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Introduction pharmacologique > Microbiologie > Flashcards

Microbiologie Flashcards

1
Q

Quelles sont les grandes catégories de microorganismes d’importance médicale?

A
  1. Bactéries
  2. Champignons
  3. Parasites
  4. Virus
  5. Prions (protéine qui peut causer des maladies)
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Q

Quelle est la structure, le mode de reproduction, la paroi et la relation avec l’hôte des bactéries?

A

-Structure : unicellulaire
-Reproduction : fission binaire (une cellule qui crée une invagination qui se sépare)
->Pour tous les organismes unicellulaires (sauf virus)
-Paroi : peptidoglycans
-Relation avec l’hôte : free-living (intracellulaire facultatif ou obligatoire)

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3
Q

Quelle est la structure, le mode de reproduction, la paroi et la relation avec l’hôte des champignons?

A

-Structure : unicellulaire vs pluricellulaire
-Fission binaire (lorsque c’est une cellule) vs reproductions sexuée
-Paroi : parois chitine (c’est souvent des cibles liés au métabolisme de la chitine qui sont utilisées pour le traitement)
-Relation avec l’hôte : free-living (intracellulaire facultatif)

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4
Q

Quelle est la structure, le mode de reproduction, la paroi et la relation avec l’hôte des parasites?

A

-Structure : unicellulaire vs pluricellulaire
-Reproduction : fission binaire vs reproduction sexuée
-Paroi : complexité variable jusqu’à petits animaux
-Relation avec l’hôte : free living

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5
Q

Quelle est la structure, le mode de reproduction, la paroi et la relation avec l’hôte des virus?

A

-Structure : acellulaire (ce n’est pas une cellule->a une structure, mais ne possède pas le matériel génétique pour se reproduire, besoin de cellules pour agir)
-Reproduction : réplication via machinerie génétique de l’hôte
-Paroi : capside* +/- enveloppé
*Coque protéique qui entoure le matériel génétique d’un virus
-Relation avec l’hôte : intracellulaire obligatoire

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6
Q

Quel champignon se retrouve dans l’environnement et peut causer des infections?

A

Aspergillus (champignon filamenteux)

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7
Q

Qu’est-ce qu’un amibe?

A

C’est un parasite

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8
Q

Qu’est-ce qu’un prion?

A

Protéine qui entraîne une réaction en chaîne dans le cerveau lorsqu’elle se déforme (le cerveau de déforme, des trous se forment, la maladie progresse et les gens décèdent)

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9
Q

Qu’est-ce que l’interaction hôte-pathogène “commensale”?

A

Pas de dommage ni de bénéfice à l’hôte ou à l’agent infectieux (la bactérie ne prend rien dans notre corps -auto-suffisante- et on ne lui prend rien)

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10
Q

Qu’est-ce que l’interaction hôte-pathogène “saprophyte”?

A

Bénéfice pour l’agent infectieux sans entraîner de dommage pour l’hôte (l’agent infectieux en profites, ex. : prend du sucre de notre alimentation, mais ne cause pas de dommage ni de symptôme)

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11
Q

Qu’est-ce que l’interaction hôte-pathogène “parasite”?

A

Avantage pour l’agent infectieux et entraîne des dommages pour l’hôte (l’agent infectieux endommage son hôte->symptômes)
*À ne pas confondre avec le groupe “parasites”->fonctionne pour bactérie, champignon, virus, parasite

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12
Q

Qu’est-ce que l’interaction hôte-pathogène “symbiose”?

A

Avantage pour l’agent infectieux et l’hôte (l’un profite de l’autre et vice-versa, ex. : la bactérie se nourrit du sucre et donne des facteurs de coagulation en échange)

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13
Q

Qu’est-ce qu’un microorganisme colonisant?

A

Microorganisme vivant sur une surface interne ou externe du corps (ex. : peau, bouche, organes génitaux externes)
*Le foie, le coeur, etc. sont stériles donc on n’y retrouve pas de bactéries sauf si infections

Commensal>saprophyte>symbiose

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14
Q

Qu’est-ce qu’un microorganisme pathogène?

A

-Dommage pour l’hôte = parasite (relation parasitaire, dépend des facteurs de l’hôte et de celui qui infecte)
-Pathogène obligatoire (infection de tous les hôtes, chaque fois qu’on les trouve->elles sont la cause des infections)
-Pathogène opportuniste (infection seulement si hôte immunodéprimé->ne cause pas d’infection lorsqu’on les trouve si le système immunitaire est normal)

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14
Q

Pourquoi est-ce que les bactéries existent?

A

-Carnivores : essentielles à la désintégration les tissus morts
-Autre utilité : industrielle (ex. : décontamination fuite toxique, yogourt)

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15
Q

Pourquoi est-ce que les champignons existent?

A

-Végétariens : dégradations des matières végétales
-Alimentation humaine : bière, pain, formages

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16
Q

Qu’est-ce qui influence la virulence?

A

-Environnement (ex. : bactérie de la peau ou de l’intestin dans la circulation sanguine)
-Hôte infecté (immunité->la capacité de l’individu à répondre à l’infection de la bactérie)
-Microorganisme->facteurs de virulence :
—Destruction des tissus de l’hôte
—Évasion des défenses de l’hôte, destruction des tissus, séquestration dans site inaccessible pour système immunitaire
—Sur-stimulation du système immunitaire

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17
Q

Quelles sont les quatre grandes modalités diagnostiques en microbiologie?

A
  1. Examen direct (ex. : coloration de Gram)
  2. Culture
  3. Immunodiagnostic (permet de voir comment le corps réagi face à un microorganisme, ex. : développement d’anticorps contre la maladie)
    -ELISA
    -Agglutination
  4. Dx moléculaire (parfois les patients n’ont pas assez d’anticorps, donc on prélève du tissu ou du sang, on amplifie le matériel génétique du microorganisme pour voir de quoi il s’agit, souvent par PCR)
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18
Q

Qu’est-ce qu’un antibiogramme?

A

On prend les bactéries, les étale sur une gélose (substrat pour la culture des bactéries) et on met des échantillons différents d’antibiotiques pour les tester

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19
Q

Qu’est-ce qu’un antigène?

A

C’est une composante qui se retrouve à la surface d’un microorganisme

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20
Q

Qu’est-ce qu’un anticorps?

A

C’est une réponse immune de l’hôte à l’antigène

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21
Q

Quelles sont les classes de champignons?

A

-Levures (Candida, Cryptococcus, Malassezia)->plus fréquent
-Dimorphes (peuvent prendre la forme de levures et filamenteuses selon les circonstances)
-Filamenteux (enchevauchement de plantes microscopiques) :
—Hyalins (Aspergillus, dermatophytes, mucorales)
—Dématiés (champignons noirs)

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22
Q

Quelles sont les classes d’antifongiques?

A

-Azoles
-Allylamines (terbinafine)
-Echinocandins (caspofongine, anidulafongine, micafongine)
-Polyènes (nyastin, amphotéricine B)
-5-fluorocytosine (5-FC)
-Griséofulvine
-Cyclopirox

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23
Q

Quelles sont les types d’antifongiques de la classe des azoles?

A

-Clotrimazole (topique)
-Kétoconazole (po ou topique)
-Fluconazole (po ou IV)
-Itraconazole (po ou IV)
-Voriconazole (po ou IV)
-Posaconazole (po ou IV)

*Plus l’infection est grave, plus on a tendance à aller vers des intra-veineux

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24
Q

Qu’est-ce que la levure Candida spp.?

A

-Unicellulaire
-Plus gros qu’une bactérie (1-2 microns vs 5-8 microns)
-Ovale ou ronde
-Réplication par bourgeonnement
-Colonise la peau, muqueuses, tube GI humain
->Les levures adorent les environnements humides (surplus de poids->plis cutanés, les gens qui suent bcp ont tendance à avoir plus de levures)
-C. albicans (celui qu’on retrouve le plus), C. krusei, C. glabrata

25
Q

Quels antifongiques sont bons pour traiter les infections à levure?

A

Tous! (+/- terbinafine, +/- échinocandins)

Presque tous les antifongiques sont bons pour traiter les infections à levures (options nombreuses, souvent on donne ce qui est le plus simple->par la bouche si c’est nécessaire ou topique, le fluconazole est souvent celui qui est le plus donné en raison de ses faibles interactions)

26
Q

Qu’est-ce que le muguet?

A

Infection à levures au niveau des muqueuses de la bouche->Candidose oropharyngée

27
Q

Qu’est-ce que la candidose oropharyngée?

A

-Muguet (amas de levures)
-Douleur buccale +/- lors d’avaler
-Pseudomembranes blanches dans la bouche +/- érythème sous-jacent
-Associée à la prise d’antibiotiques (si on tue des bactéries, l’équilibre est perdu dans la flore et les levures se multiplient en grande quantité) OU immunosuppression

*Les corticostéroïdes inhalés peuvent affecter le système immunitaire au niveau de la bouche et prédisposent à la candidose oropharyngée (c’est pour cela qu’on dit aux gens de se rincer la bouche après avoir pris leurs pompes)

En résumé :
-Atteinte muqueuse orolabiale
-Plaques blanchâtres ou rougeurs peuvent être absentes
-Généralement facteur prédisposant (antibiotique, corticostéroïdes inhalés, immunosupression), MAIS peut être le premier symptôme d’une maladie non diagnostiquée! *Si on n”est pas capable de trouver une raison évident->médecin!
-Attention! Imitateurs! Cas sévères!

28
Q

Qu’est-ce que l’Atripla?

A

C’est une trithérapie contre le VIH. Si le patient n’a pas de cause évidente, il est possible qu’il y ait un déficit immunitaire sous-jacent
*Il faut se demande si le patient prend son traitement et si le virus est résistantQU

29
Q

Qu’est-ce qui peut causer l’immunosuppression?

A

-VIH
-Rx immunosuppresseurs (corticostéroïdes, inhibiteurs calcineurine, anti-TNF alpha, chimiothérapie
*Les infections sont plus sévères, plus extensives et plus résistantes au traitement (plus le système est faible, plus il y a de risque que l’infection soit sévère)

30
Q

Qu’est-ce que le “denture sore” (candidose oropharyngée)?

A

En dessous des dentiers, il y a beaucoup d’humidité et il n’y a pas l’action mécanique de la langue->parfait pour les levures
->Douleur, rougeur, plaque blanchâtre (pseudodomembranes) sous dentier

31
Q

Qu’est-ce que la chéilite angulaire ou perlèche (candidose oropharyngée)?

A

Rougeur aux coins de la bouche, le plus souvent des deux côtés
->Erythème + sécheresse et craquelures commissures labiales (coins bouche)

32
Q

Quels sont les immitateurs de la candidose oropharyngée?

A

-Herpes orolabial (virus qui cause souvent des vésicules au niveau des coins de la bouche, mais qui ne sont pas la perlèche)
-Pharyngite streptocoque

33
Q

Quels sont les traitements de la candidose oropharyngée?

A

Topique :
-Azoles (Clotrimazole)
-Polyènes :
—Nyastin rince-bouche (LE PLUS UTILISÉ, gargarisation 4x/jour pendant 1 min)
—Amphotéricine B (magistrale, rare)

Systémique :
-Po : Fluconazole (voriconazole, posaconazole) + FRÉQUENT
-IV (rare) : Amphotéricine B, caspofongine

*On préfère les traitements qui ne sont pas absorbés par le corps, donc souvent on commence par les traitements topiques (moins de risques d’avoir des effets secondaires)

34
Q

Qu’est-ce que la vulvovaginite Candida?

A

-Femme post-pubère (il faut le bon équilibre hormonal pour avoir une vulvovaginite
-Symptômes : Érythème, douleur +/- écoulement blanchâtre
-Mêmes facteurs de risques que la candidose oropharyngée SAUF récidives fréquences sans explication = commun avec vulvovaginite (au niveau de la bouche c’est rare qu’on fait des infections à répétition)
-Homme = balanite

35
Q

Que faire une personne a un épisode de vuulvovaginite Candida?

A

-Si premier épisode->référer au médecin (50% autre diagnostic)
-Si épisodes semblables dans le passé->offrir traitement en vente libre
*Si la personne est certaine que ses symptômes sont exactement les mêmes (cependant, ça peut aussi être une gonorrhée ou une chlamydia)

36
Q

Pourquoi faut-il référer une personne en cas de premier épisode de vulvovaginite Candida?

A

Infectieux
-ITSS :
—Gonorrhée, chlamydia
—Herpes génital
—Vaginose bactérienne
-Endométrite/PID (infection au niveau de la paroi interne de l’utérus)
-Infection urinaire bactérienne

Non-infectieux :
-Allergiqie
-Eczéma

37
Q

Quels sont les traitements de vulvovaginite Candida en cas d’épisodes subséquents?

A

Traitements topiques :
-Clotrimazole (Canesten) +FRÉQUENT
1 jr vs 3 jr vs 7 jr (efficacité équivalente)->1 jr peu recommandé sauf si infection légère
-Amphotéricine B (rare)
-Acide borique, 5-FC (rare)

Traitements systémiques (po) :
-Fluconazole 1 dose 150 mg (si infection plus sévère)
-Autres traitements idem candidose oropharyngée (rare)

*Quand le champignon meurt, ça crée des inconforts (c’est normal, mais si ça dure trop longtemps ça peut être une résistance ou un mauvais diagnostic)

38
Q

Quelle précaution faut-il prendre avec les azolés (ex. : clotrimazole, fluconazole)

A

Les azolés = tératogène (classe D) si administration haute dose et prologée
->150mg x 1 = OK
MAIS si autres posologies : demander si risques d’être enceinte

*On favorise un traitement topique->clotrimazole

39
Q

Qu’est-ce qu’une onychomycose?

A

C’est une infection fongique de l’ongle et/ou du lit de l’ongle

40
Q

Quelles sont les infections systémiques du Candida?

A

-Sang (+)
-Coeur (+)
-Urine (+)
-Oeil
-Cerveau
-Os/articulations

Traitement : IV prolongé +/- chirurgie

*Le plus grand risque est la résistance (ex. : résistance au fluconazole) si le traitement est pris fréquemment (traitement le plus court et moins souvent possible, bonne dose)

41
Q

Quels sont les traitements de la candidose systémique?

A

-Azoles
-Echinocandins
-Polyènes :
—Nyastin (topique)
—Amphotéricine B
-5-fluorocytosine (5-FC)->combinaison seulement

42
Q

Qu’est-ce que la Candida en résumé?

A

-Colonise peau, intestin et muqueuses
-Infection opportuniste associée avec antibiotiques, immunosupression
-Infections aux endroits humides :
—Muqueuses buccale (+/- oesophage) et génitale
—Peau (plis)
-Ongles
-Infection sites profonds

43
Q

Quels sont les normes des traitements de la Candida en résumé?

A

Traitement topique ventre libre OK :
-Candidose oropharyngée ou vulvovaginite non compliquée (récidive) chez les gens généralement en bonne santé

Toujours référer au médecin :
-Immunosupprimés
-Grossesse
-Symptômes sévères
-Difficulté à s’alimenter, uriner

44
Q

Que sont les levures Cryptococcus et comment se traitent-elles?

A

-Levure encapsulée
-Environnement (oiseaux, végétaux), cosmopolite
-Inhalée->pneumonie->méningoencéphalie
-Autres : infections cutanée/urinaire

-Traiment : Fluconazole OU amphotéricine B +/- 5-FC

45
Q

Que sont les levures Malassezia?

A

-Levure humaine et animale
-Lipophile (aime le gras->c’est pour cela qu’elles vivent particulièrement où il y a des glandes sébacées)
-Infections cutanées
-Pityriasis versicolor :
—Hyper ou hypopigmentation cutanée (fait pâlir la peau foncée et foncie la peau claire)
—Tronc>membres
-Autres infections : dermatite séborrhéique, pellicules, fungémie rare (intralipide)

46
Q

Quel est le traitement du Pityriasis versicolor (Malassezia)?

A

Topique :
-Selenium sulfide 2.5% (ou Selsun Blue 1%)
-Ketoconazole (Nizoral)
-Clotrimazole 1%

Systémique (rare) :
-Fluconazole
-Itraconazole

47
Q

Que sont les champignons filamenteux?

A

-Pluricellulaires
-Hyphes
-Organes de fructification
-Aspect duveteux
-Ex. : Penicillium roquefort (non-pathogène)
-Ex. : Apergillus spp., Fusarium spp.., Scedosporium spp. (pathogènes)

*Ce type d’infections est moins commun

48
Q

Quelles sont les différences entre les levures et les champignons filamenteux?

A

Levures :
-Unicellulaire
-Bourgeonnement
-Colonisant (humain>environnement sauf Cryptococcus)
-Infections immunosupprimés et immunocompétents
-Infections superficielles ++

Filamenteux :
-Pluricellulaire
-Hyphes et organes conidides (spores)
-Colonisant (environnement>humain)->ubiquitaire dans l’environnement (eau, sol, végétaux)
-Infection immunosupprimé»immunocompétents
-Infections profondes ++
*C’est rare que les champignons filamenteux vivent sur la peau sans causer d’infections, mais ce n’est pas la même chose pour les levures

49
Q

Quelles sont les espèces de champignons filamenteux pathogènes les plus fréquentes?

A

-Aspergillus fumigatus->aspergillose invasve
-Dermatophytes (peau, cheveux, ongles)->pied d’athlète, onychomycose

50
Q

Qu’est-ce que la physiopathologie de l’aspergillose invasive (aspergillus fumigatus)?

A

Inhalation de spores de l’environnement. Comme on a un bon système immunitaire, il ne se produit rien. Si le système immunitaire est faible, les spores peuvent entrer à travers les alvéoles des poumons, se nourrir de notre sang et croître
*Pathogène opportuniste, car cette situation se produit chez les immunosupprimés

51
Q

Quels sont les facteurs de risque d’aspergillose invasive aiguë?

A

-Immunosuppression prolongée et profonde (neutropénie, chimiothérapie, corticostéroïdes)
-Environnement riche en conidies d’Aspergillus
-Rénovation, agriculture (ces gens sont exposés à des quantités de poussières plus importantes->champignons)
*Mortalité 50-70%

52
Q

Quel est le diagnostic de l’Aspergillose invasive?

A

-Symptômes respiratoires (toux, dyspnée, douleur thoracique, hémoptysie)
-Fièvre
-Lésions cutanées/autres organes
-Culture liquide/tissus infectés
-Tests antigéniques sanguins ou sur liquide bronchique (galactomannan)

53
Q

Comment se caractérise d’autopsie du poumon aspergillose?

A

Le champignon envahie les vaisseaux sanguins et les bloquent, donc il n’y a pas de circulation. Le pronostic de cette infection est mauvais (peu de chance de s’en sortir). L’atteinte pulmonaire est la plus importante

54
Q

Quelles sont les autres formes d’Aspergillose?

A

-Poumons :
—Aspergillose invasive chronique
—Fungus ball
—ABPA (Aspergillus Broncho-Pulmonaire Allergique)
-Extra-pulmonaire : Tous les organes!

55
Q

Quel est le traitement de l’aspergillose?

A

-Débuter rapidement!
—Index de suspicion bas
—Suivi marqueur antigénique (galactomannan)
-Diminuer immunosuppression si possible
-+/- chirurgie

56
Q

Quels sont les traitements pour l’Aspergillus?

A

-Intraconazole (+)
-Voriconazole (CHOIX #1)
-Posaconazole (+)
-Polyène (+)
-+/- Echinocandins
-5-FC
-Fluconazole (NE FONCTIONNE PAS)

DONC : 1er choix->Voriconazole, 2ème choix->Polyène (amphotéricine B)

57
Q

Comment se caractérise les champignons filamenteux Dermatophytes?

A

-Infection peau, poils, cheveux, ongles
-Infection via contact personne-à-personne, animaux (zoonoses) ou fomites (surfaces, objets)
-3 genres :
—Epidermophyton spp.
—Trichophyton spp.
—Microsporon spp.
*Pas besoin de retenir les genres

58
Q

Quelles sont les présentations cliniques des Dermatophytes?

A

Tinea = infection à dermatophytes
-Tinea capitis (au niveau de la tête)
-Tinea barbae (au niveau de la barbe, kérion->abcès stérile à dermatophytes)
-Tinea manum
-Tinea unguium (au niveau des ongles)
-Tinea crusis (au niveau du corps “teigne”)
-Tinea pedis (pied d’athlète)
-Tinea corporis
-Tinea crusis

*Sur les zones où il n’y a pas beaucoup de poils, ça fait des grandes plaques rouges

59
Q

Quel est le traitement des Dermatophytes?

A

-Allylamine (AGENT DE CHOIX pour traiter des dermatophytes) :
—Terbinafine (Lamisil)->topique ou po
-Azoles (dans une moindre mesure, car pas tjrs efficace) :
—Clotrimazole (topique, +fréquent)
—Kétoconazole (topique)
—Fluconazole (po)
—Itraconazole (po)
-Cyclopirox (Loprox, topique)
-Griséofulvine (po)

60
Q

Quelles sont les règles de base pour le traitement des dermatophytes?

A

Si peau ET non sévère (pas kérion, petite zone) :
-Traitement topique :
—Terbinafine 1% BID x 1 sem
—Clotrimazole 1% BID x 4 sem

Tous les autres (large zone/sévère, kérion, poils/cheveux, ongles) :
-Traitement systémique (po) :
—Terbinafine (azole parfois)

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