Maturation de l'ARNm Flashcards
Quel est le devenir/destin des transcrits primaires ARN des procaryotes et pourquoi est-ce ainsi?
L’ARNm ne nécessitent pas d’être maturé, car l’information des gènes est contigüe/continue
Quel est le devenir/destin des transcrits primaires ARN des eucaryotes et pourquoi est-ce ainsi?
Les ARN primaires (préARNm) doivent être maturés par des modifications en ARNm puisque l’information des gènes est morcelée/discontinue
(exons-introns)
Chez les procaryotes l’ADN bactérien est directement en contact avec quoi? Ou est l’ADN?
En contact avec le cytoplasme, car il est dans le cytoplasme
Chez les eucaryotes l’ADN est en contact avec quoi? Ou est l’ADN?
En contact avec le noyau, car dans le noyau
Chez les procaryotes où se fait la transcription, la maturation et où se fait la traduction?
PAS DE MATURATION
Les deux autres dans le cytoplasme
Chez les eucaryotes où se fait la transcription, la maturation et où se fait la traduction?
- La transcription et la maturation des ARN se
font dans le noyau. - La traduction se fait dans le cytoplasme
Vrai ou faux? Les préARNm doivent être maturés par
modifications en ARNm et transportés dans le cytoplasme pour la traduction en protéine
Vrai
Que veut dire « eucaryote »
‘’vrai noyau’
Que veut dire « procaryote »
‘avant le noyau’
Chez les procaryotes combien de protéines peuvent être codées par un ARNm
Plusieurs protéines différentes
peuvent être codées par un
ARNm polycistronique
Chez les procaryotes, comment appelle-t-on les ARNm pouvant coder pour plusieurs protéines
ARNm polycistronique
Qu’est ce que le concept d’opéron chez les procaryotes
Plusieurs gènes contrôlés par un seul promoteur en amont
Chez les eucaryotes combien de protéines peuvent être codées par un ARNm (après épissage)
1
1 ARNm donne en générale 1 protéine
Malgré le fait que chez les eucaryotes 1 ARNm, (après épissage) donne en générale 1 protéine y a t’il une façon de générer plusieurs isoformes d’une même protéine?
OUI! Plusieurs isoformes d’une même protéine peuvent
être obtenues à partir du Pré-ARNm s’il y a épissage alternatif
Chez les procaryotes l’information des gènes est _ et les ARNm _ être maturés
- contigüe
- ne doivent pas
Chez les eucaryotes l’information des gènes est _ et les ARNm _ être maturés
- discontinue
- doivent
Chez les eucaryotes quelles sont les 3 grandes étapes de la maturation du pré-ARNm,
1- Addition de la coiffe en 5’
2- Épissage des introns
3- Polyadénylation
(les étapes de ce processus sont détaillées dans le document sur la maturation)
Chez les eucaryotes, qu’est ce que la coiffe en 5’
La séquence codante
Chez les eucaryotes, quand est-ce que la queue poly-A est ajoutée?
Après la transcription
Les ARN des eucaryotes sont transcrits et maturés _ dans le noyau
simultanément
Au fur et à mesure que l’ARN polymérase synthétise le pré-ARNm le processus de maturation commence déjà pourquoi?
Pour économiser du temps
Outre son rôle dans la
transcription, qu’est ce que l’ARN polymérase fait d’important pour le processus de la maturation?
Elle recrute via sa queue hyperphosphorylée des
protéines impliquées dans la
maturation de l’ARN en voie de
synthèse (= co transcriptionnelle)
Les exons correspondent la pluspart du temps aux séquences dites _que l’on retrouve dans l’ARN messager après élimination des introns
- « codantes »
Se peut-il que parfois les exons contiennent des séquences non-codanres?
Oui! Souvent, les premiers exons et derniers exons, contiennent également des séquences non-codantes en 5’ et 3’, respectivement (appelées 5’ Untranslated (UTR) region et 3’ Untranslated region)
Qu’est ce que l’épissage
Un processus par lequel les séquences des introns sont excisées du pré-ARNm et les exons sont reliés entre eux pour donner naissance au ARNm mature
l’épissage du pré-ARNm donne naissance à
ARNm mature
Pour exciser un intro des _ sont nécessaires
séquences nucléotidiques spécifiques
Le site donneur est toujours du côté
5’ entre l’exon 1 et l’intron
Le site accepteur est toujours du côté
3’ entre l’intron et l’exon 2
Des séquences spécifiques identifient les jonctions 5’ et 3’ des introns et sont, elles,
reconnues par quoi?
Des petites ribonucléoprotéines nucléaires (snRNP= small nuclear ribonucleic particles)
Que font les petites ribonucléoprotéines nucléaires (snRNP= small nuclear ribonucleic particles) qui identifient les séquences spécifiques?
Elles assistent la coupure de l’ARN aux jonctions intron-exon et relient les exons entre eux de façon covalente
Les différentes séquences spécifiques sur le pré-ARN retrouvées ne sont pas à apprendre appart laquelle.
Savoir qu’il y a un A obligatoirement au milieu (4e nuclétide de la séquence de 3 nucléotides) du point de branchement d’un intron
Où retrouve-t-on le fameux A dans le point de branchement d’un intron
~30 nucléotides avant le début d’un exon (donc à 30 nucléotides de la fin de l’intron)
Mécanisme de l’épissage dans le doc
dans le doc
Les exons sont-ils des modules d’information (ex, codant des domaines) qui ont grandement contribué à l’évolution?
Oui
Quelles sont les deux manières qui ont permis à de nouvelles protéines d’apparaitre à travers l’évolution
- Duplication d’un exon à l’intérieur d’un même gène
2. Insertion d’un exon à l’intérieur d’un gène déjà existant
Quand se fait l’épissage du pré-ARNm par rapport à la transcription (avant/après/en même temps)?
En même temps (simultanément)
Combien de gènes ont été identifiés dans le génome humain
30000
Le nombre de gène dans le génome humain peut il expliqué la diversité des protines et des phénotypes
Pas vraiment, car nous n’avons pas vrm un nombre très différent de gènes q’un vers (21 000 gènes) ou une poule (23 000 gènes).
*Comme référence la levure a 6,000 gènes
Comment pouvons nous expliquer la diversité des protéines (d’où vient le fait qu’on a beaucoup plus de protéines que de gènes?)
Par l’épissage alternatif
tissu-spécifique
Qu’est ce que l’épissage alternatif
Le fait qu’un transcrit primaire peut être épissé différemment selon le type cellulaire et qui permet aux eucaryotes d’augmenter le potentiel
de codage de leur génome
Est-ce que beaucoup de gènes humains codent pour des pré-ARNm qui subissent un épissage alternatif?
Oui, la majorité! Environ 60% des gènes humains
On peut dire que la maturation des ARN permet de…?
Contrôler l’expression génique
Lors d’un épissage alternatif, on peut avoir _ ou _ de certains exons, produisant de cette manière _ qui seront traduits en _
- élimination
- inclusions
- différents ARNm
- protéines différentes
Qu’est ce qui peut faire varier les formes d’épissages alternatifs
le tissu
Qu’est ce que donne le fait que les tissus peuvent faire varier les formes d’épissages alternatifs
donne une diversité tissu-spécifique
ligne et boite
ligne et boite
ligne et boite
ligne et boite
ligne et boite
ligne et boite
Les exons peuvent coder pour quoi?
des domaines de protéines
L’épissage alternatif donne naissance à _ composées chacune de modules (domaines) _ et _
- des variantes de protéines (des protéines avec des domaines différents)
- identiques
- différents
Qu’est ce que la régulation positive de l’épissage (fait par quoi et mène à quoi)?
- Fait par un activateur de l’épissage
- Mène à l’exclusion d’un intron dans
l’ARNm mature du Tissu
Qu’est ce que la régulation négative de l’épissage (fait par quoi et mène à quoi)?
- Fait par un répresseur de l’épissage
- Mène à l’inclusion d’un intron dans l’ARNm mature du Tissu
Comment un répresseur de l’épissage agit-il?
C’est une protéine (un facteur) qui va bloquer la jonction intron et exon ainsi le ribosome ne verra pas ce site, car la séquence est masquée, c’est comme si ça n’existant pas ce site d’épissage
Comment un activateur de l’épissage agit-il?
Le facteur (protéine) met en évidence le site d’épissage
Les introns sont normalement _ par épissage mais certains introns peuvent se comporter comme des _ optionnels
- éliminés
- exons
Que veut-on dire quand on dit qu’un intron peut se comporter comme un exon optionnel
être présents dans
ARNm mature
Qu’arrive-t-il si un intron n’est pas éliminé pas épissage?
il va faire partie de l’ARNm et être traduit en protéine
Avant d’être exporté au noyau, les ARNm des eucaryotes doivent être…
maturés
Vrai ou faux? Seuls les ARNm maturés correctement peuvent sortir du noyau
Vrai
Quelle structure reconnaît et exporte seulement les ARNm
qui on terminé leur maturation
Le complexe de pores nucléaires
Comment le complexe de pores nucléaires reconnaît-il les ARNm qui on terminé leur maturation
Un ensemble de protéines signale que l’ARNm a bien subi une maturation
correcte et est prêt à l’exportation.
Quelles protéines sont inclues dans l’ensemble de protéines qui signalent que l’ARNm a bien subi une maturation
correcte et est prêt à l’exportation (après la maturation)
- La protéine de liaison à la poly A (PABP)
- La protéine de liaison à la coiffe (Cap-binding protein)
- Un complexe de protéines qui se lie à la jonction d’exons (EJC; Exon Jonction Complex) et qui se dépose après excision des introns
Quelle est l’étape principale pour la régulation de la plupart des gènes eucaryotes?
La transcription
