Microbiologie alimentaire, de l'environnement et industrielle Flashcards
Quelles sont les deux types de fermentation?
Mésophile 20-30 degrés celsius
Thermophile 40-50 degrés celsius
Étapes de la fermentation ?
- Autour de 20-30 degrés celsius : anaérobiose, levures font de l’éthanol + CO2 (à partir de sucres, surtout pectine)
- Aérobiose par brassage tue les levures. Température augmente, éthanol augmente ce qui est limitant pour les levures = Bactéries lactiques transforment éthanol en acide lactique.
- Température se stabilise, Bactéries acétiques prennent le dessus: éthanol se transforme en acétate
* Aération = homogénéisation de la T et apport en O2
Probiotiques ?
Microorganismes bénifiques pour l’hôte: immuno-modulation. Surtout bactéries lactiques
Altération des aliments par les microorganismes ? Lesquels?
Listeria moncytogenes : psychrophile : charcuteries, produits laitiers
Staphyloccocus aureus: halophile : produits salés crus , porteurs sains
Clostridium botulinum: spores
Contrôle qualité des aliments ? Comment?
Selon aliments on cherche différents microorganismes pathogènes
Microorganismes induisant la croissance des plantes : deux types de groupes selon intéractions avec plantes : lesquels?
- Microorganismes nodulaires
2. Microorganismes libres
Comment les microorganismes symbiotiques des plantes ont une relation de mutualisme avec celles-ci (3)?
- Améliore la croissance (Rhizobia)
- bactéries fixatrices d’azote : Azobacter, Azospirillum, Klebsiella
- Synthétiser des composés particuliers pour les plantes
- Faciliter l’absorption de certains nutriments (P, N)
- Protéger plantes contre maladies
Substances carbonées
Plante —-) Bactérie
(—-
Substances azotés
Que sont les nodules apparaissant sur certaines plantes vivant en symbiose avec certains microorganismes?
Petites boursouflures sur racines
Particularité de la microbiote racinaire ?
2e génome de la plante !
Comment lutter contre les pathogènes des plantes?
Cuivre : mais toxique en forte quantité huiles Bicarbonate de potassium silicate de potassium Soufre Bactéricide + fongicide (* Attention, dissémination dans l'environnement et résistance aux antibiotiques pour les bactéries possible)
Donner un exemple de contrôle microbien
Utiliser des microorganismes pour contrôler les pathogènes des plantes, comme:
Trichoderma , un champignon biofongicide qui croisse vite en culture
Mécanismes de protection du trichoderma (2) ?
Mycoparasite
1. Peut infecter d’autres champignons en perçant la paroi jusqu’au cytoplasme
- Certaines souches peuvent produire un antibiotique (gliotoxine) qui inhibe la croissance de bactéries (Rhizoctonia solani)
3 types de procédés de dépollution des sols?
- Physico-chimiques
- Thermiques
- Biologiques (microorganismes ou plantes)
Par quels procédés les dépolluants biologiques dépolluent? (2)
- procédés anaérobies
2. procédés aérobies
4 méthodes de dépollution pour les bactéries dépolluantes?
- Adsorption ( métaboliser des composés)
- Transformation ( dégradents substrats via enzymes en molécules moins nocives
- Dégradation
- Minéralisation
Principales bactéries dépolluantes?
Nitrates: Comamonas, hyphomicrobium
Phosphates: Acinetobacter, moraxella
Pesticides: Enterobacter
Hydrocarbures lourds: Bacillus, Pseudomonas, Xanthomonas
Hydrocarbures légers: Acinobacter, bacillus, Pseudomonas
Métaux lourds: Chlorella, Rhizopus, saccharomuces
Qu’est-ce que la Phytorémédiation? Donner les 3 étapes.
Aptitudes des plantes à :
- Absorber polluants et transformer en composés - toxiques (PHYTO- dégradation)
- accumuler en vue de l’extraction des polluants (PHYTO- extraction)
- immobiliser les polluants quand racines asociées à additifs pouvant absorber ou fixer les métaux lourds (PHYTO-stabilisation)
Nouvelle approche de dépollution?
Combiner la phytorémédiation avec la biodégradation (par ajout de Bactéries favorisant la pousse de plantes ou Bactéries dépolluantes dans les sols)
Comment se fait la biodégradation des hydrocarbures?
Par microorganismes hydrocarbonoclastes
Par transfert de substrats à la cellules : utilisation des hydrocarbures par les bactéries comme source de carbones en formant des micelles. Production de surfactants
Intéraction entre plusieurs microorganismes via 4 Phases? # interactions syntrophiques.
- Hydrolyse microorganismes fermentaires
- Acidogenèse Bactéries fermentaires acidogènes
- Acétogenèse Bactéries fermentaires acétogènes
- Méthanogenèse Bactéries méthanogènes (surtout archées : Methanobacterium et methanosarcina) ou Méthanobacillus, Mthanococcus
1 Type d’intéractions syntrophiques dans les 4 phases?
- Bactéries acétogènes font de l’acétate, mais devient facteur limitant pour les acétogènes, donc les bactéries méthanogènes s’en sert pour former méthane !
3 Applications plus ou moins précises pour les microorganismes dans le secteur industriel ?
- industrie pharmaceutique
- certaines bactéries extrêmophiles –) avantages exploitables
- Virus et bactéries pour lutter contre pathogènes
Extraction des métaux ? Comment?
Cupribidus metallidurans
or solube en or insoluble
Identification de nouvelles molécules ?
Surtout microorganismes de la mer, molécules antimicrobiennes, anticancéreuses, anti-inflammatoire, cosmétologie.
Métabolomique: études des métabolites produits par microorgansimes (plupart difficiles à identifier)
4 types de molécules antimicrobiennes produites par microorganismes ?
- Alcaloïdes
- Polycétides
- Peptides antimicrobiens non-ribosomaux
- bactérocines
3 types de mécanismes identifiés pour les molécules antivirales qui ont des effets contre VIH, Influenza, Mosaïque du tabac, Herpes, Enterovirus?
- Inhibition de la topoisomérase
- Inhibition de la fusion entre envelippe viral et endosome
- Inhibition de la transcription
**Mais coute cher…
Comment on test l’efficacité des molécules anticancéreuses et anti-inflammatoires, respectivement?
- Par activité antiproliférative contre cellules de mélanome humain
- Par capacité à inhiber la libération du facteur de nécrose tumoral alpha (TNFa)
Bactéries marines et biotechnologies ? Exemples?
bactéries en biofilms (awn ils ont froid) et certains produisent des bio-polymères = propriétés pour l’industrie
Caulobacter Crescentus : Colle forte pour chirurgie peut-être?
Quels microorganismes SURTOUT produisent des enzymes bactériennes ?
Extrêmophiles
ex: Polymérases pour les réactions de PCR, Nucléase H
types de production par microorganismes efficaces pour le secteur industriel?
- Production de solutés ( ectoïne-halomonas elongata)
- Substances protectrices des UV pour la peau
- Substances pour stimulation des défenses immunitaires
- Production de biocarburants (algues halophiles Dunaliella)
- Biopuces en informatique ( Halobacter iaceae)
- Production gaz naturel –) Méthane – archées Méthanobacterium formicicum, méthanobacter thermautotrophicus) et quelques bactéries
Nouvelles technologies
code binaire via longueurs d’ondes actives, inactives bactériorhodopsine (proteine conversion de l’énergie lumineuse en énergie chimique)
Thérapie phagique en gros?
Utilisation des phages lytiques comme moyen de lutte contre phatogènes
Puisque antibiotiques deviennent dangereux (résistance)
FÉLIX D’HÉRELLE
thérapie phagique oublié après Alexander Fleming et sa découverte de la pénicilline
