nucléotides identique mais le sucre change : ADN = désoxyribose, ARN = Ribose

39
Q

Caractéristiques (3) de la transcription de l’ARN messager

A
  1. ADN synthèse l’ARN
  2. Localisation : noyau
  3. Synthèse possible grâce aux enzymes, nucléotides d’ARN et à l’ATP
40
Q

Caractéristiques (3) de la traduction de l’ARN messager

A
  1. ARN messager synthèse polypeptides
  2. Localisation : ribosome
  3. Synthèse possible grâce à l’ATP et l’ARN de transfert
41
Q

Étapes générales de la synthèse de protéines (4)

A
  1. Transcription de l’ADN en ARN
  2. ARN prémessager –> maturation –> ARN méssager
  3. Traduction ARN messager en polypeptides
  4. Polypeptide –> protéine active
42
Q

Carctéristiques de plasmides bactériens ou de levures (7)

A
  • petit anneau d’ADN circulaire qui se réplique indépendament du chromosome bacté.
  • stable
  • présent un plusieurs exemplaire dans 1 cellule
  • petit nb de gène
  • pas nécessaire à la survie de la cellule, mais utile dans des conditions particuliaires (ex: défense contre antibiotique)
  • plusieurs sites d’actions endonucléases
  • facilité à entrer et à sortir des cellules
43
Q

Étapes de mise au point d’une bactérie recombiné

A
  1. Synthèse de l’ADN recombiné (mettre le gène voulu dans un plasmide)
  2. Infection d’une culture de cellules hôtes (placer le plasmide modifié dans une bacté avec des chocs thermiques)
  3. clonage des bactéries recombinées (qui ont intégré le plasmide)
44
Q

Définition enzyme de restriction et endroit qu’elles agissent

A

Enzyme qui coupe l’ADN sur des sites de restriction que l’on nomme palindrome (crispr)

45
Q

Outils pour transporter les gènes recombiner dans la cellule hôte et avantage (3)

A
  • Plasmide bactérien ou de levure : facile à isoler et manipuler
  • Virus ou bactériophage : se conservent longtemps
  • Chromosome bactérien artificielle (CBA) : utile pour transporter de long fragements
46
Q

Caractéristique des cellules hôtes (3)

A
  • Se multiplient rapidement sur des milieux simples
  • Inoffensifs
  • Stable génétiquement (pas bcp de mutations)
47
Q

Les cellules hôtes les plus utilisées

A
  1. Bactéries (e. coli, Bacillius subtilis)
  2. Levures
  3. Autres cellules eucaryotes
48
Q

Manières de vérifier si les bactéries s’étant cloné possède le gène recombiné et si elles l’exprime (2)

A
  1. Clonage à l’aide d’une sonde marquée (n’indique pas si les colonies produisent la substances)
  2. Clonage à l’aide d’anticorps marqués (indique quelle bactéries sont capables de produire la bonne substance)
49
Q

Fonctionnement Cripr Cas9 (3 étapes)

A
  1. Bactéries possède enzymes pour découper une partie du génome d’un bactériophage pour ensuite mieux se défendre contre celui-ci (cas9)
  2. On programme cette enzyme en ajoutant les bon nucléotides pour qu’elle découpe le gène voulue
  3. Après avoir découper le gène, Cas9 remplace celui-ci avec le gène voulu
50
Q

Utilités Crispr Cas9 (3)

A
  • Couper puis remplacer un gène pour savoir à qui il servait
  • Remplacer des gènes qui causent des maladies
  • Utilisation environnemental pour que des mircroo. soit capable de métaboliser des polluants
51
Q

Conditions de croissance des microo. (4)

A
  1. Disponibilité en eau libre
  2. Température idéale
  3. pH idéale
  4. Présence ou absence d’O2
52
Q

Type de bactérie selon température et où sont les pathogènes dans ceux-ci (3)

A
  1. psychrophile : croissance entre -10 et 30 °C
  2. Mésophile : croissance entre 20 et 55 °C
  3. Thermophile : croissance entre 50 et 98 °C
    - Les pathogènes sont mésophiles et ils on une corissance entre 30 et 40 °C
53
Q

Type de bactérie selon le pH et comment sont la plupart des bacté

A
  • Acidophile
  • Neutrophile
  • Alcalophile
  • La plupart des bactéries sont neutro ou alcalophile
54
Q

Type de bactérie selon la présence en O2 (4)

A
  • Aérobie obligatoire
  • Aérobie facultatif (aime plus le milieux aérobie)
  • Anaérobie aérotolérant (aime autant le milieux aérobie que anaérobie)
  • Anaérobie strict
55
Q

Description lyophilisation (but, technique, avantages)

A
  • But : enlever l’eau libre
  • Technique : surgélation (abaissement rapide de la température) suivi d’une évaporation sous-vide
  • Avantages : conservation volume, aspect et propriété du produit
56
Q

Description confisage/salage (but, technique)

A
  • But : retirer l’eau libre
  • Technique : ajout de sucre ou sel ce qui fait perdre l’eau du produit par osmose
57
Q

Description congélation (but, technique, inconvénients)

A
  • But : baisser la température pour baisser le métabolisme des micro. ce qui baisse le croissance/ repro et donc la dégradation des produits (NE TUE PAS LES MICROO.)
  • Technique : Abaissement lent de la T°C ce qui cause l’éclatement des cellules
  • Inconvénients : altère saveur, texture
58
Q

Description surgélation (but, technique, avantages)

A

But : baisser la température pour baisser le métabolisme des micro. ce qui baisse le croissance/ repro et donc la dégradation des produits (NE TUE PAS LES MICROO.)
- Technique : Abaissement rapide de la T°C ce qui ne cause pas l’éclatement des cellules
- Avantages : pas de dégradation des qualités organoleptiques

59
Q

Description pasteurisation (but, technique)

A
  • But : augmenter température pour dénaturer les protéines ce qui tue les microo. (environ 70 °C)
  • Technique : réchauffer l’aliment puis le refroidir rapidement
60
Q

Description stérilisation (but, avantages)

A
  • But : augmenter température pour dénaturer les protéines ce qui tue les microo. (environ 100 °C)
  • Avantages : tue tout les microorganismes
61
Q

Description fermentation (but, avantages)

A
  • But : en absence d’O2 les bacté. font de la fermentation ce qui acidifie le milieux ce qui inhibe la croissance
  • Avantages : Présence de microo. vivants font de la compétition pour le substrat aux autres microo.
62
Q

Description appertisation (but, technique, désavantage)

A
  • But : tue/inhibe la croissance des bacté. aérobie
  • Technique : mettre les aliments dans récipients étanche à l’air puis les réchauffer pour tuer les pathogènes
  • Désavantage : dégradation des qualités organoleptiques
63
Q

Description agents de conservation (but, risques)

A
  • But : inhiber la division cellulaire
  • Risques : sanitaires, effets neurologiques/cancérigènes, effet synergique de plusieurs agents de conservation ensemble non étudiés

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